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分子植物育种
(
网络版
), 2011
年
,
第
9
卷
,
第
1619
-
1625
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2011, Vol.9, 1619
-
1625
http://mpb.
5th
.sophiapublisher.com
1619
研究报告
A Letter
13
个国兰品种遗传关系的
SRAP
分析
何俊蓉
1
,
蒋彧
1
,
孙淑霞
1
,
刘菲
12
,
叶兰香
1
,
王海娥
1
,
卓碧萍
1
1.
四川省农业科学院园艺所
,
成都
, 610066
2.
西南交通大学
,
成都
, 610031
通讯作者
: junrh@126.com;
作者
分子植物育种
, 2011
年
,
第
9
卷
,
第
86
篇
doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0086
收稿日期：
2011
年
05
月
20
日
接受日期：
2011
年
06
月
24
日
发表日期：
2011
年
06
月
29
日
这是一篇采用
Creative Commons Attribution License
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,
版权所有人允许并同意第三方无条
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引用格式：
何俊蓉等
, 2011, 13
个国兰品种遗传关系的
SRAP
分析
,
分子植物育种
Vol.9 No.86 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0086)
摘
要
本研究利用
64
对
SRAP
引物对国兰
13
个品种进行遗传亲缘关系分析。从
64
对引物中筛选出
57
对多态性高的引
物，共产生
746
条扩增带，其中有
738
个多态性位点，总的位点多态性比率为
98.9%
，平均每对引物组合产生的位点数为
13
个位点；采用
ntsyspc2.02
软件对国兰
13
样品的
SRAP
扩增结果进行统计分析，国兰样品间的相似性系数分布在
0.625~0.831
之间；利用
UPMGA
类平均聚类法对遗传相似系数进行分析并构建系统树，聚类结果与传统分类基本一致，初步证明利用
SRAP
分子标记技术对国兰进行亲缘关系分析的可靠性。
关键词
国兰
; SRAP;
遗传多样性
Genetic Relationships Analysis of 13 Cultivars of Chinese Cymbidium Based on
SRAP Molecular Markers
He Junrong
1
, Jiang Yu
1
, Sun Shuxia
1
, Liu Fei
1,2
, Ye Lanxiang
1
, Wang Hai’e
1
, Zhou Biping
1
1.Institute of Horticulture, Sichuan Academy of Agricultural Sciences, Chengdu, 610066, P.R. China
2.China Southwest Jiaotong University, Chengdu, 610031, P.R. China
Corresponding author, junrh@126.com;
Authors
Abstract
This research analyzed the genetic diversity of the 13
Chinese Cymbidium
samples through 64 SRAP primer pairs. 746
bands were generated by selected 57 highly polymorphic primer pairs, with each primer combination generated average 13 bands,
and 738 polymorphic bands were detected, accounting for 98.9% of the total. The similarity coefficient between samples distributed
between 0.625-0.831 with software ntsyspc2.02.Meanwhile, we calculated the genetic similarity coefficient by NTSYS-pc and
constructed the dendrogram by UPMGA. The clustering results are basically consistent with the traditional classification, the
preliminary proof proved that it was reliable to analyze the genetic relationship of China orchid with SRAP molecular markers.
Keywords
Chinese
Cymbidium
; SRAP; Genetic diversity
研究背景
SRAP
又称为基于序列扩增多态性
(Sequence
Based Amplified Polymorphism, SBAP)
是由美国加
州大学蔬菜系
Li
和
Quiros
博士于
2001
年正式提出
的一种基于
PCR
的新型分子标记技术
(Li and
Quiros, 2001)
。该标记采用一对引物对开放阅读框
(ORFs)
进行扩增，上下游引物分别针对基因外显子
中
GC
含量丰富和启动子、内含子中
AT
含量丰富
的区域进行扩增。因不同个体的内含子、启动子与
间隔区长度不等而产生多态性
(
张彤等
, 2009)
。
SRAP
标记具有简便、稳定、中等产率、不需预知
物种的序列信息的特点，近年来已应用于植物遗传
多样性分析、种质鉴定、遗传图谱构建、目的基因
寻找及其定位和比较基因组学研究
(Ferriol et ai.,
2004; Budak et al., 2004; Li et al., 2003; Fu et al.,
2007)
，尤其在蔬菜
(
朱坚等
, 2007;
王惠哲等
, 2009;
雷剑和柳俊
, 2006;
吴红等
, 2009)
、水果
(
马明等
,
2007;
昝逢刚等
, 2009;
曾柏全等
, 2008)
、农作物
(
武
志朴等
, 2005;
吴洁等
, 2005;
徐进等
, 2008;
秦贺兰
等
, 2010;
林忠旭等
, 2004)
以及药用植物
(
齐树杰等
,