何建文等
, 2011, 48
个辣椒地方品种
SSR
和
SRAP
标记的遗传多样性和指纹分析
,
分子植物育种
Vol.9 No.30 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0030)
1221
1.2 48
个辣椒地方品种的遗传聚类分析
1.2.1 SSR
标记的聚类分析
由图
3
可见,
48
个品种间的遗传距离值在
0.27~0.61
之间,其中产自黄平的
HPXJ1
和产自独
山的
DSXJ1
遗传距离最近为
0.27
,表明二者的遗传
差异较小,亲缘关系较近。
以遗传距离
0.578
为阈值可将参试品种分为六
大类
(
图
3)
。
第Ⅰ类只有吉林羊角椒
J1
。
第Ⅱ类
4
个品种:
FGYTJ13
、
FGYTJ14
、
Z042102E
、
Z0430292
;其中按果型含
2
个圆球型、
图
3 48
个辣椒品种
15
个
SSR
标记的聚类图
Figure 3 The dendrogram of the 48 local capsicum varieties
based on the 15 SSR markers
1
个羊角型、
1
个指型;按原产地含贵州
3
份
(
凤岗
2
份、遵义
1
份
)
,四川
1
份。
第Ⅲ类共
31
个品种,以遗传距离
0.547
为阈值
可将该类分为
3
个亚类,第
1
亚类
11
个品种:
Z055027
、
Z042214
、
Z042037C
、
Z042051C
、
HXDWLJ
、
Z042035C2
、
Z042099E
、
ZYDYZ
、
Z042089
、
Z042124A1
、
Z042154E
;其中按果型含
3
个羊角型、
2
个牛角型、
2
个指型、
2
个锥型、
1
个
线型和
1
个灯笼型;按原产地含贵州
7
份
(
遵义
4
份、兴义
1
份、独山
1
份、花溪
1
份、剑河
1
份
)
,
省外
4
份
(
海南
1
份、四川
1
份、广西
1
份、陕西
1
份
)
。第
2
亚类
13
个材料
Z043019
、
Z042001A2
、
SYXMJ
、
DSXJ
、
Z042196E
、
DFXJ
、
Z041035
、
HPXJ1
、
DSXJ1
、
HPXJ
、
Z041051
、
SYZDT
、
JH1
;
其中按果型含
5
个型、
4
个指型、
2
个锥型、
1
个羊
角型和
1
个牛角型;按原产地含贵州
13
份
(
黄平
6
份、遵义
3
份、独山
2
份、大方
1
份和剑河
1
份
)
。
第
3
亚类
7
个品种
:Z042049C
、
Z047044A
、
Z052224
、
Z042008A1
、
MTTZJ
、
Z042145D2
、
Z042005A
;其
中按果型含
2
个羊角型、
2
个指型、
1
个牛角型、
1
个圆球型和
1
个锥型;按原产地含贵州
3
份
(
独山
1
份、黄平
1
份、遵义
1
份
)
;省外
4
份
(
四川
2
份、
广西
2
份
)
。
第Ⅳ类
5
个品种:
Z05210A2
、
Z042180E
、
Z052212C
、
ZYCTJ
、
XZCTJ
;其中按果型含
2
个锥
型、
1
个线型、
1
个指型和
1
个羊角型;按原产地
含贵州
5
份
(
遵义
3
份、兴义
1
份、独山
1
份
)
。
第Ⅴ类
4
个品种:
Z042137D
、
Z042004A2
、
SYTZJ
、
Z052204
;其中按果型含
2
个指型、
1
个羊
角型和
1
个圆球型;按原产地含贵州
4
份
(
黄平
2
份、遵义
1
份、兴义
1
份
)
。
第Ⅵ类
3
个品种:
Z047068B
、
Z042191D
、
Z042110D
;其中按果型含
2
个指型、
1
个牛角型;按
原产地含贵州
2
份
(
黄平
1
份、兴义
1
份
)
,四川
1
份。
1.2.2 SRAP
标记的聚类分析
由图
4
可见,
48
个品种间的遗传距离值在
0.39~0.669
之间,以遗传距离
0.598
为阈值可将上
述辣椒品种分为七类。
第Ⅰ类
2
个品种:
SYXMJ
和
DSXJ
;按果型含
1
个指型、
1
个线型;按原产地含贵州黄平和独山
各
1
份。