孟衡玲等
, 2011,
三种提取铁皮石斛叶片总
RNA
方法的比较
,
分子植物育种
Vol.9 No.83 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0083)
1604
很多植物上都有成功的报道,但由于不同植物及相
同植物的不同组织间在物质组成上千差万别,因此
一种方法仅适用于某种或某类材料,对于特殊的植
物材料,理想的
RNA
提取方法是在探索中逐渐完
善的。
本研究以多糖含量高的铁皮石斛叶片为材料,
采用
3
种不同的方法提取总
RNA
,高质量的
RNA
是进行后续分子生物学研究的基础,并为其他富含
多糖类植物
RNA
的提取提供借鉴。
1
结果与分析
1.1
总
RNA
的电泳检测
由于在提取铁皮石斛
RNA
时,
RNA
被大量
的多糖包裹而损失,导致提取的
RNA
浓度较低,
不能满足
RNA
需求量大的实验,因此,本研究以
普通的
TRIZOL
法提取的
RNA
浓度及纯度为对照,
比较三种方法提取的
RNA
质量。
普通的
TRIZOL
法提取总
RNA
:在加入氯仿抽
提离心后,上清液粘稠,离心后不能很好的和中间
层有机相分离,因此,在离心过程中无法去除多糖,
最后一步加
DEPC
处理水溶解时底部出现大量不溶
黏性物质,经电泳检测,没有
RNA(
图
1A)
。
百泰克公司通用植物总
RNA
提取试剂盒提取
的总
RNA
有两条完整的带,但带较弱,略有降解,
DNA
含量高
(
图
1B)
,经纯化后,
RNA
的浓度很低,
满足不了
RNA
需求量大的实验。
TIANGEN RNAprep pure Plant Kit
提取的
RNA
中有两条较完整的带,但
DNA
含量较高
(
图
1C)
,
在后续的
DNA
消化中往往消化不完全,且
RNA
的
含量都很低,只有
100 ng/µL~200 ng/µL
,经纯化后
RNA
含量很低,几乎检测不到,给
RNA
的定量及
一些实验带来了很大的困难。
去多糖辅助剂
+TRIZOL
法提取的
RNA
浓度较
高,有三条完整的带,且
RNA
的浓度较高,是试
剂盒法的
2~3
倍,
DNA
污染小在琼脂糖凝胶电泳
中几乎看不到
(
图
1D)
,纯化后
OD
值在
1.8~2.0
之
间,三种方法提取的
RNA
浓度及纯度见表
1
。
图
1 A:
普通
TRIZOL
法
; B:
百泰克试剂盒
; C:
TIANGEN
试剂盒
; D: “
去多糖辅助剂
+TRIZOL”
法
Figure 1 A: Common TRIZOL method; B: BIOTEKE kit; C:
TIANGEN kit; D: Removing polysaccharides assistant plus
TRIZOL
表
1 3
种方法提取的铁皮石斛总
RNA
的平均浓度和纯度
Table 1 Total RNA purity and quantity of
Dendrobium officinale
by three methods
方法
Method
平均浓度
(ng/µL)
Mean concentration (ng/µL)
总
RNA
平均纯度
(A260/A280 )
Total RNA average purity (A260/A280)
TRIZOL
法
TRIZOL method
0
0
试剂盒法
(
百泰克试剂盒和天根试剂盒
)
Kit method (Bioteke and Tiangen kit)
178
152
1.82
1.74
除多糖辅助剂
+TRIZOL
法
Removing polysaccharides assistant + TRIZOL
method
468
1.95