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分子植物育种
(
网络版
), 2013
年
,
第
11
卷
,
第
1068
-
1081
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2013, Vol.11, 1068
-
1081
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
Copyright © 2013 5
th
Publisher 1068
研究报告
Article Report
花生
Cu/Zn-SOD
基因
(
AhCSD1
)
克隆及品种间等位多态性分析
张秀荣
,
刘风珍
,
于元杰
,
张昆
,
万勇善
山东农业大学农学院作物生物学国家重点实验室
,
山东省作物生物学重点实验室
,
泰安
, 271018
通讯作者：
yswan@sdau.edu.cn; liufz@sdau.edu.cn
；
作者
分子植物育种
, 2013
年
,
第
11
卷
,
第
11
篇
doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0011
这是一篇采用
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引用格式
(
中文
)
：
张秀荣等
, 2013,
花生
Cu/Zn-SOD
基因
(
AhCSD1
)
克隆及品种间等位多态性分析
,
分子植物育种
(online), 11(11): 1068-1081 (doi:
10.5376/mpb.cn.2013.11.0
0
11)
引用格式
(
英文
)
：
Zhang et al., 2013, Cloning and Allelic Polymorphism Analysis of Cu/Zn-SOD Gene (
AhCSD1
) in Peanut (
Arachis hypogaea
L.), Fenzi Zhiwu Yuzhong
(online) (Molecular Plant Breeding), 11(11): 1068-1081 (doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0011)
摘
要
为明确花生
Cu/Zn-SOD
基因
(
AhCSD1
)
结构及不同基因型种质间遗传多态性，本研究利用同源克隆技术从花生栽
培种和花生区组二倍体野生种中获得
AhCSD1
，并进行生物信息学分析。山花
9
号
AhCSD1
序列分析结果表明，两条
cDNA
序列
rShCSD1-1
和
rShCSD1-2
同源性
98.18%
，编码区存在
10
个
SNP
；对应核
DNA
序列
gShCSD1-1
与
gShCSD1-2
同源性
97.08%
，共存在
64
个差异位点，其中
27
个
SNP
，两条序列具有
3
个限制性酶识别位点的差异；两条序列均含有
8
个外显
子和
7
个内含子。
4
个栽培品种的
rCSD1-2
与
gCSD1-2
序列分别一致；
rCSD1-1
与
gCSD1-1
序列同源性分别为
99.68%
和
99.70%
；编码区存在
6
个
SNP
，引起对应氨基酸序列的第
53
、第
75
、第
147
位残基变异。与野生种序列比对结果显示山花
9
号
gShCSD1-2
与
B
组
A.ipaensis
的
gAipCSD1
同源性
100%
，
gShCSD1-1
与
A
组
A.duranensis
和
A.kuhlmannii
的
gAduCSD1
和
gAkuCSD1
同源性分别为
99.89%
和
99.48%
；分子进化分析结果表明
gCSD1-1
与
gCSD1-2
分别来自栽培种的
A
、
B
两个染
色体组；
A.ipaensis
为栽培种花生
B
染色体组供体；
A.duranensis
和栽培种花生的亲缘关系比
A.kuhlmannii
更近。研究结果为
揭示
AhCSD1
基因结构差异、转录水平与抗旱性的相关性，明确不同花生品种的抗旱机制提供重要参考。
关键词
花生
; Cu/Zn-SOD
基因
;
序列分析
;
抗旱性
Cloning and Allelic Polymorphism Analysis of Cu/Zn-SOD Gene (
AhCSD1
) in
Peanut (
Arachis hypogaea
L.)
Zhang Xiurong , Liu Fengzhen , Yu Yuanjie , Zhang Kun , Wan Yongshan
State Key Laboratory of Crop Biology, Shandong Key Laboratory of Crop Biology, Agronomy College of Shandong Agricultural University, Tai'an, 271018,
P.R. China
Corresponding authors, yswan@sdau.edu.cn; liufz@sdau.edu.cn;
Authors
Abstract
To reveal the structure and genetic polymorphism of peanut Cu/Zn-SOD gene (
AhCSD1
) from different genotypes,
we obtained
AhCSD1
from peanut cultivars and diploid wild species with the method of homologous cloning. Bioinformatics
analysis showed the two cDNA sequences of
AhCSD1
in Shanhua 9, labeled as
rShCSD1-1
and
rShCSD1-2
, were 98.18% identical
with 10 SNP sites, which were all located in the open reading frame(ORF). The corresponding genomic DNA sequences, named as
gShCSD1-1
and
gShCSD1-2
, were 97.08% identical with 64 differences in total, 27 of which were SNP sites. Three different
recognition sites of restrictive enzyme were found, in addition. Sequences analysis showed the two
AhCSD1
both contained 8 exons
收稿日期：
2013
年
04
月
21
日
接受日期：
2013
年
04
月
23
日
发表日期：
2013
年
05
月
22
日
基金项目：本研究由国家自然科学基金项目
(31201167)
、国
家现代农业产业技术体系建设专项资金项目（
CARS-14
）、十
二五农村领域国家科技计划项目
(2011BAD35B04)
、山东省花
生良种产业化工程项目和山东省现代农业产业技术体系花
生创新团队建设项目共同资助