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分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1338
-
1345
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1338
-
1345
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1340
表
1
广东割手密在
SSR
引物上的扩增条带数、多态性条带数、多态性比例和基因多样性指数和多态性信息含量
Table 1 The number of total bands, polymorphic bands, percent of polymorphic bands, genetic diversity index and polymorphic
information content (PIC) among the Guangdong Geshoumi (S. spontaneum) based on SSR
SSR
引物
SSR
类型
扩增条带数
多态性条带数
多态性比例
遗传多样性指数
多态性信息含量
SSR Primer
SSR Type
Total bands
Polymorphic bands Percent of polymorphic
bands
Genetic diversity
index
PIC
SMC21SA
Genomic-SSR 18
11
0.61
0.148 2
0.119 1
SMC597CS Genomic-SSR 29
26
0.90
0.291 7
0.236 8
SMC668CS Genomic-SSR 23
18
0.78
0.191 0
0.156 1
SMC720BS Genomic-SSR 24
21
0.88
0.205 5
0.169 6
SMC851MS Genomic-SSR 40
30
0.75
0.156 8
0.133 2
SMC1825LA Genomic-SSR 17
14
0.82
0.192 7
0.164 0
mSSCIR58
Genomic-SSR 31
30
0.97
0.206 4
0.174 8
SSCIR15
Genomic-SSR 30
25
0.83
0.140 3
0.120 1
SSCIR16
Genomic-SSR 12
8
0.67
0.106 4
0.090 5
SSCIR36
Genomic-SSR 36
34
0.94
0.213 2
0.177 6
SSCIR43
Genomic-SSR 13
12
0.92
0.247 2
0.198 3
SCA03
EST-SSR
21
16
0.76
0.134 4
0.109 1
SCA04
EST-SSR
14
14
1.00
0.232 0
0.196 9
SCA07
EST-SSR
24
19
0.79
0.190 9
0.157 5
SCB01
EST-SSR
15
14
0.93
0.232 6
0.195 3
SCB02
EST-SSR
4
4
1.00
0.193 0
0.163 4
SCC02
EST-SSR
14
8
0.57
0.157 0
0.128 5
SCC05
EST-SSR
30
21
0.70
0.227 9
0.183 5
SCC07
EST-SSR
10
7
0.70
0.247 6
0.197 6
SCC10
EST-SSR
12
9
0.75
0.152 6
0.128 4
安的割手密作为对照，结果表明福建惠安的割手密
和广东地区
67
割手密的平均遗传距离为
0.222 5
，
比广东省内地割手密之间的平均遗传距离高
15%
，
由此可见，地理差异对割手密的遗传关系具有一定
的影响。
UPGMA
聚类分析表明在遗传距离约为
0.012
时，可将
68
份材料划分为
9
大类。来自福建的
1
份材料单独聚为
1
类，来自广东的材料聚为
8
类
(
图
1)
。其中类Ⅰ、类Ⅱ中都只有
1
份材料，分别为来
自广东揭阳的广东
2
号和来自福建的惠安割手密。
类Ⅲ中共有
5
份材料，分别来自广东的三水、五华、
博罗、海丰等地。类Ⅳ中共有两份材料，分别来自
于韶关和揭阳。类Ⅴ中也只有两份材料，来自于三
水和肇庆。类Ⅵ中共有
14
份材料，来源地比较广
泛、从南到北都有。类Ⅶ中也只有
1
份材料，为来
自湛江的广东
81
号。类Ⅷ是最大类群，共有
35
份
材料，来源地也是比较分散。类Ⅸ中共有
8
份材料，
分别来自于三水、高要、开平、阳江、肇庆等地。
从聚类结果看，地理来源在割手密类群的划分
中起到了一定的决定性作用。本实验中唯一的
1
份
省外来源的福建割手密单独聚为
1
类。在广东省内
材料的
8
个类群中，类Ⅰ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅶ中因为只有
1~2
份材料，材料数较少，和地理之间的遗传关系
难以判断。在材料较多的类Ⅲ、Ⅵ、Ⅷ、Ⅸ中，类
Ⅸ中
8
份材料处
1
份来自于广东南部的阳江地区，
其他
7
份都来自于中部地区。类Ⅲ、Ⅵ、Ⅷ中虽然
每一类群中都包含有来自不同地区的材料，但每个
大类下地理相同或相近的材料又形成不同的亚类。
例如在类Ⅵ中，共有
14
份材料，从聚类图可以看
出，这
14
份材料又可以分为三个亚类。Ⅵ-ⅰ亚类
中，除了广东
55
号来自于广东中部地区的德庆外，
其他
6
份材料广东
68
号、广东
3
号、广东
11
号、
广东
6
号、广东
4
号和广东
7
号都是来源于粤北的
英德、从化、花都等地区，该亚类可定义为粤北类
型。Ⅵ-ⅱ中包括广东
61
号、广东
14
号、广东
17
号、广东
13
和广东
16
号
5
份材料，这
5
份材料中
1
份来源于清远，其他四份都来源于广东中部地区
的三水、博罗地区，因此这个亚类可定义为粤中类
型。而Ⅵ-ⅲ亚类中的两份材料广东
78
号和广东
82
号分别来源于广东南部的遂溪、海康地区，因此该