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盖红梅等, 2011, SSR 数据处理宏程序 DataTrans 1.0, 分子植物育种 Vol.9 No.48 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0048)
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1.3 设计目标
应处理从 SSR 原始数据保存格式转换为 Ntsys，
Popgene，PowerMarker， Structure 和 Tassel 软件所
需的数据格式，而且要求准确无误、快速高效；另
外，需有自己的操作界面，通过点击命令按钮进行
操作，简单易用；最后，对用户友好，无需安装，
不在系统文件夹添加文件、占用系统资源小。
2 DataTrans1.0 简介
DataTrans1.0 是一款 SSR 数据前期处理的
Excel 宏程序，可以将 SSR 原始采集数据准确、高
效的转换为多款统计分析软件 (Ntsys, Popgene,
PowerMarker, Structure 和 Tassel)所需的数据格式。
该程序以 VBA 为开发语言，在 Excel 环境下运行，
界面友好(图 3)，操作简便，是群体遗传学和基因组
学数据分析的重要桥梁工具。与手工转换和使用
Excel 函数相比，使用该软件对提高工作效率和确
保数据的准确性方面具有极大的优势(表 3)。目前多
数学者采用的是 Excel 2003，但是由于其仅能容纳
256 列数据，已经无法满足高通量的 SSR 数据保存。
而 Excel 2007 能容纳 1048576 行和 16384 列的数据，
更适合高通量数据的存储。因此，DataTrans1.0 开
发了 DataTrans1.0(2003)和 DataTrans1.0(2007)两个
版本，以满足不同用户的需求。这两个版本在软件
的功能、界面和使用方法上完全相同，两者的区别
仅在于 DataTrans1.0(2007)能处理更多的 SSR 数据，
可充分满足高通量数据分析的要求。本文将以
DataTrans1.0(2007)为例进行介绍。
图 3 DataTrans1.0(2007)的用户界面
Figure 3 The user interface of DataTrans1.0 (2007)
表 3 DataTrans1.0 能够大大提高 SSR 数据前期处理的效率
Table 3 Data Trans1.0 can raise the efficiency of pre-processing of SSR data greatly
功能实现
Function implementation
DataTrans1.0 Excel 函数
Excel functions
Excel 查找、替换
Excel searching,exchanging
bp转0，1 格式
“bp” to “0,1” format
约5 min
About 5 min
约36 h
About 36 h
约15 d (d/12 h)
About 15 d (d/12 h)
bp转基因型格式
“bp” to genotype format
约4min
About 4 min
约24 h
About 24 h
约12 d (d/12h)
About 12 d (d/12 h)
bp转PowerMarker格式
“bp” to format for PowerMarker
约30s
About 30s
约4 h
About 4 h
约8 d (d/12h)
About 8 d (d/12 h)
bp转Structure格式
“bp” to format for Structure
约40s
About 40s
约8 h
About 8 h
约10 d (d/12 h)
About 10 d (d/12 h)
bp转Tassel格式
“bp” to format for Tassel
约30s
About 30s
约3 h
About 3 h
约8 d (d/12 h)
About 8 d (d/12 h)
0, 1转基因型格式
“0,1” to “bp” format
约5 min
About 5 min
约48 h
About 48 h
约20 d (d/12 h)
About 20 d (d/12 h)
注: DataTrans 1.0 的结果为实际运算, Excel 函数和 Excel 查找、替换的结果为根据经验估计
Note: The data point of DataTrans1.0 obtained by real operation, the data point of Excel function and searching/shifting based on
empirical estimation