Basic HTML Version
分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1287
-
1296
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1287
-
1296
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1288
研究背景
微卫星标记即简单重复序列
(Simple sequence
repeats, SSR)
，是指存在于真核生物体由
1~6
个碱
基对组成的简单重复序列。与
RFLP
、
RAPD
、
ALFP
等其他分子标记相比，微卫星标记具有多态性高、
重复性好、准确度高、共显性和符合孟德尔遗传
等优点，更适合亲缘关系较近品种的遗传多样性
分析
(Akagi et al., 1997)
。目前，微卫星标记已经
广泛应用于基因组作图、群体遗传和进化研究、
种质资源多样性分析、杂种优势预测及分子育种
等诸多领域
(
齐永文等
, 2006,
科学通报
, 51(6):
693-699)
。
目前，利用
SSR
标记技术构建水稻指纹图谱
(
肖小余等
, 2006;
陈英华等
, 2009;
从夕汉等
,
2010)
、构建水稻的指纹数据库
(
庄杰云等
, 2006;
程本义等
, 2007)
、进行遗传多样性分析
(
应杰政等
,
2007;
甘晓燕等
, 2009;
刘传光和张桂权
, 2010)
和
品种鉴定
(
樊叶杨等
, 2000;
施勇烽等
, 2005)
等研
究的报道很多。在前人工作基础上，本研究采用
中国水稻所推荐的
12
对首选
SSR
引物
(
庄杰云等
,
2006)
分析水稻品种的种子纯度，构建了
134
个水
稻新品种的
DNA
指纹图谱，分析其遗传多样性，
为云南省水稻新品种登记注册、品种真实性、纯
度鉴定、知识产权保护、遗传资源评价及亲缘关
系分析提供理论依据和技术支持。
1
结果与分析
1.1 SSR
标记的多态性
134
个水稻品种在
12
对多态性位点上共检测
到
55
个等位基因数
(
表
1)
，平均每个标记
4.583 3
个，变幅
2~7
个，其中引物
RM336
多态性最高，
在供试品种中共检测到
7
个多态性片段，引物
RM297
次之，分别检测到
6
个多态性条带，但引
物
RM311
多态性差，只在供试品种中检测到
2
个
多态性条带，引物
RM274
多态性较差，只在供试
品种中检测到
3
个多态性条带。按照不同类型看，
籼稻组和粳稻组检测到的多态性条带数差异明
显，其中籼稻组共检测到
55
个多态性条带，粳稻
组共检测到
43
多态性条带。
12
个微卫星标记检
测到的等位基因数大致呈梯形分布。
12
个微卫星
标记有效等位基因总数为
33.398 0
个
(
表
1)
，平均每
个标记
4.257 5
个
，
其中引物
RM190
的有效等位基
因数最多，为
3.771 9
个，而引物
RM85
的有效等
位基因总数最少，为
1.342 0
个。分类型看，籼稻组
和粳稻组的有效等位基因数差异不大，籼稻组的有
效等位基因数位
32.901 1
，粳稻组的有效等位基因
表
1 SSR
标记的等位基因数和有效等位基因数
Table 1 Number of alleles and number of effective alleles for SSR markers
标记
Locus
等位基因数
No. of alleles
有效等位基因数
No. of effective alleles
籼稻
粳稻
总数
籼稻
粳稻
总数
Indica
Japonica
Total
Indica
Japonica
Total
RM297
6
5
6
3.508 5
3.174 6
3.523 9
RM71
5
4
5
2.861 9
1.526 7
2.719 8
RM85
4
3
4
1.177 1
1.515 2
1.342 0
RM5414
4
4
4
1.965 5
2.105 3
1.981 4
RM274
3
3
3
2.305 2
1.360 5
2.277 1
RM190
4
3
4
3.784 4
2.666 7
3.771 9
RM336
7
5
7
3.200 9
2.985 1
3.295 6
RM72
5
4
5
3.140 8
3.508 8
3.195 6
RM219
5
2
5
3.093 5
1.470 6
3.169 9
RM311
2
2
2
1.785 3
2.000 0
1.813 3
RM209
5
4
5
3.523 0
3.703 7
3.571 6
RM19
5
4
5
2.555 0
3.846 2
2.735 9
平均值
4.583 3
3.583 3
4.583 3
2.741 8
2.488 6
2.783 2
Mean