分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1214
-
1217
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1214
-
1217
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1216
表
1
不同方法提取总
RNA
纯度检测
Table 1 Yield and purity of RNA isolated from different organ in populus with different methods
提取方法
植物器官
OD
260
/OD
280
OD
260
/OD
230
浓度
(ng/µL)
Method
Organ
Concentration (ng/µL)
天根
RNAplant plus Reagent
叶片
1.67
1.42
139.7
试剂盒
Leaf
RNAplant plus Reagent
天泽柱式植物
RNAout
叶片
2.08
2.03
211.3
Column RNAout
Leaf
改良
SDS
法
叶片
2.01
2.04
403.5
Modified SDS method
Leaf
天根
RNAplant plus Reagent
根
1.26
1.18
263.4
试剂盒
Root
RNAplant plus Reagent
天泽柱式植物
RNAout
根
1.83
2.24
311.6
Column RNAout
Root
改良
SDS
法
根
1.91
1.83
372.5
Modified SDS method
Root
因此含有多糖的
RNA
无法用于分子生物学研究
(Fang et al., 1992)
。本研究中进行了部分改良,采用
LiCl
沉淀剂选择性沉淀
RNA
来减少多糖;另外,
选择短时间沉淀
(
如
3 min)
以减少非
RNA
沉淀。但
是,
RNA
样品中仍然存在基因组
DNA
,需进行无
RNase
的
DNase
处理,再进行其他试验。
本试验经琼脂糖凝胶电泳和
RT-PCR
检测分
析,证明了改良
SDS
法完全适用于盐胁迫下杨树总
RNA
提取,为后续分子生物学研究奠定了基础。
3
材料与方法
3.1
材料
将
1
年生
107
杨截成长约
15 cm
的茎段,置于
盛有蒸馏水的塑料容器中,不定期更换蒸馏水,以
防茎段分泌出的粘液影响生根。待根长至
5 cm
左
右时,将茎段转移至含有
0.6% NaCl
的
Hoagland
营养液中胁迫
6 h
,用去离子水冲洗根部,然后用
滤纸吸干根表面水分,迅速剪取叶片和根,用液氮
速冻后置于-
80
℃冰箱保存。
柱式植物
RNAout
购自天泽公司,
RNAplant
plus Reagent
试剂盒购自天根公司,改良
SDS
法药
品均为自己配制,反转录试剂盒购自
Promega
公司,
引物由北京鼎国公司合成。所需试剂
(
除含
Tris
试剂
外
)
用
0.1% DEPC
于
37
℃烘箱处理
24 h
后进行高压
灭菌。所需的研钵等玻璃制品于
180
℃干热处理
12 h
,
以避免
RNA
酶污染。无
DNase
和
RNase
移液器枪
头和
Eppendrof
管购自
Axygen
公司。
改良
SDS
提取液:
100 mmol/L Tris-HCl
,
500 mmol/L NaCl
,
50 mmol/L EDTA
,
2.0% SDS
,
100 mmol/L DTT
,
5% 2
-
β
巯基乙醇,
pH=7.5 (
其中
巯基乙醇在使用前加入提取液中至终浓度
5%)
。
3.2
总
RNA
提取方法
3.2.1
柱式植物
RNAout
方法
称
100 mg
的叶片和根,经液氮研磨后,按试
剂盒操作步骤说明进行
RNA
提取。
3.2.2 RNAplant plus Reagent
试剂盒方法
称取
100 mg
的叶片和根,经液氮研磨后,按
试剂盒操作步骤说明的方法提取。
3.2.3
改良
SDS
法
取
100 mg
叶片和根置液氮冷冻研磨成粉,迅
速置入盛有
350 µL
水饱和酚、
350 µL
氯仿和
700 µL
SDS
提取液的
Eppendorf
管中,涡旋震荡
5 min
后
于
4
℃
12 000 r/min
离心
10 min
;上清转入盛有
700 µL
氯仿的新
Eppendorf
管,震荡混匀,于
4
℃
12 000 r/min
离心
10 min
;上清转入盛有
1/4
体积的
8 mol/L LiCl
溶液,常温沉淀
5 min
;
4
℃
12 000 r/min
离心
10 min
;弃上清,用
75%
乙醇洗沉淀
2
次,最
后短暂离心吸出多余液体,置于真空浓缩仪干燥,
加入
DEPC
处理过的
H
2
O
中溶解
RNA
,于-
80
℃保
存,备用。