周坤华等
, 2011,
辣椒属栽培种、野生种和种间杂交后代的
SRAP
分析
,
分子植物育种
Vol.9 No.29 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0029)
1211
1.2
遗传相似性分析
1.2.1
种间及种内遗传相似系数
以
902
个位点的谱带数据为矩阵,
41
份辣椒材
料 共 获 得
820
个 遗 传 相 似 系 数 , 其 范 围 在
0.709~0.982
之间,平均为
0.889 (
表
1)
。其中,种质
15
与种质
16
遗传相似系数最大,达到
0.982
,种质
1
与种质
41
、种质
2
与种质
3
遗传相似系数最小,均为
0.709
。
表
1
辣椒遗传相似系数分析
Table 1 Analysis on the similarity correlation on SRAP in pepper
遗传相似系
数总数
Total number
总范围
/
平均值
Range/mean
C. annuum
范围
/
平
均值
Range/ mean in
C.
annuum
C. frutescens
范围
/
平均值
Range/mean in C.
frutescens
种间范围与平均值
Range/mean among
specise
种间杂交后代范围
/
平均值
Range/mean in progeny from
interspecific hybridization
820
0.709~0.982/0.889 0.923~0.982/0.944 0.885~0.920/0.902 0.738~0.770/0.755 0.878~0.932/0.908
29
份
C. annuum
材 料 遗 传 相 似 系 数 在
0.923~0.982
之间,平均
0.944
。
3
份
C. frutescens
种质
遗传相似系数在
0.885~0.920
之间,平均为
0.902
,其
中,种质
2
与种
4
遗传相似系数为
0.920
,分别大于种
质
2
与种质
5 (0.901)
及种质
4
与种质
5 (0.885)
遗传相
似系数。
4
个种种间遗传相似系数在
0.738~0.770
之
间,平均为
0.755
。明显小于
C. annuum
及
C. frutescens
种内遗传相似系数。种质
2
、
4
和
5
与
C. annuum
平均
相似系数依次为
0.730
、
0.733
和
0.750
,说明我国海南
野生灌木辣椒种质
(
种质
2, 4)
与
C. annuum
亲缘关系
要远于美洲灌木辣椒
(
种质
5)
与
C. annuum
亲缘关系。
1.2.2
种间杂交后代遗传相似系数
种间杂种
(
种质
1)
与母本遗传相似系数为
0.854
,
大于其与父本的遗传相似系数
(0.786)
。
6
份种间杂交
后代遗传相似系数在
0.878~0.932
之间,平均为
0.908
。从表
2
看到,不同世代种间杂交后代与母本
(
C. annuum
)
的遗传相似系数,随世代增加而提高;
至
F
4
代,种间杂交后代与母本的遗传相似系数平均
为
0.950
,已超过
C. annuum
种间遗传相似系数平均
值。而与父本的遗传相似系数,不同世代间则无明
显变化,处于较低水平。
表
2
种间杂交后代与双亲间遗传相似系数
Table 2 The similarity correlation between progeny from interspecific hybridization and their parents
亲本
Parents
种质代号
Code
平均
Mean
13 (F
2
)
7 (F
3
)
8 (F
3
)
9 (F
3
)
11 (F
4
)
12 (F
4
)
母本
Female parent
0.896
0.918
0.913
0.923
0.943
0.956
0.925
父本
Male parent
0.824
0.767
0.791
0.806
0.791
0.772
0.792
1.3
野生灌木辣椒的特异扩增片段
野生灌木辣椒种质
2
和种质
4
在用引物组合
Me8
-
Em21
和
Me9
-
Em17
扩增时,分别产生
1
条特
异扩增片段,它们是
Me8
-
Em21/385 bp (
图
1)
和
Me9
-
Em17/50 bp
。这
2
条特异片段都能将海南野生
灌木辣椒种质与美洲灌木辣椒种质及其他材料有
效区分开来,可作为海南野生灌木辣椒特征性指纹
图谱,为其鉴定、保持和利用提供分子证据。
1.4
聚类分析
利用
SRAP
多态性条带所得的遗传相似性矩
阵,经过聚类分析构建供试材料的亲缘关系树状图
(
图
2)
。以相似系数
0.831
为阀值,
41
份材料分为
4
大
类群,即
C. annuum
+
种间杂交材料类群、
C.
frutescens
类群、
C. chinense
类群和
C. baccatum
类群。
在
C. annuum
+
种间杂交材料类群中,包含所有的
C.
annuum
材料和种间杂交材料;野生种质
2
、
4
与美洲
种质
5
则构成
C. frutescens
类群,种质
6
和种质
41
分别
聚为
C. chinense
类群和
C. baccatum
类群。
C. annuum
+
种间杂交材料类群在相似系数
0.907
处可分为
4
组,第Ⅰ组包含所有
C. annuum
材料