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分子植物育种
(
网络版
), 2012
,
10
,
1577
-
1582
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1577
-
1582
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1577
研究报告
Research Report
云南松种质资源
SSR
标记的引物筛选及
Hardy-Weinberg
检测
张瑞丽
1*
,
白青松
1*
,
许玉兰
1,2
,
王大玮
1
,
田斌
1
,
段安安
1
1.
西南林业大学林学院
,
昆明
, 650224
2.
北京林业大学林木育种国家工程实验室
,
林木花卉遗传育种教育部重点实验室
,
北京
, 100083
*
同等贡献作者
通讯作者
:
duananan@gmail.com
作者
分子植物育种
, 2012
,
10
,
79
doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0079
收稿日期:
2012
11
23
接受日期:
2012
12
07
发表日期:
2012
12
27
这是一篇采用
Creative Commons Attribution License
进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用
,
版权所有人允许并同意第三方无条
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引用格式
(
中文
)
张瑞丽等
, 2012,
云南松种质资源
SSR
标记的引物筛选及
Hardy-Weinberg
检测
,
分子植物育种
(online) Vol.10 No.79 pp.1577-1582 (doi:10.5376/mpb.
cn.2012.10.0079)
引用格式
(
英文
)
Zhang et al., 2012, Primer Screening of SSR Markers for Germplasm of
Pinus yunnanensis
and Applying to Hardy-Weinberg Detection, Fenzi Zhiwu
Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.10 No.79 pp.1577-1582 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0079)
本研究以
5
个不同分布区域的云南松群体
DNA
为模板,从
59
对引物中筛选出重复性好、条带清晰的多态性引物
7
对。用筛选出的
7
对引物对云南松
5
个天然群体进行
PCR
扩增,共扩增出
55
条谱条,平均每个引物扩增出
7.9
谱条。所筛
选出的
7
对引物用于云南松种质资源的
Hardy-Weinberg
检测。
关键词
云南松
; SSR
标记
;
多态性
;
引物筛选
; Hardy-Weinberg
检测
Primer Screening of SSR Markers for Germplasm of
Pinus yunnanensis
and
Applying to Hardy-Weinberg Detection
Zhang Ruili
1*
, Bai Qingsong
1*
, Xu Yulan
1,2
, Wang Dawei
1
, Tian Bin
1
, Duan Anan
1
1. College of Forestry, Southwest Forestry University, Kunming, 650224, P.R. China
2. National Engineering Laboratory for Tree Breeding, Key Laboratory for Genetics and Breeding of Forest Trees and Ornamental Plants, Ministry of
Education, Beijing Forestry University, Beijing, 100083, P.R. China
*These authors contributed equally to this paper
Corresponding author, duananan@gmail.com;
Authors
Abstract
In present study, we used genomic DNAs extracted from five populations distributed in different regions as templates,
and seven ploymorphic microsatellite primers with excellent reproducible banding sharp were screened out of 59 microsatellite
primers used in this research. By using this screened primers, total 55 bands were amplified in five tested populations of
Pinus
yunnanensis
with average 7.9 bands per primer; While these seven primers could be applied to the Hardy-Weinberg detection in
tested populations of Yunnan pine (
Pinus yunnanensis
).
Keywords
Yunnan pine (
Pinus yunnanensis
); SSR; Polymorphism; Primer screening; Hardy-Weinberg detection
研究背景
云南松
(
Pinus yunnanensis
Franch)
是松科
(Pina-
ceae)
松属
(
Pinus
)
植物,在云南的亚热带高原,海拔
700~3 200 m
都有大面积分布
(
吴征镒等
, 1987,
学出版社
, pp.417-419)
,是分布区域内瘠薄荒山造林
的先锋树种和治理水土流失的重要树种,占云南省
林地面积的
52%
、占有林地蓄积的
32%
,在分布区
域林业经济生产和生态建设中占有举足轻重的作
(
中国科学院中国植物志编辑委员会
, 1978,
科学
出版社
, pp.211-282;
金振洲和彭鉴
, 2004,
云南科
技出版社
, pp.6, 21, 332)
。然而,目前云南松的退化现
象比较明显,急需对现有的种质资源进行评价,以制
定切实可行的遗传保护策略。
随着分子生物学的发展,人们更重视基因本身
DNA
分子水平的评价。目前,在林木种质资源研
究中使用比较多的有
RFLP
RAPD
AFLP
SSR
ISSR
等,其中,微卫星
(simple sequence repeat, SSR)
是以少数几个核苷酸为单位多次串联重复的
DNA
序列,具有数量丰富、共显性、高度重复性、对
DNA
数量及质量要求不高等优点
(Powell et al., 1996; Kalia,