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分子植物育种
(
网络版
)
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online)
1126
续表
1
Continuing table 1
引物名称
Primer
染色体定位
Chromosome location
多态性位点数
No. of polymorphic loci
多态性信息含量
PIC
重复序列
Repeat type
NAU2437
15
2
0.734
(ATAC)8
NAU2713
6;25
2
0.725
ATT
NAU2862
2
0.719
CTT
NAU2931
16
1
0.320
CAG
NAU3095
19
2
0.710
ATA
NAU3110
19
3
0.794
AGA
NAU3419
2
1
0.375
ACAT
NAU3592
4
1
0.255
AT
NAU3868
4;22;23
1
0.180
TA
NAU5163
1
2
0.744
GAAGAG
NAU5499
14
2
0.548
TTATT
NAU6634
2
0.618
NAU6960
1
0.375
TMB2295
18
1
0.420
(CA)21
STV031
2
0.569
TTC
图
1
各种长度基序出现次数
Figure 1 Frequency of motifs with different length
1.2
基于
SSR
的遗传多样性分析
1.2.1
成对相似系数
利用软件
NTSYSpc2.1
将
SSR
分子标记在
20
个
品种
(
系
)
中的多态性数据计算出两两材料间的相似
系数。由表
2
可知，试验材料间遗传相似系数在
0.18~0.93
之间，平均为
0.44
，其中
71%
的材料间相
似系数小于
0.5
，表明材料间遗传差异较大。其中
5917
和新海
27
号之间遗传相似系数最小
(0.18)
，表明
两者亲缘关系较远。新海
35
号和新海
29
号的遗传相
似系数最大
(0.93)
，表明两者亲缘关系很近，遗传背
景非常相似。
1.2.2 SSR
标记聚类分析
聚类分析采用类平均法
(UPGMA)
进行。由图
2
图
2 20
个海岛棉棉花材料
UPGMA
聚类图
(
材料编号祥见表
3)
Figure 2 UPGMA cluster graph of the 20 Sea-island cotton
cultivars (Lines) (Code no of the materials were showed in
table 3)
可知在阈值约为
0.38
时可将该材料分为两个大类；
第一类包括
12
个材料：新海
15
号、新海
33
号、塔
07-152
、新海
28
号、
DJ-1
、
K388
、阿长
-599
、
S0717
、
新海
31
号、
DJ-07-136
、
H3549
和
5917
。这
12
个材料