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张士云
:
生长素早期响应基因
Aux/IAA
的研究进展
1212
(Wang et al., 2005)
、马铃薯
(Kloosterman et al.,
2006)
、杨树
(
董秀春等
, 2007)
、水稻
(Song et al.,
2009)
、草莓
(Liu et al., 2011)
和苹果
(Devoghalaere et
al., 2012)
等植物中也克隆到了该基因,并进行了相
关的研究。但在细菌、动物和真菌中尚没有发现这
类基因,因此可能为植物所特有。
典型的
Aux/IAA
蛋白具有四个保守结构域,分
别称为
Domain I
II
III
IV
,如图
1
所示。
Domain
I
II
位于氨基端
(N
)
,而
Domain III
IV
位于羧
基端
(C
)
。研究表明,四个保守的结构域都具有
一定的功能,
Domains I
具有一个与乙烯响应因子
相关的两亲性基序
LXLXLX
,能够与共阻遏物结
合,是
Aux/IAA
蛋白的转录抑制功能所必需的区域
(Tiwari et al., 2001; 2004; Szemenyei et al., 2008)
Domains II
Aux/IAA
蛋白被泛素化降解的靶位
点,其核心序列为
VGWPP
,该区域的显性突变会
使
Aux/IAA
蛋白不能够进入泛素化途径而导致稳
定性增强
(Zenser et al., 2001, 2003; Kepinski and
Leyser, 2004; 2005)
Domains III
IV
是与生长素
响应基因转录因子
ARF (auxin response factor)
结合
的部位,其二级结构能够折叠成一个螺旋
-
转角
-
(βαα)
,合成的多肽能够在体外进行折叠和二聚化
(Morgan et al., 1999)
Domains IV
也可能有助于二
聚化。在
Domains II
Domains IV
一般还存在两
个核定位信号
NLS (nuclear localization signal) (Kim
et al., 1997)
。此外,在
Domain I
II
之间还有一个
光敏色素
A
的磷酸化作用位点,因此推测
Aux/IAA
蛋白可以通过光敏色素
A
的磷酸化作用介导生长
素与光信号通路
(Colón-Carmona et al., 2000)
1
Aux/IAA
基因编码的蛋白结构示意图
(
董秀春
, 2008)
Figure 1 Structure Model for Proteins Encoded by
Aux/IAA
genes (Dong, 2008)
2
Aux/IAA
基因的作用机制
生长素信号转导包括信号感知、生长素响应基
因的表达以及最终在特定植物组织部位表现出相
应的生理反应等一系列过程
(Guilfoyle et al., 1998;
Santner and Estelle, 2009; Chapman and Estelle,
2009)
。近几年来,关于生长素信号转导的研究已经
取得突破性进展,有关生长素信号转导中各个元件
的功能和作用也有了更加深入的认识。
其中,细胞内响应生长素转录的主要有两个大
的转录因子家族,分别是
Aux/IAA
蛋白家族和生长
素转录因子
ARF
ARF
是一类具有
DNA
结合域的
转录因子,是调节生长素应答反应,控制基因表达
的直接分子。它可以结合到特定基因启动子区域的
生长素反应元件
AuxRE (auxin response element)
激活或者抑制生长素响应基因的表达
(Ulmasov et
al., 1999)
。迄今为止,在拟南芥中共发现有
23
ARFs
,其中大多数促进生长素响应基因的表达,也
有一些抑制基因表达,这主要取决于
ARF
蛋白中
间保守域的特性
(Tiwari et al., 2003)
。研究表明,
ARF
C
末端结构域
CTD (C-terminal domain)
Aux/IAA
蛋白的
Domains III
IV
高度同源,二者
通过这两个区域形成二聚体,进而调控生长素响应
基因的转录
(Tiwari et al., 2003)
。由此可见,生长素
早期响应基因在整个生长素信号转导通路中发挥
重要作用。
Aux/IAA
基因编码一种
18-35 kD
的短命蛋白,
大部分
Aux/IAA
蛋白的半衰期极短
(Reed, 2001)
他们的降解依赖于生长素及其细胞内的受体
TIR1
(transport inhibitor response1)
。研究表明,
TIR1
一类
F-box
蛋白家族,其与拟南芥中
Skp1
蛋白质
类似物
ASK1
ASK2
Cullin (
拟南芥中称为
AtCul1)
可以形成
SCF
TIR1
复合体
(Gray et al.,
2001)
SCF
复合体是一种非常重要的
E3
泛素连接
酶,生长素就是通过
SCF
TIR1
介导的泛素
蛋白酶
体系统来实现对
Aux/IAA
蛋白的降解
(Dharmasiri et
al., 2005)
研究表明,
Aux/IAA
蛋白的快速降解对于生
长素的信号转导过程是必需的
(Worley et al.,
2000)
,生长素的存在可以促进
Aux/IAA
蛋白的降
解。对
TIR1
的结构研究揭示,位于
TIR1 LRR
(leucine-rich-repeats)
区域上的一个疏水腔既能结合
生长素,又能结合
Aux/IAA Domain II (Tan et al.,
2007)
。当细胞内生长素浓度较低时;
Aux/IAA
蛋白
通过与
ARF
结合而抑制
ARF
对下游生长素响应基
因的调控;当细胞内生长素浓度较高时,生长素通
过其侧链的梭基端与
TIRI
分子基部的
LRR
结合,
进而促进
Aux/IAA
蛋白的
Domains II
直接结合到生
长素的上方,形成
SCF
TIR1
-Auxin-Aux/lAA
复合体。
处于该复合体中的
Aux/IAA
蛋白在泛素活化酶
E1
泛素结合酶
E2
及泛素连接酶
E3
酶的作用下被蛋白
质列解体所降解。
Aux/IAA
蛋白对
ARF
的抑制作
用随之解除,使其重新启动对下游基因
(
包括生长素
早期响应基因
)
的调控
(Tan et al., 2007)
,如图
2
所示。