分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1505
-
1510
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1505
-
1510
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1506
年前的真核生物
(
余迪求等
, 2006)
。
WRKY
转录因子能够广泛参与植物的生物与非
生物的胁迫反应,对研究植物抗性具有重要价值。
WRKY
转录因子在转录调控中可作为转录激活子或
抑制子发挥作用
(Xie et al., 2005; Zhang et al., 2004)
。
研究表明,
WRKY
基因属于诱导型基因,可被多种
环境条件诱导
(Dong et al., 2003)
。如拟南芥中
WRKY3
和
WRKY4
编码两个结构相似的
WRKY
转录
因子,它们可被病菌和水杨酸诱导
(Lai et al., 2008)
;
烟草
NtWRKY4
可明显被水杨酸诱导,但逆境胁迫
对其诱导不明显。
250 mmol/L NaCl
盐胁迫和
20%
PEG6000
干旱胁迫同时诱导
GhWRKY4
的基因表
达
(
张娜等
, 2012)
。利用
RNAi
干扰技术,研究发现
烟草
WRKY4
转录因子在叶片生长和生物胁迫方面
具有重要作用,这在
WRKY
家族成员中是很少见的
(Ren et al., 2010)
。
目前,还没有发现关于南瓜
WRKY
基因家族成
员的报道,本文通过克隆美洲南瓜
WRKY4
,并对其
全序列进行生物信息学分析,为进一步研究
WRKY4
在南瓜中的功能及作用奠定基础。
1
结果与分析
1.1
美洲南瓜总
RNA
的提取及
WRKY4
基因中间
序列的获得
提取的美洲南瓜总
RNA
经琼脂糖凝胶电泳检
测,可见
28S
、
18S
和
5S
三条清晰的
rRNA
条带,且
28S
条带的亮度约是
18S
条带亮度的
2
倍
(
图
1)
,表
明
RNA
样品完整性较好,未出现降解。经紫外分光
光度计测定,
A
260nm
/A
280nm
比值在
1.8~2.0
之间,表明
RNA
纯度较高,无
DNA
和蛋白污染。
图
1
美洲南瓜总
RNA
注
: M: DL2000 marker; 1:
总
RNA
Figure 1 Total RNA from Zucchini
Note: M: DL2000 marker; 1: Total RNA
根据
GenBank
上已提交的黄瓜
WRKY4
基因序
列保守区域设计特异性引物
P1
和
P2
,以美洲南瓜
cDNA
为模板,扩增得到一个大约
500 bp
的特异性
产物,对此片段进行回收、克隆、鉴定、测序,得
到一段
497 bp
的
cDNA
序列
(
图
2)
。经
BLAST
分析,
此序列与黄瓜
WRKY4
的同源性达到
87%
,为美洲
南瓜
WRKY4
的一段序列。
图
2
WRKY4
基因扩增产物
注
: M: DL2000 marker; 1: RT-PCR
扩增产物
Figure 2 Amplified product of
WRKY4
Note: M: DL2000 marker; 1: Amplifiedproducts of RT-PCR
1.2
WRKY4
基因
3'
端与
5'
端的获得
根据美洲南瓜
WRKY4
基因中间序列的测序结
果设计
3'RACE
和
5'RACE
特异性引物,分别进行
巢氏
PCR
,均在第二轮扩增产物中获得清晰的特
异性条带。
对扩增产物进行回收、克隆、鉴定后测序,
3'R-
ACE
试验获得
543 bp
的
cDNA
片段
(
图
3A)
,出现的
第一个终止密码子为
TGA
,
3'
端包含一个
105 bp
的
UTR
结构和
13 bp
的多聚腺苷
(polyA)
尾。
5'RACE
试验获得
903
的
cDNA
片段
(
图
3B)
,
包含一个
185 bp
的
UTR
结构。
图
3 3'RACE
和
5'RACE
第二轮
PCR
扩增产物
注
: M: DL2000 marker; A: 3'RACE
第二轮
PCR
扩增产物
; B:
5'RACE
第二轮
PCR
扩增产物
Figure 3 Amplified product of the second round between
3'RACE and 5'RACE
Note: M: DL2000 marker; A: Amplified product of the second
round between 3'RACE; B: Amplified product of the second
round between 5'RACE