Basic HTML Version
分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1087
-
1091
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1087
-
1091
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1087
研究报告
A Letter
元阳梯田月亮谷与测序水稻日本晴多态性
SSR
标记筛选
何玉忠
1,2
,
高东
1
,
何霞红
1
,
余磊
3
1
云南农业大学农业生物多样性应用技术国家工程中心
,
昆明
, 650201
2
元阳县新街镇农业综合服务中心
,
元阳
, 662416
3
昆明学院
,
昆明
, 650214
通讯作者
: gaodong521@yahoo.com.cn;
作者
分子植物育种
, 2012
年
,
第
10
卷
,
第
11
篇
doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0011
收稿日期：
2012
年
03
月
12
日
接受日期：
2012
年
03
月
24
日
发表日期：
2012
年
04
月
26
日
这是一篇采用
Creative Commons Attribution License
进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用
,
版权所有人允许并同意第三方无条件的
使用与传播。
建议最佳引用格式：
引用格式
(
中文
)
：
何玉忠等
, 2012,
元阳梯田月亮谷与测序水稻日本晴多态性
SSR
标记筛选
,
分子植物育种
(online) Vol.10 No.11 pp.1087-1091 (doi: 10.5376/mpb.
cn.2012.10.0011)
引用格式
(
英文
)
：
He et al., 2012, Screening Polymorphic SSR Markers between Yuelianggu in Yuanyang Terrace and Sequenced Variety Nipponbare, Fenzi Zhiwu Yuzhong
(online) (Molecular Plant Breeding) Vol.10 No.11 pp.1087-1091 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0011)
摘
要
试验以元阳梯田月亮谷为材料，利用水稻
387
对
SSR
标记，与测序品种粳稻日本晴的基因组进行比较，共筛选到
月亮谷与日本晴具多态性的标记
164
条，占有效扩增引物的
50.5%
。多态性标记间隔均匀，可用于构建分子遗传图谱。这些
标记对于构建地方品种基因的渗入系或近等基因系、定位克隆地方品种有益基因具有重要作用。
关键词
水稻
;
微卫星标记筛选
;
哈尼梯田
;
地方品种
;
日本晴
Screening Polymorphic SSR Markers between Yuelianggu in Yuanyang Terrace
and Sequenced Variety Nipponbare
He Yuzhong
1,2
, Gao Dong
1
, He Xiahong
1,2
, Yu Lei
3
1 The National Center for Agricultural Biodiversity, Yunnan Agricultural University, Kunming, 650201
2 Agricultural Comprehensive Service Center of Xinjie Town, Yuanyang, 662416
3 Kunming University, Kunming, 650214
Corresponding author
Authors
Abstract
Rice genome of Yuelianggu in Yuanyang terrace was compared with that of Nipponbare using 387 pairs of SSR markers.
164 pairs of polymorphism markers from Yuelianggu and Nipponbare were selected, and they are 50.5 percent of all effective
amplification primer pairs. The interval of these polymorphic SSR markers was even and they could be used to construct a molecular
genetic map. These polymorphism markers are important in constructing introgression lines or near-isogenic lines of local varieties
and in cloning desirable genes of local varieties.
Keywords
Oryza sativa
L.; SSR marker selection; Hani terrace; Landraces; Nipponbare
研究背景
云南边远少数民族地区，地方水稻品种资源
丰富，元阳梯田永续发展的稻作“人工湿地”保
存并仍在栽种着大量地方稻种资源
(
高东等
,
2009b)
，此类地方稻种资源具有育成品种所遗失
的优异种质，是水稻育种、起源和进化研究不可
缺失的过渡材料。有关元阳梯田水稻地方多样性
的研究较少，所见报道主要集中在普查整个稻作
系统水稻地方品种数多样性
(
徐福荣等
, 2010a)
及
其遗传多样性
(
白秀红等
, 2012)
；在农业发展进程
中，元阳不同时期水稻地方品种表型多样性
(
徐福
荣等
, 2010b)
和遗传多样性
(
徐福荣等
, 2011)
的变
化；以自然村为单位当前种植水稻地方品种的遗
传多样性
(
高东等
, 2011b)
；不同收集地当前主栽
水稻地方品种内部遗传异质性解析
(
高东等
,
2009b)
；当前主栽水稻地方品种和现代品种的内