Page 17 - mpbcn2013no11

Basic HTML Version

分子植物育种
(
网络版
)
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online)
1079
2
讨论
花生是重要的油料和经济作物,干旱导致的氧
化损伤是影响花生产量和质量的首要限制因子,因
此选育抗旱良种尤为重要。以往研究表明
SOD
性与抗旱性密切相关,在干旱胁迫下不同抗旱性品
种间
SOD
活性变化差异显著
(
张智猛等
, 2013)
。花
SOD
Mn-SOD
Cu/Zn-SOD
两种,
Chen
(2013)
人分离的花生类胚素蛋白
AhGLP2
有类似
Mn-SOD
的活性响应胁迫,其编码基因同时也上调
表达。花生
Cu/Zn-SOD
活性占
SOD
总活性
80%
上,且比
Mn-SOD
更稳定,对花生
Cu/Zn-SOD
研究为揭示其响应干旱胁迫及其对花生抗旱性的
贡献具有重要意义。
基因型决定了其抗旱性状对胁迫反应的敏感
程度
(Girdthai et al., 2010)
,干旱条件下花生不同品
SOD
活性变化的显著差异可能与其相关基因结
构密切相关。本研究对
4
个栽培品种细胞质
Cu/Zn-SOD
基因分析结果表明编码区存在等位变
(
2)
,并引起相应氨基酸残基的变化
(
4)
,这
些差异可能导致蛋白空间构型变化进而影响
SOD
活性水平。赵士诚等
(2008)
对玉米在胁迫下抗氧化
酶活性及其基因表达分析结果显示
SOD
活性主要
受基因转录水平调控。
花生野生种比栽培种具有更强的环境适应和
逆境耐受能力,野生种中丰富的抗性基因是栽培种
花生不可替代的宝贵资源,因此,探究花生属种间
亲缘关系一直以来都受到了研究者的广泛关注。栽
培种花生
(AABB)
为异源四倍体,目前较一致的观
点是
A.duranensis
(AA)
A.ipaensis
(BB)
为栽培种的
祖先种
(Moretzsohn et al., 2013)
。本研究对花生栽培
种和野生种
AhCSD1
序列分析结果显示山花
9
gShCSD1-1
gShCSD1-2
分别来自栽培种
A
B
个染色体组,并证明了
A.ipaensis
为栽培种花生
B
染色体组供体,
gShCSD1-1
与来自
A.duranensis
序列
gAduCSD1
同源性为
99.89%
花生
SOD
活性与抗旱性密切相关,抗旱型品
种具有更高的
SOD
活性。然而前人的研究多集中
于干旱胁迫下花生不同品种在不同生育期
SOD
性的动态变化,而对其相关基因及其转录水平研究
较少。因此,本研究对花生细胞质
Cu/Zn-SOD
基因
分子起源、品种间等位基因差异的研究为探究其基
因结构差异、转录水平与抗旱性的相关性,明确不
同花生品种的抗旱分子机理以及加快花生抗旱育
种具有重要意义。
3
材料与方法
3.1
材料
植物材料为
4
份栽培品种
(
1)
和花生区组二倍
体野生种
A.duranensis
A.kuhlmannii
A.ipaensis
Plant Genomic DNA Kit
RNAprep Pure Plant
Kit
Quant Script RT Kit
TIANgel Midi Purification
Kit
等均购自天根生化科技有限公司;
pEASY
-T1
Cloning Kit
、大肠杆菌菌株
DH5α
Tag
酶、
dNTP
等购自北京全式金生物技术有限公司;引物由上海
生物工程有限公司合成,测序工作由北京六合华大
基因科技有限公司完成;试验所需其它药品试剂均
为国产或进口分析纯。
3.2
方法
3.2.1 DNA
RNA
提取及
cDNA
链合成
依据提取试剂盒步骤分别提取花生栽培品种
与野生种幼嫩叶片
DNA
RNA
。以
2 μg RNA
为模
板,
Oligo(dT)
为引物,依照反转录试剂盒操作说明
合成
cDNA
第一链。
3.2.2
AhCSD1
PCR
扩增及测序
以报道序列
(DQ097721)
为模板,利用
Primer5.0
结合
Oligo6.0
软件设计特异性引物
CSD1-F
GCTTCTTTCCCTTCTCAGTCAA
CSD1-R
CACGCGAAAAAGCATGATAATC
。以
cDNA
为模
板,
PCR
扩增程序:
94
℃预变性
5 min
95
℃变性
30 s
54
℃退火
30 s
72
℃延伸
30 s
35
个循环;
72
℃后延伸
7 min
。以
DNA
为模板,
PCR
扩增程序:
94
℃预变性
5 min
95
℃变性
30 s
54
℃退火
30 s
72
℃延伸
2 min
35
个循环;
72
℃后延伸
10 min
PCR
产物经
1%
琼脂糖凝胶电泳,依据东金玉等
(2012)
试验方法回收目的片段、送样测序。
3.2.3
花生
AhCSD1
分子生物学特征分析
运用
DNAMAN
软件进行序列比对和翻译,利
MEGA(Tamura et al., 2011 )
软件采用采用最大简
约法
(Maximum Parsimony, MP)
构建栽培种与野生
AhCSD1
分子进化树,邻位相连法
(Neighbor-Joining,
N-J)
Cu/Zn-SOD
氨基酸序列进行聚类分析,均用
Bootsrap 1 000
评估分子树置信度。
利用
NCBI
在线工具
Splign (http://www.ncbi.nlm.
nih.gov/sutils/splign/splign.cgi?textpage =online&level=form)
分析基因内含子;
CD-Search (http://www.ncbi.nlm.