Basic HTML Version
毛钧等
, 2011,
斑茅初级核心种质秩数加权平均取样策略
,
分子植物育种
Vol.9 No.1 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0001)
1003
型频率方差和变异系数。
1.2
秩数加权平均值与取样策略评价
设各参数的原始秩数分别为
I
0
、
CV
0
、
VPV
0
、
VPF
0
和
RPR
0
，取样方法、分组原则、组内取样比
例、取样策略和总体取样量各取样层次的秩数加权
平均值分别为
Rm
、
Rg
、
Ri
、
Rs
和
Rt
。根据表
1
中
对应的加权系数计算不同取样层次
5
个参数原始秩
数的加权平均值，将秩数加权平均值作为该层次取
样策略优劣的最终评价参数
(
计算公式见表
2)
。
1.2.1
取样方法评价
取样方法评价结果见表
3
，计算公式见表
2
中
公式①，表中数据括号内为原始秩数及算术平均
值，括号外为加权秩数及加权平均值。取样方法的
秩数加权平均值显示聚类取样明显优于随机取样，
聚类取样是先根据材料的表型遗传相似度进行归
类后再从中选出代表材料，可有效清除遗传冗余，
在最大限度上保留原始库的遗传结构。考虑到取样
方法对抽样结果影响显著，故其后分析分为随机和
聚类两组进行。
1.2.2
分组原则评价
分组原则评价结果见表
4
，参数缩写和数据格
式同表
3
，计算公式见表
2
中公式②。各分组原则
秩数加权平均值大小为：随机取样下，总体聚类分
组
<
采集地分组
<
叶型分组
<
不分组
<
海拔分组
<
气候
区域分组；聚类取样下，叶型分组
<
海拔分组
<
总体
聚类分组
<
不分组
<
采集地分组
<
气候区域分组。表明
在随机取样下，总体聚类分组、采集地分组和叶型
分组是较合理的分组原则；在聚类取样下，叶型分
组、海拔分组和总体聚类分组是较合理的分组原则。
1.2.3
组内取样比例评价
组内取样比例评价结果见表
5
，参数缩写和数
据格式同表
3
，计算公式见表
2
中公式③。组内取
样比例秩数加权平均值大小为：在随机取样下，平
方根比例＝对数比例＝多样性比例
<
简单比例；在
表
2
不同取样层次的秩数加权平均值计算公式
Table 2 The formula of weighted average rank in different sampling levels
取样层次
Sampling Levels
秩数加权平均值计算公式
The formula of weighted average rank
取样方法
Sampling method
①
Rm
=
(I
0
×
28.74%
+
CV
0
×
0%
+
VPV
0
×
28.75%
+
VPF
0
×
21.72%
+
RPR
0
×
20.79%)
/
100%
分组原则
Grouping principle
②
Rg
=
(I
0
×
17.6%
+
CV
0
×
22.44%
+
VPV
0
×
16.96%
+
VPF
0
×
21.26%
+
RPR
0
×
21.74%)
/
100%
组内取样比例
Sampling ratio in group
③
Ri
=
(I
0
×
0%
+
CV
0
×
93.92%
+
VPV
0
×
6.08%
+
VPF0
×
0%
+
RPR
0
×
0%)
/
100%
取样策略
Sampling strategy
④
Rs
=
(I
0
×
11.41%
+
CV
0
×
43.84%
+
VPV
0
×
23.77%
+
VPF
0
×
17.99%
+
RPR
0
×
2.99%)
/
100%
总体取样量
Total sampling ratio
⑤
Rt
=
(I
0
×
35.42%
+
CV
0
×
4.08%
+
VPV
0
×
4.27%
+
VPF
0
×
10%
+
RPR
0
×
46.23%)
/
100%
表
3
取样方法的秩数加权平均值
Table 3 Weighted average rank for sampling method
取样方法
Sampling method
多样性指数
I
变异系数
CV
表型方差
VPV
表型频率方差
VPF
表型保留比例
RPR
秩数平均值
Average rank
随机取样
Random sampling
0.57
(2.00)
0.00
(2.00)
0.58
(2.00)
0.43
(2.00)
0.42
(2.00)
2.00
(2.00)
聚类取样
Cluster sampling
0.29
(1.00)
0.00
(1.00)
0.29
(1.00)
0.22
(1.00)
0.21
(1.00)
1.00
(1.00)
注
: I:
多样性指数
; CV:
变异系数
; VPV:
表型方差
; VPF:
表型频率方差
; RPR:
表型保留比率
;
括号内数值为原始秩数及算术平均
值
;
括号外为加权秩数及加权平均值
Note: I: Shannon diversity index; CV: coefficient of variation; VPV: variance of phenotypic value; VPF: variance of phenotypic
frequency; RPR: ratio of phenotypic traits retained; In bracket number is original rank and arithmetic mean; out bracket number is
weighed rank and weighted mean