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分子植物育种
(
网络版
)
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online)
1155
种单位能否育成好的品种，除了正确的育种目标和
选育技术路线外，还取决于所掌握的品种资源的数
量和质量
(
吴澎等
, 2010)
。
江西稻种资源丰富，“
1986
-
1990
年”、
“
1991
-
1995
年”期间，江西省入国家作物种质库
的地方水稻品种
2 881
份，占全国的
11.31%
，仅次
于云南、广西。对水稻种质资源进行遗传多样性分
析，能够阐明种质资源之间的遗传背景及相互关
系、发现新基因、构建核心种质资源，对于水稻遗
传改良具有重要意义。
1
结果与分析
1.1
数据统计分析
以“
0
”、“
1
”、“
9
”记录
SSR
扩增带型，建立相
应的数据库。在相同迁移率位置上，有带记录为
“
1
”，无带记录为“
0
”，缺失记录为“
9
”。数
据经转化后，用
Popgene 32
程序计算
SSR
标记的等
位基因数、有效等位基因数、遗传多样性指数；用
NTSYS-pc V2.0
进行遗传相似性系数分析，并绘制
UPGMA
聚类图。
1.2 SSR
标记的多态性分析
利用筛选到的
19
对具有多态性的
SSR
引物，
对
118
份水稻种质资源进行
DNA
检测
(
图
1)
。共扩
增出
99
个等位基因，
SSR
引物的等位基因范围为
2~9
个。引物
RM335
的等位基因最多，为
9
个；引物
RM259
、
RM251
、
RM336
的等位变异也较多，均为
8
个；引物
RM216
、
RM190
的等位变异最少，均为
2
个。观测到的平均等位基因数为
5.21
，平均有效等
位基因数为
3.07
。标记多态性分析结果
(
表
1)
。
图
1
引物
RM242
对部分水稻种质资源的扩增结果
Figure 1 Amplified result of RM242 for part of rice germplasm
resource
表
1 19
对
SSR
标记及其扩增结果
Table 1 Amplification results of 19 SSR primers in 118 rice germplasm resource
引物
Locus
染色体
Chr.
观测到的等位基因数
na*
有效等位基因数
ne*
遗传多样性指数
I*
RM259
1
8
6.02
1.91
RM23
1
7
5.76
1.83
RM211
2
4
1.76
0.79
RM251
3
8
5.19
1.82
RM335
4
9
2.83
1.44
RM250
2
3
1.38
0.51
RM405
5
3
2.14
0.84
RM169
5
6
4.76
1.64
RM336
7
8
4.24
1.63
RM252
4
3
2.46
0.99
RM190
6
2
2.00
0.69
RM209
11
5
2.72
1.13
RM247
12
5
1.67
0.85
RM17
12
3
2.057
0.76
RM216
10
2
1.267
0.36
RM242
9
6
3.26
1.35
RM152
8
6
2.82
1.23
RM222
10
5
2.92
1.22
RM219
9
6
3.08
1.40
Mean
5.21
3.07
1.18
St.Dev
2.16
1.46
0.46
注
: * na:
观测到的等位基因数
; * ne:
有效等位基因数
(Kimura and Crow, 1964); I:
遗传多样性指数
(Lewontin, 1972)
Note: * na: Detected number of alleles; * ne: Effective allele number (Kimura and Crow, 1964); * I: Shannon's Information index
(Lewontin, 1972)