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分子植物育种
(
网络版
), 2013
,
11
,
1174
-
1180
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2013, Vol.11, 1174
-
1180
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
Copyright © 2013 5
th
Publisher 1174
研究报告
Article Report
辣椒属种间遗传多样性及其亲缘关系的
ISSR
分析
徐小万
,
李颖
,
王恒明
,
徐晓美
,
李涛
,
罗少波
广东省农科院蔬菜研究所
,
广州
, 510640
通讯作者:
ly38469@163.com
shaoboluo@163.com
作者
分子植物育种
, 2013
,
11
,
24
doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0024
这是一篇采用
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引用格式
(
中文
)
徐小万等
, 2013,
辣椒属种间遗传多样性及其亲缘关系的
ISSR
分析
,
分子植物育种
(online), 11(24): 1174-1180 (doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0024)
引用格式
(
英文
)
Xu et al., 2013, The Application of ISSR Technology in Genetic Diversity Detection of
Capsicum
, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant
Breeding), 11(24): 1174-1180 (doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0024)
利用
ISSR
标记对一年生辣椒
(
Cpsicum annuum
L.)
和中华辣椒
(
Cpsicum chinense
Jacquin)2
个栽培种的遗传多样性
和遗传结构进行了研究。结果表明:
(1)
44
个引物中筛选出
16
个重复性好、条带清晰的引物,对
30
份辣椒种质基因组
DNA
进行扩增,得到
293
个位点,其中多样性位点
245
个位点,多样性比例为
83.62%
(2)
基于遗传相似性系数的
UPGMA
法聚类分析,在
0.68
相似水平可以将
30
个辣椒种质分为二个群,编号为
11
12
13
14
15
17
6
个辣椒种质为中华
辣椒
(
Capsicum chinense
Jacquin)
,而另外的
24
个材料为一年生辣椒
(
Capsicum annuum
L.)
,主坐标分析基本上证实了聚类分
析的结果;
(3)
一年生辣椒多样性位点百分率
(
P
)
Shannon
信息指数
(
I
)(73.04%, 0.3392)
均高于中华辣椒
(59.39%, 0.3210)
,说
明中华辣椒遗传多样性较低;
(4) 2
个栽培种间遗传一致性较大为
0.8579
,种间基因分化系数
G
st
较小仅为
0.2019
,这可能与
一年生辣椒与中华辣椒的可交配性和杂种的可育性有关。
关键词
辣椒
;
遗传多样性
;
亲缘关系
; ISSR
The Application of ISSR Technology in Genetic Diversity Detection of
Capsicum
Xu Xiaowan , Li Ying , Wang Hengming , Xu Xiaomei , Li Tao , Luo Shaobo
Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Guangzhou, 510640, P.R., China
Corresponding authors, ly38469@163.com; shaoboluo@163.com;
Authors
Abstract
The genetic diversity and relationship of 30 pepper materials including
Capsicum annuum
L
.
and
Capsicum chinense
Jacquin were analyzed with ISSR markers. The results showed that 16 primers from 44 ISSR primers for amplified the gene DNA of
peppers. Totally 293 ISSR loci including 245 polymorphic loci were produced, with a polymorphism rate of 83.62%. All of the
materials could be separated into two groups at about 0.68 similarity value with UPGMA, including a group of
Capsicum chinense
Jacquin from America (N.11, 12, 13, 14, 15, and 17), a group of
Capsicum annuum
L. from America (N.26) and Asia (the other
materials of 30). And principal coordinate analysis confirmed the results of clustering analysis basically. However, the percentage of
polymorphic loci (
P
) and Shannon information index (
I
) of
Capsicum annuum
L. (73.04%, 0.3392) were much higher than those of
Capsicum chinense
Jacquin (59.39%, 0.3210). We deduced that there was a narrow genetic base for
Capsicum chinense
Jacquin.
Nei’s genetic identity (0.8579) and the genetic variation (
Gst
=0.2019) between species of
Capsicum annuum
L. and
Capsicum
chinense
Jacquin showed that this may be related with cross-compatibility between the two species and fertility of the F
1
hybrids.
Keywords
Capsicum
; Genetic diversity; Genetic relationship; ISSR
研究背景
辣椒
(
Capsicum
spp.)
是一种世界性的蔬菜作物,
辣椒属
(
Capsicum
)
大约有
25
个种,其中
5
个为栽培种
(
邹学校
, 2009,
科学出版社
, pp.9-58)
,大多数分布
在南美洲,其中几个栽培种分布在世界各地。由于
辣椒适应性强,风味特别,营养成分丰富,用途广
泛,加之其类型多,能够满足不同消费者的需要。
尽管各辣椒育种或科研团队已收集了较多辣椒
种质资源,但大部分都停留在资源的形态评价及描
收稿日期:
2013
06
19
接受日期:
2013
06
24
发表日期:
2013
08
08
基金项目:本研究由广东省科技计划项目
(2010B020304001,
2011B020303001, 2012B040400007)
、广东省农科院院长基
金项目
(201108)
和现代农业产业技术体系建设专项
(CARS-25-G-36)
共同资助