International Journal of Marine Science 2015, Vol.5, No.55: 1-9
5
Table 3 Pairwise genetic distance of 16S rRNA gene among different haplotypes of Penaeid shrimps
R
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
DQ 149968
-
1-Hap.
Ⅰ
0.000
-
2-Hap.
Ⅱ
0.005
0.005
-
3-Hap.
Ⅲ
0.008
0.008
0.003
-
4-Hap.
Ⅳ
0.003
0.003
0.008
0.010
-
5-Hap.
Ⅴ
0.003
0.003
0.008
0.010
0.005
-
6-Hap.
Ⅵ
0.008
0.008
0.013
0.010
0.010
0.010
-
7-Hap.
Ⅶ
0.010
0.010
0.016
0.013
0.013
0.013
0.008
-
8-Hap.
Ⅷ
0.016
0.016
0.021
0.018
0.018
0.018
0.013
0.010
-
9-Hap.
Ⅸ
0.029
0.029
0.034
0.032
0.032
0.032
0.021
0.024
0.013
-
10-Hap.
Ⅹ
0.029
0.029
0.034
0.032
0.032
0.032
0.021
0.018
0.018
0.005
-
11-Hap.
Ⅺ
0.005
0.005
0.010
0.013
0.008
0.008
0.008
0.010
0.010
0.024
0.024
-
12-Hap.
Ⅻ
0.082
0.082
0.087
0.090
0.079
0.084
0.090
0.093
0.099
0.115
0.115
0.087
-
13-Hap.
ⅩⅢ
0.079
0.079
0.085
0.088
0.076
0.082
0.088
0.091
0.097
0.112
0.112
0.085
0.003
-
14-Hap.
ⅪⅤ
0.084
0.084
0.090
0.093
0.087
0.087
0.093
0.093
0.099
0.114
0.114
0.090
0.099
0.096 -
15-Hap.
ⅩⅤ
0.078
0.078
0.084
0.087
0.081
0.081
0.087
0.087
0.093
0.109
0.109
0.084
0.096
0.093 0.010
-
16-Hap.
ⅩⅥ
0.072
0.072
0.078
0.081
0.075
0.075
0.081
0.081
0.087
0.103
0.103
0.078
0.090
0.087 0.010
0.010
-
17-Hap.
ⅩⅦ
0.087
0.087
0.093
0.096
0.090
0.090
0.096
0.096
0.102
0.118
0.118
0.093
0.102
0.099 0.003
0.008
0.013 -
18-Hap.
ⅩⅧ
0.081
0.081
0.087
0.090
0.084
0.084
0.090
0.090
0.096
0.112
0.112
0.087
0.096
0.093 0.003
0.008
0.008 0.005
-
19-Hap.
ⅩⅨ
0.197
0.197
0.201
0.204
0.200
0.200
0.208
0.212
0.219
0.239
0.239
0.204
0.211
0.211 0.200
0.200
0.186 0.203
0.196 -
Table 4 Mitochondrial DNA divergence between populations
Groups
Area
F
st
Nm
F. indicus
Baaboud –Alkhairat
0.10957
4.06
Baaboud-Wild
0.12459
3.51
Alkhairat- Wild
0.14817
2.87
P. monodon:
North area- South area
0.36585
0.87