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毛钧等
, 2011,
斑茅初级核心种质秩数加权平均取样策略
,
分子植物育种
Vol.9 No.1 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0001)
1004
表
4
分组原则的秩数加权平均值
Table 4 Weighted average rank for grouping principle
取样方法
Sampling method
分组原则
Grouping principle
多样性指数
I
变异系数
CV
表型方差
VPV
表型频率方差
VPF
表型保留比例
RPR
秩数平均值
Average rank
随机取样
Random sampling
采集地分组
Origin grouping
0.26
(1.50)
0.56
(2.50)
0.42
(2.50)
0.21
(1.00)
0.33
(1.50)
1.79
(1.80)
叶型分组
Leaves grouping
0.62
(3.50)
0.22
(1.00)
0.17
(1.00)
0.64
(3.00)
0.33
(1.50)
1.97
(2.00)
海拔分组
Height grouping
0.18
(1.00)
0.90
(4.00)
0.59
(3.50)
0.43
(2.00)
0.22
(1.00)
2.31
(2.30)
气候区域分组
Zone grouping
0.70
(4.00)
0.67
(3.00)
0.68
(4.00)
0.32
(1.50)
0.43
(2.00)
2.81
(2.90)
总体聚类分组
Cluster grouping
0.26
(1.50)
0.45
(2.00)
0.34
(2.00)
0.32
(1.50)
0.33
(1.50)
1.70
(1.70)
不分组
Not grouping
0.44
(2.50)
0.67
(3.00)
0.42
(2.50)
0.43
(2.00)
0.33
(1.50)
2.29
(2.30)
聚类取样
Cluster sampling
采集地分组
Origin grouping
0.35
(2.00)
0.90
(4.00)
0.51
(3.00)
0.21
(1.00)
0.33
(1.50)
2.30
(2.30)
叶型分组
Leaves grouping
0.44
(2.50)
0.22
(1.00)
0.34
(2.00)
0.43
(2.00)
0.33
(1.50)
1.75
(1.80)
海拔分组
Height grouping
0.18
(1.00)
0.90
(4.00)
0.17
(1.00)
0.43
(2.00)
0.22
(1.00)
1.89
(1.80)
气候区域分组
Zone grouping
0.53
(3.00)
0.45
(2.00)
0.51
(3.00)
0.43
(2.00)
0.43
(2.00)
2.35
(2.40)
总体聚类分组
Cluster grouping
0.35
(2.00)
0.67
(3.00)
0.17
(1.00)
0.43
(2.00)
0.33
(1.50)
1.95
(1.90)
不分组
Not grouping
0.26
(1.50)
0.79
(3.50)
0.17
(1.00)
0.43
(2.00)
0.33
(1.50)
1.97
(1.90)
注
:
表中参数缩写和数据格式同表
3
Note: Abbreviations and data format as in Table 3
聚类取样下，对数比例
<
多样性比例
<
平方根比例
<
简单比例。表明在随机取样下，平方根比例、对数
比例和多样性比例都能较好保留群体内的遗传变
异，取样效果明显优于简单比例，且三种比例间无
显著差异；在聚类取样下，对数比例取样效果最好，
多样性比例其次，平方根比例稍差，但同样明显优
于简单比例。
1.2.4
取样策略组合评价
根据表
2
中公式④对取样方法、分组原则、组
内取样比例
3
个层次组合形成的
42
种取样策略的
优劣进行综合评价，秩数加权平均值越小表明策略
越优。原始库的秩数加权平均值相当于算术平均
值，即
5
个参数的加权系数均为
20%
。从表
6
的秩
数加权平均值可以看出，有
2
种取样策略组合明显
优于原始库，其中叶型分组按对数比例聚类取样
(LLC)
的策略组合为最佳，叶型分组按多样性比例
聚类取样
(LGC)
的策略组合其次，其他的取样策略
的加秩数加权平均值均高于原始库。因此，根据秩
数加权平均值的比较分析，最终确定叶型分组按对
数比例聚类取样
(LLC)
为最佳取样策略。
1.2.5
总体取样量的确定
最佳总体取样量通过比较最优取样策略的
5
个
参数在不同总体取样量梯度下的秩数加权平均值
来确定，计算公式见表
2
中公式⑤，结果见表
7
。
由表
7
可知，最佳取样策略
LLC
在不同总体取样量
梯度下，其变异系数、表型方差和表型频率方差均
优于原始库，区别在于表型保留比例和多样性指数
两个主效参数。单从多样性指数上看，总体取样量