Page 7 - imbr-Vol.01-No.01

昆虫分子生物学研究
(
网络版
), 2012
,
1
,
1
,
1
-
7
Kunchong Fenzi Shengwuxue Yanjiu (Online), 2012, Vol.1, No.1, 1
-
7
3
1
Bm3HAD
基因的外显子特性
Table 1 Characteristics of exons in
Bm3HAD
外显子
Exon
外显子在
Bm3HAD
cDNA
的位置
(
bp)
The position of the exon in the cDNA of
Bm3HAD
(
bp)
外显子在家蚕基因组上的位置
(
bp)
The position of the exon in the
BABH01027674.1 (bp)
外显子长度
(
bp)
Exon size (bp)
1
6
~200
12 794
~12 988
195
2
201
~476
13 263
~13 538
276
3
477
~559
15 336
~15 417
83
4
560
~775
18 080
~18 295
216
5
776
~1 143
19 218
~19 585
368
2
家蚕
Bm3HAD
蛋白的氨基酸组成
Table 2 Amino acid components of Bm3HAD protein from silkworm
氨基酸
Amino acid
数量
Number
比例
(%)
Ratio (%)
氨基酸
Amino acid
数量
Number
比例
(%)
Ratio (%)
Ala (A)
26
8.4
Arg (R)
9
2.9
Asn (N)
14
4.5
Asp (D)
16
5.2
Cys (C)
3
1.0
Gln (Q)
9
2.9
Glu (E)
18
5.8
Gly (G)
26
8.4
His (H)
4
1.3
Ile (I)
17
5.5
Leu (L)
25
8.1
Lys (K)
32
10.3
Met (M)
10
3.2
Phe (F)
12
3.9
Pro (P)
11
3.5
Ser (S)
23
7.4
Thr (T)
15
4.8
Trp (W)
2
0.6
Tyr (Y)
8
2.6
Val (V)
29
9.4
Pyl (O)
0
0.0
Sec (U)
0
0.0
1.2.4
氨基酸序列同源性比对
根据家蚕
Bm3HAD
蛋白氨基酸序列,经
NCBI
上的
Blastp
软件比对分析,获得不同物种的同源序
列。家蚕
Bm3HAD
编码的氨基酸序列与谷蛀虫
(
Tribolium castaneum
)
3
HAD
(
XP_973042.1)
71%
的相似性,与豌豆蚜
(
Acyrthosiphon pisum
)
的两个
3
HAD
蛋白
(
NP_001155916.1
BAH70529.1)
的相似
性均为
66%
利用
MEGA 3.1
软件构建了几种昆虫
3
HAD
的系统进化树,如图
4
所示。
1.3
Bm3HAD
基因在不同组织中表达分析
用荧光定量
PCR
方法检测发现,
Bm3HAD
因在家蚕的中肠、血液、脂肪体、丝腺及生殖体
中都有表达,但表达水平不同,在中肠组织中的
表达量最高,在血淋巴中的表达量为最低。在
BmCPV
感染
48
h
后,该基因在蚕体各组织中表
现出差异表达,在脂肪体和血淋巴中该基因被上
调表达,而在中肠、丝腺和生殖体中该基因均被
下调表达,见图
5
1 .4
Bm3HAD
基因在
BmCPV
感染家蚕中肠
的表达差异
家蚕中肠组织的荧光定量
PCR
结果表明,在健
康对照蚕中肠组织中,
Bm3HAD
基因的表达水平逐
渐提高。而在
BmCPV
感染蚕中肠组织,
Bm3HAD
基因在感染后
24
h
的表达水平呈现上调趋势,然后
逐渐降低,至感染后
48
h
即呈现下调表达,至感染
72
h
该基因表达水平的下调幅度更为显著;此时
该基因在正常中肠组织的表达水平显著高于
BmCPV
感染中肠组织中的表达水平,
Ct
值分别为
24.69
±0.04
22.79
±0.19
正常蚕中肠中该基因的
表达水平是
BmCPV
感染中肠中的
8.2
(
6)
2
讨论
质型多角体病毒
(
cytoplasmic polyhedrosis virus,
CPV)
属呼肠孤病毒科
(
Reoviridae)
家蚕质型多角体
病毒
(
BmCPV)
感染家蚕中肠上皮组织并在柱状细
胞的细胞质中繁殖,形成包裹病毒粒子的包涵体。
基因组由
10
节段双链
RNA
分子组成
(
Watanabe et
al., 2002; Sun et al., 1982)
关于昆虫对病原物的免
疫机制,目前研究较为广泛和深入的是昆虫对细菌
及真菌的免疫与应答。但有关昆虫对病毒感染的应
答反应及其分子机制的研究尚无突破性进展。本