分子植物育种
(
网络版
), 2016
年
,
第
14
卷
,
第
1095-1101
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2016, Vol.14, 1095-1101
Copyright © 2016 BioPublisher 1095
研究报告
Research Report
基于高密度遗传图谱的水稻糙米率
QTL
定位分析
叶生鑫
1
,
刘颖
1
,
彭强
2
,
张大双
2
,
吴健强
2
,
王际凤
2
,
黄培英
2
,
朱速松
1. 2
1
贵州师范大学
,
贵阳
, 550001
2
贵州省水稻研究所
,
贵阳
, 550006
通讯作者
,
;
作者
分子植物育种
, 2016
年
,
第
14
卷
,
第
14
篇
doi: 10.5376/mpb.cn.2016.14.0014
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引用格式
(
中文
)
：
叶生鑫等
, 2016,
基于高密度遗传图谱的水稻糙米率
QTL
定位分析
,
分子植物育种
(online), 14(14): 1095-1101 (doi: 10.5376/mpb.cn.2016.14.0014)
引用格式
(
英文
)
：
Ye et al., 2016,
QTL Analysis of Brown Rice Rate Using High-density Genetic Map in Rice Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding),
14(14): 1095-1101 (doi: 10.5376/mpb.cn.2016.14.0014)
摘 要
水稻糙米率是加工品质中的一个重要组成部分。为了探索糙米率的遗传基础，本研究以
V20B
和
CPSLO17
作为亲本，构建了
150
个重组自交系
(recombinant inbred lines, RIL)
群体。利用
SLAF
标签构建的精度更高、平均遗传距
离为
0.292 cm
的高密度遗传图谱，结合亲本和群体糙米率表型数据，对三亚和贵阳两个环境下控制水稻糙米率的数量性状
位点
(quantitative trait loci, QTL)
进行遗传分析。结果显示：三亚和贵阳共检测到两个
QTL
。其中，三亚检测到
1
个
QTL
位
点
qBR1
，位于第
1
染色体
Marker600937~Marker685097
区间上，两个标记间遗传距离为
0.471 cm
，贡献率为
9.7470%
；贵
阳检测到
1
个
QTL
位点
qBR4
位于第
4
染色体
Marker503771~Marker431234
区间上，两个标记间遗传距离为
0.469 cm
，贡
献率为
9.7634%
。两个检测到的
QTL
，在两个环境中未重复检测到，且增效位点均来自于亲本
V20B
。本研究对进一步发掘
和利用水稻糙米率
QTL
具有重要意义，同时为利用分子标记辅助选择提高水稻糙米率来提供参考。
关键词
水稻
,
糙米率
,
重组自交系
,
数量性状位点
QTLAnalysis of Brown Rice Rate Using High-density Genetic Map in Rice
Ye Shengxin
1
, Liu Ying
1
, Peng Qiang
2
, Zhang Dashuang
2
, Wu Jianqiang
2
, Wang Jifeng
2
,
Huang Peiying
2
, Zhu Susong
2
1 Guizhou Normal University, Guiyang, 550001
2 Guizhou Rice Research Institute, Guiyang, 550006
Corresponding author,
Authors
Abstract
Brown rice rate is an important component of the processing quality in rice. In order to explore the genetic basis of
brown rice rate, this study constructed a population of 150 lines (recombination inbred lines, RIL) derived from a cross between
V20B and CPSLO17. Using a high-density genetic linkage map of SLAF Markers with an average distance of 0.292 cm. and higher
accuracy, and combination with the brown rice rate phenotype data between parents and population, the genetics analysis of QTLs
that control the brown rice rate in Sanya and Guiyang was conducted. The results showed that a total of two QTLs controlling brown
rice rate were detected in Sanya and Guiyang. qBR1, the QTL detected in Sanya, was located in the Marker600937~Marker685097
interval on chromosome 1 with the genetic distance of 0.471 cm and genotype contribution of 9.7470%, while qBR4, the other QTL
detected in Guiyang, was locates in the Marker503771~Marker431234 on chromosome 4 with the genetic distance of 0.469 cm and
genotype contribution of 9.7634%. Moreover, these two detected QTLs haven’t repeatedly detected in the two environments, and
their effect-increasing loci were both originated from V20B. Therefore, the results is of great significance for further exploring and
utilizing brown rice rate related QTL, and also useful in improvement of brown rice rate by marker-assisted selection.
Keywords
Rice, Brown rice rate, Recombinant inbred lines, Quantitative trait loci
研究背景
水稻是世界上最重要的粮食作物之一，稻米品
质越来越受到消费者和生产者的重视。稻米的品质
主要包括外观品质、加工品质、蒸煮食味品质和营
养品质等四个方面。其中，加工品质是稻米由初级
加工到消费者的中间环节，其优劣影响了稻米的商
收稿日期：
2016
年
04
月
22
日
接受日期：
2016
年
05
月
25
日
发表日期：
2016
年
05
月
27
日
基金项目：本研究由贵州省重大专项
([2012]6005
、
2013]6023)
、贵州省农业科学院专项
([2010]004)
和国家科技
计划课题
(2014AA10A604-11)
共同资助。
