张士云
:
生长素早期响应基因
Aux/IAA
的研究进展
1212
茄
(Wang et al., 2005)
、马铃薯
(Kloosterman et al.,
2006)
、杨树
(
董秀春等
, 2007)
、水稻
(Song et al.,
2009)
、草莓
(Liu et al., 2011)
和苹果
(Devoghalaere et
al., 2012)
等植物中也克隆到了该基因,并进行了相
关的研究。但在细菌、动物和真菌中尚没有发现这
类基因,因此可能为植物所特有。
典型的
Aux/IAA
蛋白具有四个保守结构域,分
别称为
Domain I
、
II
、
III
和
IV
,如图
1
所示。
Domain
I
、
II
位于氨基端
(N
端
)
,而
Domain III
和
IV
位于羧
基端
(C
端
)
。研究表明,四个保守的结构域都具有
一定的功能,
Domains I
具有一个与乙烯响应因子
相关的两亲性基序
LXLXLX
,能够与共阻遏物结
合,是
Aux/IAA
蛋白的转录抑制功能所必需的区域
(Tiwari et al., 2001; 2004; Szemenyei et al., 2008)
。
Domains II
是
Aux/IAA
蛋白被泛素化降解的靶位
点,其核心序列为
VGWPP
,该区域的显性突变会
使
Aux/IAA
蛋白不能够进入泛素化途径而导致稳
定性增强
(Zenser et al., 2001, 2003; Kepinski and
Leyser, 2004; 2005)
。
Domains III
和
IV
是与生长素
响应基因转录因子
ARF (auxin response factor)
结合
的部位,其二级结构能够折叠成一个螺旋
-
转角
-
螺
旋
(βαα)
,合成的多肽能够在体外进行折叠和二聚化
(Morgan et al., 1999)
。
Domains IV
也可能有助于二
聚化。在
Domains II
和
Domains IV
一般还存在两
个核定位信号
NLS (nuclear localization signal) (Kim
et al., 1997)
。此外,在
Domain I
和
II
之间还有一个
光敏色素
A
的磷酸化作用位点,因此推测
Aux/IAA
蛋白可以通过光敏色素
A
的磷酸化作用介导生长
素与光信号通路
(Colón-Carmona et al., 2000)
。
图
1
Aux/IAA
基因编码的蛋白结构示意图
(
董秀春
, 2008)
Figure 1 Structure Model for Proteins Encoded by
Aux/IAA
genes (Dong, 2008)
2
Aux/IAA
基因的作用机制
生长素信号转导包括信号感知、生长素响应基
因的表达以及最终在特定植物组织部位表现出相
应的生理反应等一系列过程
(Guilfoyle et al., 1998;
Santner and Estelle, 2009; Chapman and Estelle,
2009)
。近几年来,关于生长素信号转导的研究已经
取得突破性进展,有关生长素信号转导中各个元件
的功能和作用也有了更加深入的认识。
其中,细胞内响应生长素转录的主要有两个大
的转录因子家族,分别是
Aux/IAA
蛋白家族和生长
素转录因子
ARF
。
ARF
是一类具有
DNA
结合域的
转录因子,是调节生长素应答反应,控制基因表达
的直接分子。它可以结合到特定基因启动子区域的
生长素反应元件
AuxRE (auxin response element)
而
激活或者抑制生长素响应基因的表达
(Ulmasov et
al., 1999)
。迄今为止,在拟南芥中共发现有
23
个
ARFs
,其中大多数促进生长素响应基因的表达,也
有一些抑制基因表达,这主要取决于
ARF
蛋白中
间保守域的特性
(Tiwari et al., 2003)
。研究表明,
ARF
的
C
末端结构域
CTD (C-terminal domain)
与
Aux/IAA
蛋白的
Domains III
和
IV
高度同源,二者
通过这两个区域形成二聚体,进而调控生长素响应
基因的转录
(Tiwari et al., 2003)
。由此可见,生长素
早期响应基因在整个生长素信号转导通路中发挥
重要作用。
Aux/IAA
基因编码一种
18-35 kD
的短命蛋白,
大部分
Aux/IAA
蛋白的半衰期极短
(Reed, 2001)
,
他们的降解依赖于生长素及其细胞内的受体
TIR1
(transport inhibitor response1)
。研究表明,
TIR1
是
一类
F-box
蛋白家族,其与拟南芥中
Skp1
蛋白质
类似物
ASK1
和
ASK2
及
Cullin (
拟南芥中称为
AtCul1)
可以形成
SCF
TIR1
复合体
(Gray et al.,
2001)
。
SCF
复合体是一种非常重要的
E3
泛素连接
酶,生长素就是通过
SCF
TIR1
介导的泛素
—
蛋白酶
体系统来实现对
Aux/IAA
蛋白的降解
(Dharmasiri et
al., 2005)
。
研究表明,
Aux/IAA
蛋白的快速降解对于生
长素的信号转导过程是必需的
(Worley et al.,
2000)
,生长素的存在可以促进
Aux/IAA
蛋白的降
解。对
TIR1
的结构研究揭示,位于
TIR1 LRR
(leucine-rich-repeats)
区域上的一个疏水腔既能结合
生长素,又能结合
Aux/IAA Domain II (Tan et al.,
2007)
。当细胞内生长素浓度较低时;
Aux/IAA
蛋白
通过与
ARF
结合而抑制
ARF
对下游生长素响应基
因的调控;当细胞内生长素浓度较高时,生长素通
过其侧链的梭基端与
TIRI
分子基部的
LRR
结合,
进而促进
Aux/IAA
蛋白的
Domains II
直接结合到生
长素的上方,形成
SCF
TIR1
-Auxin-Aux/lAA
复合体。
处于该复合体中的
Aux/IAA
蛋白在泛素活化酶
E1
、
泛素结合酶
E2
及泛素连接酶
E3
酶的作用下被蛋白
质列解体所降解。
Aux/IAA
蛋白对
ARF
的抑制作
用随之解除,使其重新启动对下游基因
(
包括生长素
早期响应基因
)
的调控
(Tan et al., 2007)
,如图
2
所示。