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分子植物育种
(
网络版
), 2012
,
10
,
1278
-
1286
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1278
-
1286
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1281
3
Cl
MYB4
蛋白的三维空间结构预测及与
At
MYB46
Pt
MYB46
蛋白构象比较
: A, B, C:
分别代表
Cl
MYB4,
At
MYB46
Pt
MYB4
蛋白
R2R3
结构域预测的空间结构
; D:
是已知空间结构蛋白
(1H8CC)
R1R2R3
结构域
,
为同源建模的模板空间结构
Figure 3 Predicted three-D structure of
Cl
MYB4 protein and
compared with
At
MYB46 and
Pt
MYB4 proteins
Note: A, B, C: Predicted three-D structures of R2R3-domain
in
Cl
MYB4,
At
MYB46 and
Pt
MYB4 proteins; D: Three-D
structure of 1H8CC as the template
利用
MEGA 5.0
软件的
Neighbor-Joining
法,构
建了基于蛋白氨基酸序列的系统进化树,如图
4
所研究的蛋白序列一部分为裸子植物火炬松和白
云杉的
R2R3
-
MYB
基因,一部分为桉树和拟南芥
中与次生壁和木质素合成转录调控相关的
MYB
因。结果显示,
Cl
MYB4
与白云杉
Pg
MYB4
,火炬
Pt
MYB4
,桉树
Eg
MYB2
和拟南芥
At
MYB46
为一个亚组,拟南芥
At
MYB46
已被证实是维管发
育决定基因
SND1 (Secondary cell wall related NAC
Domain1)
的直接下游靶基因
(Zhong et al., 2007)
,负
责次生壁合成过程的转录调控。其他裸子植物
MYB
基因中,
Pg
MYB2
Pt
MYB2
Pt
MYB3
Pt
MYB7
Pt
MYB1
Pt
MYB8
Pg
MYB1
各自聚为一个小类,
说明
Cl
MYB4
与白云杉
Pg
MYB4
,火炬松
Pt
MYB4
的亲缘关系最近。此外,拟南芥
At
MYB58
At
MYB63
单独聚为一类,而桉树
Eg
MYB2
和火炬
Pt
MYB14
聚为一类。
4
基于氨基酸序列构建的
Cl
MYB4
系统发育树
:
方框内为参与次生壁合成调控的
R2R3-MYB
基因蛋白
亚族
Figure 4 Phylogenetic tree based on amino acid sequences of
Cl
MYB4
Note: The box indicated the R2R3-MYB protein subgroup
related to secondary cell wall biosynthesis
1.3
杉木
MYB
基因的原核表达条件优化
将构建正确的原核表达载体质粒
pET
-
30b-
Cl
MYB4
转化大肠杆菌
Rosetta
菌株。挑选阳性克
隆子在
37
℃条件下采用
IPTG
浓度
0.01 mmol/L
0.1 mmol/L
1 mmol/L
诱导后,
SDS-PAGE
电泳显
示目的蛋白
Cl
MYB4
均可以表达,但是
Cl
MYB4
蛋白
(70 kD,
如图
5)
的大小与预测蛋白分子量大小
(54 kD)
不太一致。不同的
IPTG
对重组蛋白表达的
诱导影响不明显,
0.1 mmol/L
1 mmol/L IPTG
诱导
的效果较好,因此,我们选择
0.1 mmol/L IPTG
为大量诱导重组蛋白表达的使用浓度。
1.4
杉木
MYB
基因原核表达蛋白的纯化
分析发现
Cl
MYB4
重组蛋白不是以可溶性蛋
白形式存在,而是主要存在于大肠杆菌的包涵体