分子植物育种
(
网络版
), 2016
年
,
第
14
卷
,
第
1095-1101
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2016, Vol.14, 1095-1101
Copyright © 2016 BioPublisher 1096
品价值和生产效益。糙米率是糙米质量占稻谷质量
的百分率，是衡量稻米加工品质的重要指标之一。
一般而言，籼稻主要栽培品种的平均糙米率为
80%
，粳稻比籼稻高
3~4
个百分点
(
钱前和程式华
,
2006)
。粘稻糙米率也会高于糯稻，大粒品种的糙米
率小于小粒品种，同时籽粒的饱满程度也影响糙米
率的高低
(
周勇等
, 2013)
。
研究表明，水稻糙米率是一个遗传机理较为复
杂的数量性状，不仅受到基因的影响，也容易受环
境因素的影响。石春海等
(1998)
分析认为糙米率的
遗传受基因型和基因型与环境互作共同控制，而李
欣等
(2000)
认为杂种的糙米率的遗传表达主要取决
于二倍体的母体基因型。穆平等
(2007)
则认为控制
糙米率
QTL
表达受环境的影响较小，以加性、上
位性效应为主。研究的结果不一致，可能是由于环
境对不同群体影响程度不同导致的。此外，不同的
研究者研究发现，糙米率与产量性状
(
石春海等
,
1997;
聂呈荣等
, 2001)
、外观品质性状之间存在相
关性，糙米率与其他加工品质性状之间也存在显著
正相关或显著负相关
(
梅德勇
, 2012;
赵飞
, 2014)
。
目前，已有
87
个控制糙米率的
QTLs
被研究报道，
分布在水稻的
12
条染色体上，如分布在第
1
染色
体上的
br1(Aluko et al., 2004)
、
qBR1(
刘贺梅
, 2010;
胡霞
, 2011;
饶玉春
, 2011;
张大双等
, 2013)
、
qPBR1(
刘家富等
, 2007)
、
qBR-1a
、
qBR-1b(
翁建峰
等
, 2007)
、
qBRR-1(Lou et al., 2009)
。进行初步定位
的研究较多，但进行了精细定位的较少，目前只有
饶玉春
(2011)
利用
BC4F2
群体进行了精细定位，对
qBRR-10
位点发现了
14
个可能的开放阅读框。但
是，还没有发现与水稻糙米率有关的基因被克隆出
来。因此，分析水稻糙米率的遗传基础，对于水稻
育种有着重要的指导意义。
近年来，与水稻糙米率相关的研究报道较多，
但主要是以籼籼交、籼粳交为遗传背景的材料，鲜
有籼爪交为遗传背景的材料。利用
RFLP
、
SSR
等
标记构建连锁图谱的较多，采用高密度遗传图谱的
较少。本研究采用籼爪交为遗传背景的材料，结合
高密度图谱进行
QTL
分析。构建的图谱采用
SLAF-seq
技术，该技术基于简化基因组技术开发的
大规模
SNP
标记和基因分析技术，具有标记密度、
通量、精度等较高的特点，可以媲美精细定位图
谱。该技术构建的图谱已成功应用在大豆异黄酮
(Li
et al., 2014)
、大豆抗菌核病
(Zhao et al., 2015)
、黄瓜
果长果重
(Wei et al., 2014)
等
QTL
定位，芝麻高密度
图谱构建
(Zhang et al., 2013)
、长穗偃麦草特异性标
记开发
(
陈士强等
, 2013)
等多个农作物物种间遗传
分析。在水稻上已经应用在水稻千粒重
(Xu et al.,
2015)
、苗期耐冷性
(
宋佳谕等
, 2014, 2014
年中国作
物学会学术年会论文摘要集
)
等的
QTL
定位分析
中，但将此技术运用于水稻糙米率研究上却少有报
道。为进一步发掘新的糙米率
QTL
，本研究利用
V20B
和
CPSLO17
为亲本的重组自交系
(recom-
binant inbred lines, RIL)
群体，结合
SLAF
标签构建
的高密度遗传连锁图谱
(
未发表
)
，对控制水稻糙米
率的
QTL
进行定位，并做遗传分析。
1
结果与分析
1.1
亲本和
RIL
群体性状表现
V20B
是籼稻品种，糙米率高；
CPSLO17
是爪哇
稻品种，糙米率低。两个亲本的糙米率表型差异明
显，分别为
81.33%
和
76.68%
。
2014
年在三亚和贵阳
两个点中的
RIL
群体的糙米率均呈现连续分布，平均
糙米率分别为
79.32%
和
79.84%
，分别分布在
64.75%~84.92%
和
64.22%~88.10%
之间
(
表
1;
图
1)
。
图
1 RIL
群体的糙米率分布
Figure 1 The distribution of brown rice rate in the RIL
population
1.2
糙米率的
QTL
检测和效应分析
2014
年三亚检测到
1
个
QTL
位点
qBR1
，位于
第
1
染色体
Marker600937~Marker685097
区间上，
LOD
值为
3.2668
，贡献率是
9.7470%
；贵阳检测到
1
个
QTL
位点
qBR4
，位于于第
4
染色体
Marker
503771~Marker431234
区间上，
LOD
值为
3.3300
，
贡献率是
9.7634% (
表
2;
图
2)
。这两个
QTL
位点
等位基因均来源于
V20B
。
