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分子植物育种
(
网络版
), 2012
,
10
,
1577
-
1582
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1577
-
1582
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1581
结束后在
Bio Imaging System (GeneGenins
公司
)
观测并拍照和分析,再
3730XL
测序列分析仪
(
ABI
公司
)
自动检测
SSR
样本,分析
Hardy-Weinberg
和多态性。
3.4
扩增体系及程序
反应体系
10 μL
,其中模板
DNA 30.0 ng
Taq
DNA
聚合酶
1.0 U
Mg
2+
2.0 mmol/L
dNTPs 0.4 mmol/L
正反引物各
0.2 μmol/L
。在下列程序下扩增程:
94
预变性
4 min
94
℃变性
30 s
,最适退火温度
(
依不同
引物而异
) 40 s
72
℃延伸
45s
30
个循环;
72
℃延长
10 min
4
℃保存
(
张瑞丽等
, 2012)
3.5
数据分析
对自动荧光检测获得的结果,采用
GeneMar-
ker1.85
软件包提取
DNA
片段信息,根据
ABI GS500
Standard
,计算出扩增片段大小,获得各位点的扩增
片段。将各位点的扩增进行汇总,利用
Convert 1.31
(Glaubitz et al., 2004)
将结果软件转化成
Popgene
格式,用
Popgene 32 (Yeh et al., 1999, http://www.
ualberta.ca/~ fyeh/popgene.pdf)
进行统计分析。
作者贡献
张瑞丽、白青松是本研究的实验设计和实验研究的执行
人;许玉兰参与实验设计,数据分析,论文写作与修改;田斌、
王大玮参与实验设计,试验结果分析及论文的修改;段安安
是项目的构思者及负责人,指导实验设计。全体作者都阅读
并同意最终的文本。
致谢
本研究在西南山地森林保育与利用省部共建教育部重
点实验室和上海生物工程有限公司完成,得到云南省自然科
学基金项目
(2010CD065)
、云南省教育厅重点项目
(2010Z
-
042)
、国家自然科学基金项目
(31260191)
、云南省教育厅研究
生项目
(2011J053)
和云南省省院省校教育合作咨询共建重点
学科
(211015)
的共同资助。
参考文献
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