分子植物育种 - page 8

分子植物育种
(
网络版
), 2016
,
14
,
1095-1101
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2016, Vol.14, 1095-1101
Copyright © 2016 BioPublisher 1098
同一区间检测到相同性状
QTL
,表明这两个
QTL
广泛存在于不同品种中。同时,本研究的结果有利
于下一步相关基因的克隆,和进行分子标记辅助选
择育种和转基因育种。
3 qBR1
qBR4
与已发表相同区间的糙米率
QTL
遗传距
离对比
Figure 3 Genetic distance comparison between qBR1, qBR4
and the published same interval of brown rice rate of QTL
3
材料和方法
3.1
试验材料与田间种植
V20B
是籼稻品种,加工品质好,但米质较差;
CPSLO17
是典型的广亲和爪哇稻品种,米质优良,
但加工品质较差。重组自交系
(RIL)
群体是
V20B
CPSLO17
进行杂交,然后通过单粒传法连续自交,
最后建立的
RIL
群体,共
150
份。
2014
年先后在贵州省贵阳市贵州省水稻研究
所试验基地和海南省三亚市师部农场种植亲本株
系和
150
RIL
群体,每株系种
2
行,每行
10
株,
种植密度采用宽窄行
(
宽行
30 cm,
窄行
20 cm)
,株
20 cm
,常规田间管理。
3.2
性状考察
水稻成熟期后,混合收种,室温贮存
3
个月以
上,选取籽粒饱满的种子进行糙米率的测定。糙米
率的测定参照中华人民共和国农业部颁布的标准
进行测定,具体方法是:用电子天平称量
100
粒谷
粒,精确到
0.0001 g
,用砻谷机脱壳并称重。糙米
率的计算公式是:
糙米率
(%)={
糙米重
(g)/[
试样种子重
(g)
-未脱
壳种子重
(g)]}
×
100
3.3
连锁图谱构建和数据分析
RIL
群体的连锁图谱是由北京百迈克生物科技
有限公司利用
SLAF-seq(Specific-Locus Amplified
Fragment Sequencing)
技术和
HighMap
软件联合开
发得到
SLAF
标签的分子数据高密度遗传图谱,结
合田间表型数据,进行
QTL
效应分析。其中,该
遗传图谱共包含
8602
个高质量
SLAF
标签,较为
均匀地分布在水稻的
12
条染色体上;覆盖水稻全
基因组
2508.65 cm
,相邻标记间的平均距离为
0.292
cm
。通过使用
IciMapping4.0
对该群体糙米率进行
QTL
分析,扫描步长为
0.1 cm
,以
LOD
3.0
为判
QTL
存在的阈值。参照
McCouch
(1997)
提出
的方法对所检测到的
QTL
进行命名,其中加性效
应值为正指增效等位基因来自于亲本
V20B
,负值
则来源于亲本
CSPLO17
作者贡献
叶生鑫是本研究的实验设计和实验研究的执
行人,完成数据分析,论文初稿的写作;刘颖和彭
强参与实验设计和实验执行,以及论文的修改;张
大双和吴健强负责实验材料的田间种植与管理;王
际凤和黄培英辅助实验的执行;朱速松是项目的构
思者和负责人,指导实验设计,数据分析,论文写
作与修改。全体作者都阅读并同意最终的文本。
致谢
本研究由贵州省重大专项
([2012]6005
2013]6023)
、贵州省农业科学院专项
([2010]004)
国家科技计划课题
(2014AA10A604-11)
共同资助。
参考文献
Aluko G., Martinez C., Tohme C., Castano C., Bergman C., and
Oard J.H., 2004, QTL mapping of grain quality traits from
the inter specific cross
Oryza sativa
×
O. glaberrima
,
Theoretical and Applied Genetics, 109: 630-639
Cao Z., Zeng G., Hao M., Sheng H.W., Ye N.Z., and Xiao Y.H.,
2015, Improving blast resistance of dual-purpose genic
sterile line C815S by using molecular marker-assisted
selection, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant
Breeding), 13(6): 1193-1200 (
曹志
,
曾盖
,
郝明
,
盛浩闻
,
叶乃忠
,
肖应辉
, 2015,
利用
MAS
技术改良水稻两用核
不育系
C815S
的稻瘟病抗性
,
分子植物育种
, 13(6):
1193-1200)
Cheng S.Q., Qing S.W., Huang Z.F., Dai Y., Zhang L.L., Gao
Y.Y., Gao Y., and Cheng J.M., 2013, Development of
specific molecular markers for thinopyrum elongatum
chromosome using SLAF-seq technique, Zuowu Xuebao
(Acta Agronomica Sinica), 39(4): 727-734 (
陈士强
,
秦树
,
黄泽峰
,
戴毅
,
张璐璐
,
高营营
,
高勇
,
陈建民
,
1,2,3,4,5,6,7 9,10,11,12
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