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束爱萍
: 118
份水稻种质资源
SSR
遗传多样性分析
1156
1.3 SSR
标记的遗传相似性分析
基于
19
个引物的扩增结果，利用软件分析参
试种质资源遗传相似系数矩阵
(
表略
)
，
118
个水稻品
种间的遗传相似系数为
0.05~0.90
，平均为
0.39
。表
明利用
SSR
技术可以检测水稻品种的遗传多样性。
计算得到
6 903
个遗传相似系数，对其进行次数分
布统计，作次数分布表
(
图
2)
。
由图
2
可见，
118
份种质资源间的遗传相似
系数次数呈正态分布。有
1 188
个遗传相似系数
在
0.50
以上，占总数的
17.21%
；
0.80
以上的数据
仅为
3
个。说明供试种质资源间的遗传相似性较
低，种质资源间的遗传差异大，遗传基础丰富，
具有保存价值。
图
2 118
个水稻种质资源的遗传相似性系数的次数分布
Figure 2 The number of genetic similarity distribution of 118
rice germplasm resource
1.4
聚类分析
利用
NTSYS-pc V2.0
软件进行
UPGMA
聚类
分析，作聚类图
(
图
3)
。在遗传相似性系数
0.302
处，所有水稻种质资源分为两大类，
923
、东野一
号、甜糯、
926
、赣晚籼
9
号、赣优晚
8
号、
SG89320
为第一类群，包括
7
份种质资源。其余
174
份种质
资源为第二类群。第二类群在遗传相似系数接近
0.398
处
(
图中虚线处
)
可以分为
7
个亚类。第一亚
类包括信江晚
1
号、双竹粘、九云晚
1
号和赣农
3425
四份种质资源；第二亚类包括
R15
和早
R218
两份种质资源；第三亚类包括新香
B
、饶晚
6
号、
R4015
和萍恢
2028
四份种质资源；第四亚类包括
粘丰早
1
号、江农早
1
号
B
和早
25
等六十八份种
质资源；第五亚类包括早籼
559
、
R71
、丝苗王、
03B
和
1504
等
11
份种质资源；第六亚类包括晚糯
53
、赣晚籼
34
号、农大
9908
、赣吉一号、井冈旱
稻
1
号、
R288
等
6
份种质资源；第七亚类包括
R838
、鹰优早
4
号和
R121
等
16
份种质资源。第
四亚类中的品种总数占所有材料的
57.63%
，说明
这部分种质资源相似程度相对较高，遗传差异相对
较小。在这个亚类中，可以看到，大多数种质资源
较好的反映了材料间的亲缘关系。如大部分的萍恢
系列种质资源
(
江西省萍乡市农科所引进
)
、鹰优系
列种质资源
(
江西省鹰潭市引进
)
、赣早籼系列种质
资源被归在同一个或者临近的亚群体中，表明这些
种质资源的亲缘关系较近。
从聚类图上可以看出，在遗传相似系数为
0.58
处，可以聚为五十多个小类群。参试水稻种质资源
所聚类型较多，遗传相似度较低，遗传差异大。进
一步证明了参试水稻种质资源丰富的遗传多样性。
2
讨论
观测到的平均等位基因数和平均有效等位基
因数分别为
5.21
和
3.07
。
118
份水稻种质间的遗传
相似系数范围为
0.05~0.90
，平均遗传相似系数为
0.39
。证明了
SSR
标记具有丰富的多态性，是研究
水稻种质资源遗传多样性的工具，这与前人研究的
结果一致
(
赵勇等
, 2002;
刘炜等
, 2005)
。说明了近
年江西省农业科学院水稻研究所品种资源室收集
和保存的水稻种质资源差异大，遗传多样性丰富，
具有保存价值。
聚类结果显示，
SSR
分子标记不能区分水稻种
质资源的籼粳亚种。东野一号是利用耐冷性特强的
东乡野生稻和粳稻亲本
0298
进行杂交并回交选育
而成的粳稻类品种，可自然越冬；
R253
属于北方粳
稻。这两个品种都属于粳稻，但并没有聚在一起。
这可能与所选用的引物有关，也可能是因为它们与
同组的籼稻具有更大的遗传相似性。多数学者认
为，亚洲栽培稻可分为两个亚种，即籼亚种
(
indica
)
和粳亚种
(
japonica
)
。水稻品种的亚种间遗传分化极
显著，遗传变异主要来自亚种内。朱作峰等
(2002)
利用
SSR
引物比较了
86
份水稻的遗传多样性，认
为
SSR
标记能将栽培稻和野生稻分开，也较好地进
行籼粳稻的分类。但肖宇龙等
(2012)
在研究中也指
出，一些被认为粳稻的品种被归为籼稻组，一些被
认为是籼稻的品种被归于粳稻组。他认为，试验中
所用的
SSR
标记所在的位点上，参试品种可能表现
出与同组的籼稻或者粳稻最大的遗传相似性。本研
究倾向于肖宇龙等
(2012)
等的观点。
从聚类图可以看出，大部分的萍恢
(
萍乡市农科
所品种
)
、鹰优
(
江西鹰潭市
)
、赣早籼品种被归在同