陈龙等
:
贵州辣椒疫霉菌交配型测定及遗传多样性分析
1116
从辣椒疫霉在各个地区的分布来看,
A2
交配
型菌株仍占绝对优势。其中,遵义、毕节和六盘
水地区仅有
A 2
交配型,发生频率
100%
;安顺地
区发现两种
A1
、
A2
两种交配型,频率分别为
5.9%
、
94.1%
;贵阳和黔南地区有
A1
、
A2
和
A1,A2
三种交配型菌株分布,出现频率分别为
8.3%
、
88.9%
和
2.8%
。
1.2
辣椒疫霉菌的遗传多样性
利用
31
个
RAPD
引物对
72
株辣椒疫霉菌进行
扩增,不同引物对供试菌株扩增出的
DNA
谱带不
尽相同,变化幅度为
6~17
条,平均
10.6
条;总共
扩增出
329
条谱带,其中
317
条为多态性标记,多
态位点百分率
(PPB)
为
96.35%
。供试菌株既具有相
同的主扩增带,又有多态性条带,这在一定程度上
说明贵州省辣椒疫霉菌既具有种内的同源性,也有
其遗传背景的复杂性。
不同地理种群,
Nei's
基因多样性指数大小范围
为
0.071 7~0.280 0
,平均为
0.121 0
。
Shannon's
多样
性指数大小范围为
0.114 2~0.424 4
,平均为
0.222 4
。
六个地理种群的
Nei's
指数和
Shannon's
指数的计算
结果趋势一致,都以贵阳、遵义较高。
Shannon's
多样性指数各组大小顺序为:贵阳
(0.424 4)
>遵义
(0.299 5)
>毕节
(0.192 6)
>黔南
(0.182 2)
>安顺
(0.120 6)
>六盘水
(0.114 2)(
表
2)
。
从不同地理来源上分析辣椒疫霉菌种群间的遗
传相似性
(
表
3)
,安顺和黔南的菌株间遗传相似性最
高为
0.955 7
,其次为六盘水与遵义的菌株间遗传相
似性为
0.9302
、遵义与贵阳的菌株间遗传相似性为
0.923 0
。遗传相似性较低的为毕节与六盘水、毕节
与安顺的菌株,分别为
0.747 7
、
0.752 9
。毕节与其
他地区的菌株遗传相似性也较低,均低于
0.810 0
。
菌株间的遗传相似性能反应它们之间的亲缘关系,
即相似性越高,菌株间的亲缘关系越近。由图
1
看
出,相似性较高的安顺与黔南、六盘水与遵义首先
分别聚在一起,毕节与其他地区遗传距离最远,遗
传差异最大。
表
2
不同地理来源辣椒疫霉种群的遗传参数
Table 2 The genetic parameters of
Phytophthora capsici
populations from different geographical regions
地区
菌株数
等位基因数
na*
有效等位基因数
基因多样性指数
Shannon's
信息指数
Origin
NO.
ne*
h*
I*
遵义
12
1.5532
1.3567
0.2031
0.2995
Zunyi
贵阳
13
1.8693
1.4761
0.28
0.4244
Guiyang
安顺
17
1.2462
1.137
0.0802
0.1206
Ansun
黔南
20
1.4802
1.2064
0.1191
0.1822
Qiannan
毕节
4
1.3374
1.2279
0.1307
0.1926
Bijie
六盘水
6
1.2766
1.1163
0.0717
0.1142
Liu P.S.
注
: na
*
:
等位基因数
; ne*:
有效等位基因数
(Kimura and Crow, 1964); h
*
:
基因多样性指数
(Nei, 1973); I
*
: Shannon's
信息指数
(Lewontin, 1972)
Note: na
*
: Observed number of alleles; ne
*
: Effective number of alleles (Kimura and Crow, 1964); h
*
: Nei's (1973) gene diversity; I
*
:
Shannon's information index (Lewontin, 1972)