Page 8 - imbr-Vol.01-No.01

昆虫分子生物学研究
(
网络版
), 2012
,
1
,
1
,
1
-
7
Kunchong Fenzi Shengwuxue Yanjiu (Online), 2012, Vol.1, No.1, 1
-
7
4
3
Bm3HAD
基因全长
cDNA
序列及其推导氨基酸序列
Figure 3 Full-length cDNA sequence of
Bm3HAD
gene and its deduced amino acid sequence
:
加尾信号
(
AATAAA)
用下划线标注
;
起始密码子与终止密码子分别用方框标注
Note: Polyadenylation signal (AATAAA) is underlined; Start codon and stop codon are boxed
研究的目的是为探索
BmCPV
感染家蚕的分子机制
提供相关依据。
本研究利用
RACE
技术,在家蚕中肠中克隆获
得一个
3-
羟酰辅酶
A
脱氢酶
(
Bm3HAD
)
基因,该基
因全长
cDNA
序列为
1 168
bp
其中
ORF
930
bp
编码
310
个氨基酸的蛋白质,分子量为
33.6
kD
该基因由
5
个外显子和
4
个内含子组成。利用生物
信息学软件对该基因进行分析,该基因属于
NADB-Rossmann superfamily
3
HAD superfamily
因此,将该基因命名为
Bm3HAD
(
Bombyx mori
3-
hydroxyacyl-coA dehyrogenase,
Bm3HAD
)
物种同
源性分析表明,
Bm3HAD
与其它所知物种的
3-
羟酰
辅酶
A
脱氢酶蛋白相比同源性较高,尤其是与谷蛀
虫的同源性最高。系统进化分析显示,
Bm3HAD
谷蛀虫
3-
羟酰辅酶
A
脱氢酶
(
XP_973042.1)
聚为一
类,说明
Bm3HAD
与谷蛀虫
3-
羟酰辅酶
A
脱氢酶具
有相似的功能。荧光定量
PCR
结果表明,
Bm3HAD
在感染病毒后
24
h
表现上调表达,然而随着病情的
进展,其表达水平逐渐降低,并表现为下调表达,
至感染后
72
h
该基因在感染蚕中肠中的的表达量
与在正常蚕中肠中的表达量相比,其表达量降低
8.2
倍。该基因的表达量趋势与本实验室基因芯片分析
的趋势一致。
Bm3HAD
基因在
BmCPV
感染蚕中肠
中的表达水平随着病毒感染的进展而逐渐降低,由
上调表达逐渐转变为下调表达,而在健康对照蚕中
肠组织该基因的表达水平在相对应的时间段内却呈