张永辉等
, 2011,
基于
ITS
和
cpDNA
序列的中国野生葡萄分子系统进化
,
分子植物育种
Vol.9 No.78 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0078)
1573
图
2 30
个
ITS
序列克隆的部分序列比对结果
Figure 2 Partial Sequence alignment results from 30 ITS sequence data
在分支
D
中,
‘
变叶葡萄
0958’
、
‘
灵宝秋葡萄
’
、
‘
都安毛葡萄
’
、
‘
云南葡萄
01’
、
‘
腺毛变叶
’
、
‘
嵩县桦
叶葡萄
’
、
‘
桑叶葡萄
943’
、
‘
罗城腺枝
01’
、
‘
菱叶葡萄
0945’
和
‘
山葡萄
0933’9
个种的亲缘关系较近,其中山
葡萄、毛葡萄为广泛分布种,在国内
20
个省均有分
布,变叶葡萄、桦叶葡萄、桑叶葡萄、腺枝葡萄、秋
葡萄在国内
10
个以上的省份中分布,菱叶葡萄和云
南葡萄分布范围狭窄
(
孔庆山
, 2004)
。上述种在地理
分布及形态特征上均存在较大差异,但其亲缘关系较
近,推测上述9个种在进化过程中具有共同的母本祖
先,并随着不同种间基因的交流和对各自生存环境的
适应而发生进化。
‘
湖南刺葡萄
’
、
‘
美丽葡萄
1104’
、
‘
卢
氏网脉
02’
、
‘
葛藟
0943’
、
‘
华东葡萄
1057’
、
‘
灵宝变
叶
01’
、
‘
燕山葡萄
0947’
、
‘
舞钢庙街蘡薁
’
和分枝
D
各为一类,呈并列关系,各自独立进化。上述结果表
明我国葡萄属种质资源的遗传多样性较为丰富,是阐
明世界葡萄起源、演化和生物多样性必不可少的重要
证据。
2.2 ITS
序列聚类分析
植物体中存在数以万计的核糖体基因拷贝的
串联重复,而
ITS
序列在协同进化
(Concerted
evolution)
过程中的均质化不完全和假基因的存在
等原因,可能会在同一个体内存在多个
ITS
序列
(A´lvarez and Wendel, 2003)
。在
PCR
过称中添加
4%
的
DMSO
能够有效除去假基因
(
郑小艳等
, 2006)
,
但
‘
灵宝变叶
01’
、
‘
变叶葡萄
0958’
、
‘
卢氏网脉
02’
、
‘
燕山葡萄
0947’
、
‘
菱叶葡萄
0945’
、
‘
玫瑰香
’
、
‘
河
岸葡萄
6402’
和
‘
代克赛
’
仍存在多重核糖体
DNA
序