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周坤华等
, 2011,
辣椒属栽培种、野生种和种间杂交后代的
SRAP
分析
,
分子植物育种
Vol.9 No.29 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0029)
1210
陈学军等
, 2006)
。因此，开展辣椒属种间遗传资源，
特别是野生辣椒遗传资源利用研究，在
DNA
分子水
平上明晰其遗传差异，对于拓展
C. annuum
遗传基
础、改良
C. annuum
种质具有重要意义。
我国野生辣椒种质资源主要分布于云南西双
版纳和海南等热带地区，当地俗称“小米椒”，在
分类上属于灌木辣椒
(
C. frutescens
) (
中国科学院云
南植物研究所
, 1979;
庄灿然等
, 1995)
。我国野生灌
木辣椒与一年生辣椒
(
C. annuum
)
及美洲灌木辣椒
的亲缘关系一直是人们非常关注的问题，但长期以
来，对这一重要野生种质资源的研究主要停留在形
态描述和表型分析上
(
邓明华和文锦芬
, 2009,
辣椒
杂志
, 1: 36-37;
陈学军等
, 2009)
，尚未见在
DNA
水
平上对其遗传多样性进行评价研究的报道。
SRAP
分子标记
(Sequence-related Amplified Polymorphism)
是一种基于
PCR
的新型分子标记技术
(Li and Quiros,
2002)
，具有操作简便、快速，多态性丰富，重复性
好以及不需预知物种序列信息等优点，是研究者首
选的
DNA
标记技术之一。目前，该技术已在基因定
位、遗传图谱构建和遗传多样性研究等诸多领域广
泛应用
(
王建设等
, 2007;
陈锋等
, 2007; Ferriol, et al.,
2003;
林忠旭等
, 2004)
。为此，作者在前期研究基
础上
(
陈学军等
, 2006; 2009)
，应用
SRAP
分子标记技
术，对
41
份辣椒属栽培种不同类型材料、野生灌木
辣椒和种间杂交后代进行分析，旨在探明我国野生
灌木辣椒与美洲灌木辣椒亲缘关系，以及与一年生
辣椒
(
C. annuum
)
遗传差异，探讨人工选择条件下种
间杂交后代亲缘关系的演化，为辣椒的分类、种间
优异基因的利用及新材料创制提供理论参考。
1
结果与分析
1.1 SRAP
扩增结果
以
B
9431
和
H108
基因组
DNA
进行
SRAP
引物组合
的筛选，从
198
对引物组合中筛选出多态性丰富、
扩增谱带清晰的引物组合
20
对。
20
对引物组合共在
902
个位点扩增出条带，扩增条带最多的引物组合
是
Me8
-
Em21
，为
70
条；最少的是
Me10
-
Em2
和
Me10
-
Em8
，仅有
28
条；平均每个引物组合扩增位
点
45.1
个。多态性位点
385
个，多态性比例为
46.24%(
图
1)
。扩增谱带大小在
50~2 000 bp
之间，且
主要分布在
100~700 bp
范围。
图
1
引物组合
Me8/Em21
的
SRAP
扩增结果
注
: 1
-
41
为种质代号
;
箭头所指为野生灌木辣椒特异片段
; M
为
DNA marker
Figure 1 The SRAP amplified profile using the primers combination Me8/Em21
Note: 1
-
41 are the accession code listed in table 1; The arrow marked specific bands of wild
C. frutescens
; M is DNA marker