分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1458
-
1463
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1458
-
1463
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1461
确剪切,特别是识别位点的突变极易造成内含子的
剪切错误
(
陈县明
, 2010)
。本研究由转基因植株
S1
-
1
形成的纯合后代株系中
AtNPR1
基因所含内含子均
不能切除,测序结果发现,
RT-PCR
扩增的
853 bp
片段中,两个内含子的识别位点都没有发生突变,表
明内含子未剪切不是由识别位点突变引起,
RT-PCR
除扩增出
853 bp
片段,还有表达量稍低
1 165 bp
片
段出现,测序结果显示该片段是基因重排的结果,在
重排的基因中,位于
AtNPR1
基因的
562~640 bp
和
1 377~1 484 bp
间的内含子均未出现在表达序列中,
原位于
1 689~1 798 bp
的内含子只有
1 777~1 789 bp
出现在重排基因中,失去了内含子识别的
5'ss (splice
site)
序列,推测可能是该重排基因的表达干扰了
AtNPR1
基因的正常剪切,未能形成有功能的表达产
物,转基因株系的表型
—
纹枯病抗性未有显著提高。
3
材料与方法
3.1
植物材料
拟南芥为哥伦比亚生态型,为本实验室保存。江
苏里下河地区农科所小麦室提供扬麦
12
号转基因受
体品种,开花后
12~14 d
的小麦幼胚用于转化研究。
3.2
AtNPR1
基因的克隆及载体构建
采用
CTAB
法提取拟南芥叶片
DNA
。根据
At-
NPR1
基因
DNA
序列
(GenBank accession no. EF470-
723)
设计
PCR
扩增引物对
AtNPR1
-
F
:
5'
-
acccgggC-
TGTTGATGGACACCACCATTGATGG
-
3' (
下画线为
引入的
Sma
Ⅰ酶切位点
)
和
AtNPR1-R
:
5'
-
agagctcGC-
AAAAATTACACTAAGAGGCAAG
-
3' (
下画线为
引入的
Sac
Ⅰ酶切位点
)
,以提取的叶片
DNA
为模
板,采用
TaKaRa LA
Taq
酶扩增
AtNPR1
基因,回收
2125 bp
的扩增片段,连接到
pGEM-T
载体
(Prome-
ga)
,产生
pGEM-T-NPR1
质粒,生工生物工程
(
上海
)
有限公司测序,测序结果进行
Blast
验证。
采用限制性内切酶
Sma
Ⅰ和
Sac
Ⅰ双酶切质粒
pGEM-T-NPR1
,获得
AtNPR1
基因,将该基因替换质
粒
pACH25 (Christensen and Quail, 1996)
中的
Sma
Ⅰ
和
Sac
Ⅰ位点间的
gus
基因即获得表达载体
pACN-
PR1
,其中玉米
Ubiquitin
组成型高表达启动子控制
AtNPR1
基因的表达,
bar
基因为筛选标记基因,该
基因抗除草剂
L-PPT (L-phosphinothricin) (
图
1)
。
3.3
小麦转基因植株的获得
小麦转化过程中,质粒提取和包裹金粉以及基
因枪轰击的参数按周淼平等
(2008)
文献略作修改。
基因枪轰击前后用
0.4 mol/L
山梨醇高渗处理幼胚
16 h
,轰击后,在未加选择压的愈伤诱导培养基
(MS
基本培养基添加
2 mg/L 2,4-D)
暗培
4 d
后,转入添
加
3 mg/L L-PPT
愈伤诱导培养基诱导培养
21 d
,抗
性愈伤然后转入分化培养基
(MS
基本培养基添加
1 mg/L KT
和
1 mg/L NAA
以及
3 mg/L L-PPT)
分化
42 d
,再生抗
L-PPT
幼苗转入生根培养基
(1/2MS
添
加
3 mg/L L-PPT)
,待幼苗长至
6~8 cm
长时转移至盆
钵,取叶片样品提取
DNA
用于分子检测,套袋自交
结实收获
T
0
代种子。
T
0
代种子播于
72
孔塑料穴盆中,萌发产生
T
1
代
植株,于
2~3
叶时喷施含
100 mg/L L-PPT
有效成分
的
Basta
除草剂溶液继续筛选,根据
T
1
代植株抗
Basta
的分离结果推断
T
0
代植株是否为转基因阳性植株。
3.4
转基因小麦
AtNPR1
基因的分子检测
采用
CTAB
法抽提抗
Basta
植株的叶片
DNA
,
进行
AtNPR1
基因
PCR
检测,上游引物
(
NPR1
-
F1)
:
5'
-
GAAGGTAGAACCGCACTC
-
3'
;下游引物
(NPR-
1
-
R1)
:
5'
-
GTCGAATCTGTCAGGGAC
-
3'
,预期扩
增片段为
853 bp
,含
108 bp
和
110 bp
的
2
个内含子。
PCR
的总体积为
20 μL
,含
1×Buffer
、
1.5 mmol/L
MgCl
2
、
0.2 mmol/L dNTPs
、
0.5 μmol/L
引物、
50 ng
模板
DNA
、
1 U
Taq
酶
(TaKaRa)
。
PCR
条件为
95
℃
先预变性
3 min
;然后
94
℃
30 s
,
55
℃
45 s
,
72
℃
45 s
,扩增
35
个循环;然后
72
℃延伸
7 min
。
1.0%
琼脂糖凝胶电泳检测分析扩增片段。
3.5
转基因小麦
AtNPR1
基因的表达分析
用
SV Total RNA Isolation System
试剂盒
(Pro-
mega)
提取
T
5
代转基因植株叶片总
RNA
,按照
Prime-Script RT-PCR
试剂盒
(TaKaRa)
说明书合成
cDNA
并进行半定量
RT-PCR
分析,
AtNPR1
基因扩
增引物与分子检测相同,正常表达
(
切除内含子
)
的
预期扩增片段为
635 bp
。采用
18S rRNA
基因作为内
参基因
(18S-QF: 5'
-
GTGACGGGTGACGGAGAAT-
T
-
3'; 18S-QR:5'
-
GACACTAATGCGCCCGGTAT
-
3')
。
PCR
的总体积为
25 μL
,含
1×Buffer
Ⅱ、
0.4 mmol/L
dNTPs
、
0.6 μmol/L
引物、
2 μL cDNA
模板、
1.25 U
Ex
Taq
HS
酶
(TaKaRa)
。
PCR
程序为
95
℃先预变
性
3 min
;然后
94
℃
30 s
,
55
℃
30 s
,
72
℃
45 s
,扩
增
30
个循环;然后
72
℃延伸
7min
。
1.2%
琼脂糖凝
胶电泳检测分析扩增片段。部分扩增产物的测序和
验证同
3.2
。