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分子植物育种(网络版), 2012 年, 第 10 卷, 第 1376- 1382 页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1376- 1382
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
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伸结构，因此油茶 UBE2S 属于油茶Ⅱ类 E2。
植物体内的 E2 种类繁多，不同种类具有不同
的功能，在受到胁迫时，不同种类的 E2 通过表达量
的变化等表现出不同的表达方式(赖燕等, 2008)。研
究表明，拟南芥的很多 E2 基因有多个拷贝，产生 E2
蛋白冗余，推测这可能造成了 E2 基因研究进展相对
缓慢的现状。随着 solexa 等高通量测序技术的出现
和发展，大量植物的全基因组或转录组测序完成，利
用不同植物研究 E2 基因的功能，有希望可大大推
动 E2 基因的研究进展。本研究只对油茶 UBE2S 做
了简单的序列分析和保守结构域分析，对油茶其它
E2 成员的克隆、功能鉴定等相关研究有待于进一步
开展，这将为油茶抗逆研究打下良好的基础。
3 材料与方法
3.1 研究材料
分别于油茶种子开始膨大期、营养高速合成
期、近成熟期选取 4 个时间点采集“长林 4 号”种
子，剥取种仁，液氮中保存备用。本研究所用研究材
料采自浙江省金华市东方红林场。
3.2RNA 样品制备
样本 RNA 提取采用 Trizol 法，提取的 RNA 采
用 Nanodrop、Agilent Bioanalyzer 2100 及琼脂糖凝
胶电泳检测质量。将符合要求的 RNA 样品进行转
录组测序分析。转录组测序及序列组装、拼接由深
圳华大基因公司完成。
3.3 生物信息学分析
通过与 Nr 数据库进行 BlastP (Altschul et al., 1997)
比对，筛选出油茶 UBE2S 基因 cDNA 序列。利用
DNAstar 软件分析推导 ORF 及编码蛋白(UBE2S)
的氨基酸序列，使用 ClustalX 软件进行多序列比对,
使用 http://www.us.expasy.org 网址的 ScanProsite
(De et al., 2006)和 CDD (Marchler-bauer et al., 2005;
易乐飞等, 2009)分析保守功能结构域, 使用 Swiss-
model (Schwede et al., 2003)预测三维结构。
作者贡献
林萍、曹永庆、滕建华是本研究的实验设计和实验研究
的执行人，并完成数据分析，论文初稿的写作、实验设计、
试验结果分析；姚小华、王开良是项目的构思者及负责人，指导
实验设计，数据分析，论文写作与修改。全体作者都阅读并
同意最终的文本。
致谢
基金项目：本研究由林业公益性行业科研专项(20100-
4008) 和中国林科院亚林所公益性科研基金专项(RISF6804)
共同资助。
参考文献
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