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李春艳等, 2011, 小麦淀粉合成酶基因家族的生物信息学分析, 分子植物育种 Vol.9 No.64 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0064)
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图2 小麦淀粉粒结合淀粉合成酶的氨基酸序列同源性比较
注: GenBank登陆号: 小麦(Triticum aestivum): TaGBSSI, BAA77351; TaGBSSII, AAF14233; 用CLUSTAL X 得到的多序列比对
结果中, “*”号表示保守性极高的残基位点; “.:”号代表保守性略低的残基位点
Figure 2 Comparison of the predicted amino acid sequences of wheat granule-bounding starch synthases
Note: The GenBank accession number shown as above; The sequences were aligned using the CLUSTAL X program; The identical
and conserved residues were marked with “*” and “.:”, respectively
图3 部分小麦淀粉合成酶基因的结构分析
Figure 3 Schematic gene structure of partial wheat starch
synthases gene
通过多序列比对和 MEGA 4.0程序生成植物淀粉合
成酶系统进化树(图4)。可将这31个氨基酸序列明显
分为3 个亚家族：SSⅠ和SSⅡ为同一亚家族，GBSS
为一个亚家族，SSⅢ和SSⅣ属同一个亚家族，此结
果和九个小麦淀粉合成酶的进化关系树相同(图5)。
除个别节点外，其余节点支持率都较高，说明分枝
的可信度高，进化过程中亲缘关系较近，如水稻SS
Ⅳb和小麦SSⅣ节点支持率为 100，基因同源性达到