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分子植物育种
(
网络版
)
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online)
1146
F
2
群体均为
S. linnaeanum
和
S. melongena
的杂交
后代
(Doganlar et al., 2002a; 2002b; Sunseri et al.,
2003; Wu et al., 2009a)
，其余的
F
2
群体图谱则均基
于茄子种内杂交。表
2
列出了到目前为止国内外研
究者构建的茄子图谱。
由于茄子的分子遗传研究相对较滞后、遗传背
景相对狭窄，且茄子的远缘杂交存在各种障碍。因
此，目前国内外构建的作图群体相对较少，且所构
建的群体大部分为
F
2
群体。日本国立蔬菜茶叶研究
所
Nunome
实验室对茄子图谱进行了连续的研究，
但是目前报道的均为种内
F
2
群体构建的图谱。
Nunome
等
(2001)
以本研究所的种质材料
EPL-1(
长
果型
,
深紫色果皮
)
为母本，印度引入的种质材料
WCGR112-8(
圆果型
,
绿色果皮
)
为父本，构建了一
个包含
168
个单株的
F
2
群体。图谱标记为
RAPD(88)
和
AFLP(93)
标记，覆盖的全长为
779.2 cM
，标记
间的平均距离为
4.9 cM
。
Nunome
等
(2003)
利用实
验室开发的
23
个多态性
SSR
标记对上述作图亲本
和
F
2
群体进行扫描，共得到
16
对亲本差异的标记，
最终
7
对
SSR
标记构建在该群体上。
Nunome
等
(2009)
利用构建的基因组文库和
cDNA
文库，开发
了
1 054
对基因组
SSR
标记和
209
对
EST-SSR
标记，
应用开发的标记对
2001
年的群体亲本进行扫描，
共得到亲本有差异的引物
229
对，其中基因组
SSR
标记
222
对，
EST-SSR
标记
7
对。利用这
229
对标
记和
2003
年的
16
对
SSR
标记共
245
对标记进行
作图，该图谱为包含
236
个
SSR
标记的连锁图，这
张图谱是当前茄子图谱研究中包含相对较多的
SSR
标记的一张，标记覆盖的总距离为
959.1 cM
，标记
间的平均距离为
4.3 cM
。
Fukuoka
等
(2012)
年利用
两个种内
F
2
群体
(LWF2
群体
: LS1934×WCGR112-8
和
ALF2
群体
: AE-P03×LS1934)
，利用茄科直系同
源
(SOL)
基因座开发了
SOL(
包括
SNP/InDels)
标记
和先前报道的
SSR
标记，先分别构建两个种内图
谱，然后将两个图谱进行整合，构建了一张包含
952
个位点，距离为
1285.5 cM
的图谱，标记间的平均
距离为
1.4 cM
。同时根据茄科直系同源序列，将本
图谱与构建的番茄图谱进行比对，并将
2009
年
Nunome
等构建的图谱和本研究的图谱进行了染色
体定位。
Miyatake
等
(2012)
利用两个种内
F
2
群体
(ALF2
群体
: LS1934×AE-P03
和
NAF2
群体
:
Nakate-Shinkuro × AE-P03)
和
SSR
标记及
SNP
标记
构建遗传图谱，分别覆盖基因组的长度分别为：
1
414.6 cM (ALF2)
和
1 153.8 cM (NAF2)
。
2002
年 ， 康 奈 尔 大 学
Tanksley
实 验 室
Doganlar
等利用
RFLP
标记，构建了首张种间遗
传图谱。该群体的亲本材料为茄子近缘种
MM195
(
S. linnaeanum
)
和栽培种
MM738 (
S. melongena
)
，
共获得
F
2
群体
58
株。该图谱总长度为
1 480 cM
，包
含
233
个标记位点，平均距离为
6.35 cM
。
2009
年，
Wu
等
(2009a)
利用
110
个
COS
Ⅱ标记和上述种间
F
2
群体，构建了一张包含
347
个标记的图谱
(
其中
253
个标记的
LOD
值大于
3)
，利用这
253
个标记为框架，
构建遗传图谱，并将剩余的
94
个标记构建到框架图
谱上，该图谱的总遗传距离为
1535 cM
，其中框架
标记间的平均距离约为
6.1 cM
。
Barchi
等
(2010)
以
栽培育种株系
305E40
和
67/3
为亲本构建了一个包
含
141
个单株的
F
2
群体，利用
AFLP
和
SSR
等标记构
建了一个包含
238
个标记，长度为
718.7 cM
，平均
标记间距为
3.02 cM
的种内图谱。
2012
年，
Barchi
等使用同一群体，主要利用
Barchi
等
(2011)
开发的
SNP
标记，和已经发表的部分
SSR
标记，构建了一
张包含
415
个标记，覆盖
1 390 cM
的图谱。
Sunseri
等
(2003)
以野生近缘种
S. linnaeanum
与
栽培品种
Buia
为亲本，构建了一个包含
48
个单株
的种间
F
2
群体。这是至今报道的第二个种间
F
2
群
体。该图谱全长为
736 cM
，包含标记
273
个
(117
个
RAPD
和
156
个
AFLP)
。
国内研究者也构建了茄子的遗传图谱，但是研
究相对较落后。曹必好等
(2006)
以茄子自交系
E-31
和
E-32
为作图亲本，构建了
119
单株的
F
2
群体，
采用
RAPD
标记，构建了我国首张茄子连锁图谱，
该图谱覆盖长度为
651.2 cM
，包含
77
个标记位点，
标记间的平均距离
8.57 cM
。李怀志
(2011)
以两个形
态性状和分子水平均存在巨大差异的高代自交系
为作图亲本，获得了包含
180
个单株的
F
6
作图群体，
构建了首张以重组自交系为作图群体的连锁图谱。
该图谱共包含
127
个标记位点
(111
个
SRAP
标记和
16
个
SSR
标记
)
，覆盖的总长为
713.2 cM
，标记间
的平均距离为
5.62 cM
。乔军
(2011)
以两个栽培种茄
子的高代自交系为亲本，利用
F
2
群体构建了一张
包括
23
个
SSR
标记和
85
个
AFLP
标记的遗传图
谱。该图谱覆盖基因组的遗传距离为
1 007.9 cM
，
标记间的平均距离为
9.3 cM
。