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何建文等
, 2011, 48
个辣椒地方品种
SSR
和
SRAP
标记的遗传多样性和指纹分析
,
分子植物育种
Vol.9 No.30 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0030)
1220
均
2.7
个等位基因。
SSR
标记的平均多态信息量
(PIC)
为
0.54
，变幅为
0.44~0.64
，以标记
Hpms2-21
和
Hpms1-139
最多，
CB164897
最少。
SSR
标记的平
均标记索引系数
(MI)
为
1.54
，变化范围为
1.88~2.56
，
以标记
Hpms1-3
最少
(
图
1)
。
图
1 SSR
标记
Hpms1-3
的多态性。
Figure 1 Polymorphism for SSR marker Hpms1-3
11
个
SRAP
标记在
48
个辣椒品种中共检测到
96
个等位基因
(
表
2)
，其中
90
个具有多态性，多态
性比率为
93.75%
，每个标记可检测
5~17
个等位基
因，平均
16
个等位基因，其中以标记
“me1+em7”
最多
(
图
2)
，为
17
个等位基因。平均多态信息量
(PIC)
为
0.85
，变化范围在
0.77~0.93
之间，以标记
“me1+em7”
最多，
“me7+em5”
最少。平均标记索引
系数
(MI)
为
7.55
，变幅为
3.85~15.81
，以标记
“me1+em7”
最多，
“me5+em7”
最少。
图
2 SRAP
标记
“me1 +em7”
的多态性
Figure 2 Polymorphism for SRAP marker “me1 +em7”
上述结果表明，
SSR
和
SRAP
标记位点在辣椒
地方品种中存在着丰富的变异，
SRAP
标记位点的
变异比
SSR
位点的变异更为丰富。
表
2 48
个辣椒地方品种
11
对
SRAP
引物组合
PCR
扩增位点的多态性
Table 2 Polymorphism of loci PCR amplified with 11 pairs of SRAP primers among the 48 local capsicum varieties
序号
No.
引物组合
Primer pair
引物序列
(5'-3')
Sequence of primer (5'-3')
等位基因数
Allele
多态性信息量
PIC
标记索引系数
MI
1
me4+em6
M
：
TGAGTCCAAACCGGACC
E
：
GACTGCGTACGAATTGCA
9
0.88
7.92
2
me5+em6
M
：
TGAGTCCAAACCGGAAG
E
：
GACTGCGTACGAATTGCA
6
0.82
4.92
3
me3+em3
M
：
TGAGTCCAAACCGGAAT
E
：
GACTGCGTACGAATTGAC
5
0.78
3.90
4
me1+em3
M
：
TGAGTCCAAACCGGATA
E
：
GACTGCGTACGAATTGAC
6
0.85
5.10
5
me1+em6
M
：
TGAGTCCAAACCGGATA
E
：
GACTGCGTACGAATTGCA
7
0.84
5.88
6
me5+em7
M
：
TGAGTCCAAACCGGAAG
E
：
GACTGCGTACGAATTGAG
6
0.80
4.8
7
me2+em8
M
：
TGAGTCCAAACCGGAGC
E
：
GACTGCGTACGAATTGCC
11
0.87
9.57
8
me1 +em7
M
：
TGAGTCCAAACCGGATA
E
：
GACTGCGTACGAATTGAG
17
0.93
15.81
9
me2+em7
M
：
TGAGTCCAAACCGGAGC
E
：
GACTGCGTACGAATTGAG
10
0.84
8.40
10
me5+em8
M
：
TGAGTCCAAACCGGAAG
E
：
GACTGCGTACGAATTGCC
14
0.92
12.88
11
Me7+em5
M
：
TGAGTCCAAACCGGAAG
E
：
GACTGCGTACGAATTGAG
5
0.77
3.85