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分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1287
-
1296
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1287
-
1296
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1290
表
3 12
个
SSR
位点在
134
个水稻品种中的等位基因频率
Table 3 Frequency of alleles at 12 SSR loci in different types of 134 rice cultivars
标记
Locus
等位基因
Allele
等位基因频率
Frequency of alleles
标记
Locus
等位基因
Allele
等位基因频率
Frequency of alleles
籼稻
粳稻
总体
籼稻
粳稻
总体
Indica
Japonica
Total
Indica
Japonica
Total
RM297
1
0.072 6
0.100 0
0.074 6 RM336
1
0.016 3
-
0.015 0
2
0.197 6
0.100 0
0.190 3
2
0.386 2
0.100 0
0.364 7
3
0.088 7
-
0.082 1
3
0.008 1
0.050 0
0.011 3
4
0.056 5
0.050 0
0.056 0
4
0.138 2
0.400 0
0.157 9
5
0.121 0
0.300 0
0.134 3
5
0.374 0
0.400 0
0.375 9
6
0.463 7
0.450 0
0.462 7
6
0.061 0
0.050 0
0.060 2
RM71
1
0.104 3
0.050 0
0.100 0
7
0.016 3
-
0.015 0
2
0.082 6
-
0.076 0 RM72
1
0.036 6
0.200 0
0.048 9
3
0.134 8
0.050 0
0.128 0
2
0.264 2
0.150 0
0.255 6
4
0.134 8
0.100 0
0.132 0
3
0.028 5
-
0.026 3
5
0.543 5
0.800 0
0.564 0
4
0.231 7
0.250 0
0.233 1
RM85
1
0.919 4
0.100 0
0.858 2
5
0.439 0
0.400 0
0.436 1
2
0.064 5
0.100 0
0.067 2 RM219
1
0.080 6
-
0.074 6
3
0.004 0
0.800 0
0.063 4
2
0.116 9
0.200 0
0.123 1
4
0.012 1
-
0.011 2
3
0.048 4
-
0.044 8
RM5414 1
0.326 6
0.200 0
0.317 2
4
0.467 7
-
0.432 8
2
0.036 3
0.100 0
0.041 0
5
0.286 3
0.800 0
0.324 6
3
0.633 1
0.650 0
0.634 3 RM209
1
0.112 9
0.250 0
0.123 1
4
0.004 0
0.050 0
0.007 5
2
0.173 4
0.250 0
0.179 1
RM274
1
0.411 3
0.050 0
0.384 3
3
0.072 6
-
0.067 2
2
0.080 6
0.100 0
0.082 1
4
0.197 6
0.150 0
0.194 0
3
0.508 1
0.850 0
0.533 6
5
0.443 5
0.350 0
0.436 6
RM190
1
0.197 6
-
0.182 8 RM19
1
0.012 1
-
0.011 2
2
0.197 6
0.250 0
0.201 5
2
0.415 3
0.200 0
0.399 3
3
0.342 7
0.250 0
0.335 8
3
0.455 6
0.200 0
0.436 6
4
0.262 1
0.500 0
0.279 9
4
0.104 8
0.300 0
0.119 4
RM311
1
0.673 4
0.500 0
0.660 4
5
0.012 1
0.300 0
0.033 6
2
0.326 6
0.500 0
0.339 6
注
: “-”:
未检测到的等位基因
Note: “-”: Means undetected alleles
次内优
3016
和
26A
成恢
177
，泸香
8258
和内
5
优
317
，分别为
0.974 4
和
0.971 4
，再次为
T
优
300
和
中优
891
，宜优
1016
和
26A
成恢
177
，红瑞一号和
26A
成恢
177
，分别为
0.950 0
，
0.950 0
，
0.944 4
。
除以上
7
对品种之间的遗传相似性系数大于
0.900 0
外，另外还有
14
对品种间的遗传相似性系数大于
0.900 0
，说明这些品种间遗传背景相似，亲缘关系
较近。而滇优
37
和
G
优
2138
的遗传相似性系数
最小，为
0.222 2
，滇优
701
和冈
1
优
2637
之间的
遗传相似性系数也小于
0.230 0
，为
0.228 6
，另外
滇杂
42
和内优
5022
，滇优
38
和辐香优
98
，两优
5519
和内香
5A/
制
4
之间的遗传相似性系数也都小
于
0.230 0
，说明这些品种间的遗传背景差异较大，
亲缘关系较远。
根据遗传相似值
(GS)
矩阵，按照
UPGMA
进
行聚类分析，构建
134
个云南省水稻新品种的树
状图，结果见图
1
，从图
1
中看出，在遗传相似
性系数为
0.560 4
处，
134
个品种被分成个八个类
群，
1
个大类群Ⅰ和
7
个较小Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、
Ⅵ、Ⅶ、Ⅷ类群。
类群Ⅰ包括竹优
1013
、武香
9
号和广优
1186
等
115
个品种，占所有测试品种总数的
85.82%
。
在遗传相似性系数为
0.605 8
处，类群
I
被进一步
分为两个亚群，如图
1
所示，分别为亚群
IA
、亚