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吴爽等:开发
S5
功能标记应用于水稻广亲和品种筛选
1018
目广亲和系鉴定组鉴定,该品系程氏指数为
22
,属
粳型,与
4
个广亲和性测验种
(
南特号、
IR36
、秋光、
巴利拉
)
杂交
F
1
的结实率分别为
82.2%
86.5%
93.0%
90.7%
,平均育性
88.1%
,广亲和性等级为
优。以
4183
为父本育成的双优
4183
2003
年通
过安徽省品种审定,表现结实率高、米质优,高产
稳产。
4183
的育成再次证明了
S5
基因具有广谱广
亲和性。
1.2
S5
基因的筛查检测及部分品种
S5
位点序列比较
天鹅果是一个来自于东南亚的粳稻,用新设计
的功能性引物
S5cpslo
筛查检测发现该材料与
Cpslo17
具有相同的带型
(
2)
。天鹅果穗粒数较多、
农艺性状较好,其广亲和特性的鉴定为直接或间接
利用该品种配制亚种间杂交品种提供了可能。
安徽水稻地方品种是各地农民在长期的生产
实践中培育出来的地方良种
,
主要分布于皖南山区
及江淮之间,淮河以北地区少有种植。在这些地方
品种中绝大部分为籼稻,占
97.6%
,粳稻在江淮之
间有少量种植。本研究利用功能性引物
S5cpslo
测了
332
份安徽水稻地方品种,在所分析的安徽水
稻地方品种中没有检测到
S5
基因
(
2)
。结果表明
在进化过程中籼粳分化造就了丰富多样的稻种资
源,但也导致生殖隔离,生殖隔离的存在阻碍了不
同品种间的基因交流,使得这些地方品种保留了遗
传稳定性和多样性,这能为发掘和利用蕴含的有利
基因和分析水稻驯化过程中的选择事件提供实物。
在二十世纪农家品种的整理收集过程中,部分品种
可能被丢失,这也可能是没有检测到
S5
基因的一
个原因。
S5
基因大片段缺失的上下游设计引物,用
PCR
产物直接测序,得图
3
。在
S5
这个位点上,
Cpslo17
02428
、天鹅果及
4183
的序列一致,都比
非广亲和品种
Balilla
少了
136 bp
,且有
2
个相同的
SNP(T→C
G→A)
(
其中
T→C
未显示
)
。表明
S5
因的突变类型只有一种,即主要为大片段的缺失导
致功能丧失,这与
Chen
(2008)
的测序结果一致。
2
功能标记
S5 cpslo
的筛查检测结果
: M: DL2000 marker ; 1: Cpslo17; 2:
天鹅果
; 3
24:
安徽
水稻地方品种
Figure 2 The PCR result of screening rice landraces in Anhui
province
Note: M: DL2000 marker; 1: Cpslo17; 2: Tianeguo; 3~24: Rice
landraces in Anhui province
3 5
个品种在
S5
位点的序列比对
Figure 3 Sequence comparison of five varieties at
S5
locus
分子植物育种
F
enzi Zhiwu Yuzhong