毛钧等
, 2011,
斑茅初级核心种质秩数加权平均取样策略
,
分子植物育种
Vol.9 No.1 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0001)
1002
质资源。国家甘蔗种质资源圃收集保存了采自全国
9
个省区不同生态类型的斑茅野生材料
147
份,如何
有效保存和高效利用斑茅野生资源,是甘蔗种质资
源研究的重要任务和研究方向。核心种质
(Frankel,
1984; Brown, 1989)
的提出和完善为生物种质资源
的有效保存和高效利用提供了解决途径。国内外已
经在水稻
(
李志超等
, 2000;
李志超等
, 2003)
、菜豆
(Rodino et al., 2003)
、大豆
(
赵丽梅
, 2005)
和小麦
(
董
玉琛等
, 2003;
郝晨阳等
, 2008)
等各种作物上开展
了核心种质构建工作并取得良好效果。甘蔗种质资
源方面,研究人员先后用数量形态学方法构建了甘
蔗热带种资源核心库
(Balakrishnan et al., 2000)
、野
生割手密核心库
(Tai et al., 2001)
和甘蔗杂交品种初
级核心库
(
刘新龙等
, 2009)
。本研究对斑茅核心种质
资源取样策略进行了多层次的分析,探讨了不同分
组原则、不同组内取样比例、不同取样方法、不同
总体取样量对核心种质库构建的影响,并利用秩数
加权平均策略构建了斑茅初级核心种质库,旨在为
斑茅野生资源的筛选评价和杂交利用提供科学的
理论参考。
1
结果与分析
1.1
加权系数与主效参数确定
巢式方差分析结果见表
1
,表中方差贡献率数据
均为百分比,取样策略的方差贡献率为取样方法、
分组原则、组内取样比例三者的累计方差贡献率。
巢式方差分析结果提示不同的参数在不同的取样层
次上受到的影响程度
(
方差贡献率
)
是不同的,在评价
各取样策略优劣时应赋予相应的加权。因此,为放
大方差贡献差异和增强可比性,对同一取样层次不
同参数的方差贡献率进行了转换,使各取样层次的
5
个参数相对贡献率总和均为
100%(
横向
)
,转换后的
相对贡献率作为评价该层次取样策略的加权系数
(
表
1
括号外数据
)
。将加权系数大于
20%
的参数定义为主
效参数,可得以下结果:取样方法的主效参数为表
型方差、多样性指数、表型频率方差和表型保留比
例;分组原则的主效参数为变异系数、表型保留比
例和表型频率方差;组内取样比例的主效参数为变
异系数;取样策略的主效参数为变异系数和表型方
差;总体取样量的主效参数为表型保留比例和多样
性指数;重复取样误差的主效参数为表型方差、表
表
1
各参数在不同取样层次的加权系数
Table 1 Weighting coefficient of parameters for different sampling levels
方差贡献率
%
Variance contribution %
多样性指数
I
变异系数
CV
表型方差
VPV
表型频率方差
VPF
表型保留比率
RPR
取样方法
Sampling method
28.74
(5.81)
0.00
(0.00)
28.75
(12.09)
21.72
(6.92)
20.79
(1.10)
分组原则
Grouping principle
17.60
(6.83)
22.44
(33.46)
16.96
13.70
21.26
13.01
21.74
(2.21)
组内取样比例
Sampling ratio in group
0.00
(0.00)
93.92
(15.11)
6.08
(0.53)
0.00
(0.00)
0.00
(0.00)
取样策略
(
累计方差
)
Sampling strategy
(Cumulative variance)
11.41
(12.64)
43.84
(48.57)
23.77
(26.32)
17.99
(19.93)
2.99
(3.31)
总体取样量
Total sampling ratio
35.42
(68.59)
4.08
(7.90)
4.27
(8.27)
10.00
(19.37)
46.23
(89.53)
重复取样误差
Reapt sampling error
9.60
(18.77)
22.26
(43.53)
33.45
(65.41)
31.03
(60.70)
3.66
(7.16)
注
: I:
多样性指数
; CV:
变异系数
; VPV:
表型方差
; VPF:
表型频率方差
; RPR:
表型保留比率
;
括号内数值为方差贡献率
;
括
号外为加权系数
(
相对方差贡献率
)
Note: I: Shannon diversity index; CV: coefficient of variation; VPV: variance of phenotypic value; VPF: variance of phenotypic
frequency; RPR: ratio of phenotypic traits retained; In bracket number is variance contribution; out bracket number is weighting
coefficient (relative variance contribution)