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林秀琴等
:
应用
GISH
技术鉴定甘蔗野生种外源染色体
1029
上出现小雨点现象即可,室温自然晾干,或
-20
℃冰
箱保存备用。
3.3
叶片基因组总
DNA
的提取、
DNA
探针的标记
采用
CTAB
法提取双亲本基因组总
DNA
及玉
米叶片基因组总
DNA(
封阻用
)
,参照范源洪等
(1999)
和王英等
(2008)
的方法略有修改,用百泰克多功能
DNA
回收纯化试剂盒对
DNA
样品进行纯化和回
收。采用高压灭菌法
(121
, 10 min)
将基因组
DNA
打断成较小的片段,
1.5%
琼脂糖凝胶电泳检测
DNA
片段的大小。双亲本
DNA
模板分别用德国
Roche
公司产品
DIG-High Prime
Biotin-High Prime
进行
标记,具体方法见说明书。
3.4
原位杂交过程
配制
40 μL
杂交混合液
(
50%
去离子甲酰胺
,
10% DS, 0.5% SDS, 6 ng/μL
探针及适量封阻
DNA)
,涡流混合器上混匀,于
PCR
仪上
97
℃变性
10 min
,迅速取出,置冰水盒中冷却
10 min
待用。
染色体玻片标本用
60
℃烘箱烤片干燥
5 h
,每片加
70%
去离子甲酰胺
100 µL
,加封口膜盖片后于
77
水浴锅变性
7 min
,揭去膜。过
-20
70%
95%
100%
梯度酒精脱水,
5 min/
级。从
-20
100%
酒精
中取出染色体玻片标本,迅速甩干玻片上的酒精,
将变性的杂交混合液滴在变性的染色体玻片标本
上,盖上封口膜,放在一密闭湿盒中,置于
37
℃恒
温水浴锅中杂交过夜。用
0.1% SDS (2×SSC)
漂去盖
片,
0.1% SDS (0.2×SSC)
3
5 min
5% BSA
37
℃处理
30 min (
封阻内源性生物素蛋白产生的干
)
,加荧光抗体工作液
(25 μg/mL Bio-Avidin-FITC
15 μg/mLAnti-DIG-Rhodamin
均等混合液
,
避光
)
进行检测,
37
℃,温育
1 h
,用
1×PBS/Teween 20 37
漂洗
3
5 min
DAPI
衬染
7 min (
避光
)
1×PBS
室温漂洗
3
3 min
。用
Vectashied
抗荧光衰减剂封
片后,在德国
Ziess
公司荧光显微镜下观察,用
Metasystem ISIS
系统对细胞荧光图像进行拍照和
处理。
3.5
核型分析
Metasystem Isis
软件进行染色体核型分析,
核型分析参照李懋学和陈瑞阳
(1985)
的标准。
作者贡献
林秀琴、陆鑫、苏火生和刘洪博是本研究的实验设计
和实验研究的执行人;蔡青是项目的构思者和负责人,指导
实验设计,论文写作与修改;刘新龙参与实验设计及论文写
作修改;毛钧参实验结果分析和论文写作。全体作者都阅读
并同意最终的文本。
致谢
本研究在中国科学院昆明植物研究所完成,感谢顾
志建研究员在染色体制片及原位杂交探针制备方面给予
的宝贵意见,还要感谢杨静博士在基因组荧光原位杂交实
验过程中给予的帮助和指导。
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