分子植物育种
(
网络版
), 2016
年
,
第
14
卷
,
第
1095-1101
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2016, Vol.14, 1095-1101
Copyright © 2016 BioPublisher 1098
同一区间检测到相同性状
QTL
,表明这两个
QTL
广泛存在于不同品种中。同时,本研究的结果有利
于下一步相关基因的克隆,和进行分子标记辅助选
择育种和转基因育种。
图
3 qBR1
和
qBR4
与已发表相同区间的糙米率
QTL
遗传距
离对比
Figure 3 Genetic distance comparison between qBR1, qBR4
and the published same interval of brown rice rate of QTL
3
材料和方法
3.1
试验材料与田间种植
V20B
是籼稻品种,加工品质好,但米质较差;
CPSLO17
是典型的广亲和爪哇稻品种,米质优良,
但加工品质较差。重组自交系
(RIL)
群体是
V20B
和
CPSLO17
进行杂交,然后通过单粒传法连续自交,
最后建立的
RIL
群体,共
150
份。
2014
年先后在贵州省贵阳市贵州省水稻研究
所试验基地和海南省三亚市师部农场种植亲本株
系和
150
个
RIL
群体,每株系种
2
行,每行
10
株,
种植密度采用宽窄行
(
宽行
30 cm,
窄行
20 cm)
,株
距
20 cm
,常规田间管理。
3.2
性状考察
水稻成熟期后,混合收种,室温贮存
3
个月以
上,选取籽粒饱满的种子进行糙米率的测定。糙米
率的测定参照中华人民共和国农业部颁布的标准
进行测定,具体方法是:用电子天平称量
100
粒谷
粒,精确到
0.0001 g
,用砻谷机脱壳并称重。糙米
率的计算公式是:
糙米率
(%)={
糙米重
(g)/[
试样种子重
(g)
-未脱
壳种子重
(g)]}
×
100
3.3
连锁图谱构建和数据分析
RIL
群体的连锁图谱是由北京百迈克生物科技
有限公司利用
SLAF-seq(Specific-Locus Amplified
Fragment Sequencing)
技术和
HighMap
软件联合开
发得到
SLAF
标签的分子数据高密度遗传图谱,结
合田间表型数据,进行
QTL
效应分析。其中,该
遗传图谱共包含
8602
个高质量
SLAF
标签,较为
均匀地分布在水稻的
12
条染色体上;覆盖水稻全
基因组
2508.65 cm
,相邻标记间的平均距离为
0.292
cm
。通过使用
IciMapping4.0
对该群体糙米率进行
QTL
分析,扫描步长为
0.1 cm
,以
LOD
≥
3.0
为判
定
QTL
存在的阈值。参照
McCouch
等
(1997)
提出
的方法对所检测到的
QTL
进行命名,其中加性效
应值为正指增效等位基因来自于亲本
V20B
,负值
则来源于亲本
CSPLO17
。
作者贡献
叶生鑫是本研究的实验设计和实验研究的执
行人,完成数据分析,论文初稿的写作;刘颖和彭
强参与实验设计和实验执行,以及论文的修改;张
大双和吴健强负责实验材料的田间种植与管理;王
际凤和黄培英辅助实验的执行;朱速松是项目的构
思者和负责人,指导实验设计,数据分析,论文写
作与修改。全体作者都阅读并同意最终的文本。
致谢
本研究由贵州省重大专项
([2012]6005
、
2013]6023)
、贵州省农业科学院专项
([2010]004)
和
国家科技计划课题
(2014AA10A604-11)
共同资助。
参考文献
Aluko G., Martinez C., Tohme C., Castano C., Bergman C., and
Oard J.H., 2004, QTL mapping of grain quality traits from
the inter specific cross
Oryza sativa
×
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,
Theoretical and Applied Genetics, 109: 630-639
Cao Z., Zeng G., Hao M., Sheng H.W., Ye N.Z., and Xiao Y.H.,
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曹志
,
曾盖
,
郝明
,
盛浩闻
,
叶乃忠
,
肖应辉
, 2015,
利用
MAS
技术改良水稻两用核
不育系
C815S
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,
分子植物育种
, 13(6):
1193-1200)
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(Acta Agronomica Sinica), 39(4): 727-734 (
陈士强
,
秦树
文
,
黄泽峰
,
戴毅
,
张璐璐
,
高营营
,
高勇
,
陈建民
,