CMB-2016v6n4 - page 9

Computational Molecular Biology 2016, Vol.6, No.4, 1-12
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Table 2 Summary of the protein distribution in some major subcellular locations in different protist species
Mt Nuc
Specie Total HLS LS Cyt Plasm mem non-m mem non-m Sec(%)
Alveolata; Apicomplexa
Babesia bigemina 5227 379 116 1452 341 119 997 244 1697 7.3
Babesia bovis 6268 730 178 1302 514 102 1015 71 2611 11.6
Cryptosporidium parvum 6388 426 142 1011 387 168 504 168 3952 6.7
Eimeria acervulina 6909 481 332 928 342 116 1249 125 2895 7.0
Eimeria brunetti 8720 805 515 848 325 155 1365 271 3766 9.2
Eimeria maxima 6132 420 264 883 303 124 1039 91 2686 6.8
Eimeria mitis 10072 986 682 879 317 217 1502 360 4289 9.8
Eimeria necatrix 8623 711 450 918 519 208 1762 221 3149 8.2
Eimeria praecox 7642 683 508 670 246 136 1005 258 3693 8.9
Eimeria tenella 9299 729 432 1185 482 174 2112 133 3543 7.8
Gregarina niphandrodes 6342 316 169 1816 400 67 1161 29 2348 5.0
Hammondia hammondi 8016 588 239 1123 764 179 1948 82 3024 7.3
Neospora caninum 10101 730 362 1505 963 194 2281 116 3697 7.2
Plasmodium berghei 15967 537 379 1173 404 754 2900 1024 8086 3.4
Plasmodium chabaudi 20341 840 440 1833 450 816 3651 1221 10472 4.1
Plasmodium chabaudi chabaudi 5539 507 144 467 176 229 562 594 3222 9.2
Plasmodium cynomolgi strain B 5713 324 92 632 320 129 611 417 3525 5.7
Plasmodium falciparum FCH/4 5762 206 99 440 179 246 590 605 3516 3.6
Plasmodium falciparum IGH-CR14 5035 220 116 448 167 214 516 472 3028 4.4
Plasmodium falciparum MaliPS096_E11 6301 271 130 452 228 281 781 651 3684 4.3
Plasmodium falciparum NF135/5.C10 6324 266 146 458 222 331 832 603 3600 4.2
Plasmodium falciparum Santa Lucia 6175 265 145 435 231 300 772 594 3584 4.3
Plasmodium falciparum Tanzania 6699 259 137 493 235 317 803 649 3990 3.9
Plasmodium falciparum UGT5.1 5904 234 125 461 201 265 694 601 3443 4.0
Plasmodium falciparum Vietnam Oak-Knoll 6218 270 129 447 204 288 751 609 3658 4.3
Plasmodium fragile 5683 357 110 717 383 140 662 328 3217 6.3
Plasmodium inui San Antonio 1 5828 345 95 485 332 124 636 394 3709 5.9
Plasmodium knowlesi 5682 453 124 586 343 144 621 301 3321 8.0
Plasmodium reichenowi 5744 283 148 460 297 347 557 525 3151 4.9
Plasmodium vinckei petteri 5206 429 114 432 156 186 528 508 3183 8.2
Plasmodium vivax Brazil I 6398 377 119 722 429 211 737 676 3495 5.9
Plasmodium vivax India VII 6588 380 115 717 451 193 726 701 3652 5.8
Plasmodium vivax Mauritania I 6297 388 108 680 428 204 732 676 3422 6.2
Plasmodium vivax North Korean 6616 375 121 739 446 205 759 695 3611 5.7
Plasmodium yoelii 17X 6833 397 153 489 201 305 662 1229 3725 5.8
Plasmodium yoelii yoelii 7911 289 174 610 140 296 1043 1297 3822 3.7
Theileria equi strain WA 5313 810 134 991 425 75 702 197 2486 15.2
Toxoplasma gondii FOU 10116 656 342 1395 799 215 2727 107 3765 6.5
Toxoplasma gondii GAB2-2007-GAL-DOM2 9135 620 265 1237 782 192 2392 101 3430 6.8
Toxoplasma gondii MAS 10005 644 342 1372 792 216 2655 105 3755 6.4
Toxoplasma gondii p89 9698 632 326 1307 791 220 2592 103 3611 6.5
Toxoplasma gondii RUB 10027 654 349 1391 804 225 2686 100 3691 6.5
Toxoplasma gondii VAND 9252 632 307 1242 800 212 2454 92 3379 6.8
Toxoplasma gondii VEG 7476 572 212 1003 740 170 1759 84 2782 7.7
Alveolata; Chromerida;
Chromera velia CCMP2878 29025 2469 713 6915 2399 305 6644 139 9554 8.5
Vitrella brassicaformis CCMP3155 23030 2437 559 4803 2289 316 5645 96 6692 10.6
Alveolata; Ciliophora