施涯邻等
, 2011,
高质量木薯根
,
茎
,
叶总
RNA
和总蛋白样品的制备方法
,
分子植物育种
Vol.9 No.67 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0067)
1495
100 mmol/L Tris-Hcl pH 8.0, 10 mmol/L EDTA, 1%
SDS,
用
DEPC-H
2
O
配制并高温灭菌
)
和
6 mL
水饱和
酚于离心管中。
(2)
取
0.5 g
新鲜木薯组织,液氮充分
研磨成粉末后,迅速转移至准备好的离心管中,震荡
30 s
,再加入
6 mL
氯仿并震荡
30 s
,
4
℃,
12 000 r/min
离心
10 min
,取上清。
(3)
加入等体积氯仿,
4
℃,
12 000 r/min
离心
10 min
,取上清。
(4)
将上清转移到
新的离心管中,每管分装
200 µL
上清,加入等体积
的
4 mol/L LiCl
溶液,混匀后-
80
℃放置至少
1 h
。
(5)4
℃,
12 000 r/min
离心
20 min
,弃上清,加入
900
µL 75%
乙醇,
4
℃,
12 000 r/min
离心
5 min
,沉淀自
然干燥。
(6)
每管再加入
500 µL RNA
提取缓冲液,涡
旋振荡溶解沉淀后,再加入
600 µL 4mol/L LiCl
,混
匀后-
80
℃放置至少
1 h
。
(7)
重复步骤
(5)
,使用
75%
乙醇清洗沉淀
2
次,自然干燥后每管加入
20 µL
DEPC-H
2
O
溶解。冻存于-
80
℃。
3.4
木薯总蛋白提取
(1)
取木薯根、茎、叶各
1 g
,液氮充分研磨,转
移至离心管中,并加入
4 mL SDS
提取缓冲液
(6%
Tris, 5%
甘油
, 1% SDS, 2% DTT, 10 mmol/L
硫脲
,
2% PVPP, pH 7.5)
。
(2)
室温振荡
30 min
,
4
℃,
12 000
r/min
离心
30 min
,取上清。
(3)
加入
3
倍体积-
20
℃预
冷的
TCA
-丙酮溶液
(
含
10% TCA, 0.07% β
-
ME)
,
-
20
℃放置至少
2 h
。
(4)4
℃,
12 000 r/min
离心
30 min
,
弃上清,用-
20
℃预冷的丙酮
(
含
0.07% β
-
ME)
洗涤
沉淀
3
次。
(5)
蛋白质沉淀真空干燥后,加入适量蛋
白裂解液
(7 mol/L
尿素
, 2 mol/L
硫脲
, 4% CHAPS,
1% DTT)
,
4
℃溶解沉淀。
(6)4
℃,
12 000 r/min
离心
30 min
,取上清。
(7)2
-
D Clean-Up Kit
纯化,
Bradford
法测定蛋白浓度后,分装,-
80
℃保存。
作者贡献
施涯邻、王金子和王志强是本研究的实验设计和实验研
究的执行人,并完成数据分析,论文初稿的写作;蒙姣荣和
罗兴录参与实验设计,试验结果分析;陈保善是项目的构思
者及负责人,指导实验设计,数据分析,论文写作与修改。
全体作者都阅读并同意最终的文本。
致谢
本研究由国家自然科学基金课题
(
基于转录组学和蛋白
组学的木薯新种质创建的基础研究
, 30960203)
和广西科技
基础条件平台建设项目
(09
-
007
-
01, 10
-
046
-
02)
资助。特别
感谢广西大学国家重点实验室技术支撑组的工作人员对本
实验的支持。
参考文献
Carpentier S.C., Witters E., Laukens K., Deckers P., Swennen R.,
and Panis B., 2005, Preparation of protein extracts from
recalcitrant plant tissues: An evaluation of different methods
for two-dimensional gel electrophoresis analysis, Proteomics,
5(10): 2497-2507
Cathala G., Savouret J.F., Mendez B., West B.L., Karin M.,
Martial J.A., and Baxter J.D., 1983, Amethod for isolation of
intact, translationally active ribonucleic acid, DNA, 2(4):
329-335
Chirgwin J.M., Przybyla A.E., MacDonald R.J., and Rutter W.J.,
1979, Isolation of biologically active ribonucleic acid from
sources enriched in ribonuclease, Biochemistry, 18(24):
5294-5299
Chomczynski P., and Sacchi N., 1987, Single-step method of
RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-
chloroform extraction, Analytical Biochemistry, 162(1):
156-159
Damerval C., De Vienne D., Zivy M., and Thiellement H., 1986,
Technical improvements in two-dimensional electrophoresis
increase the level of genetic variation detected in
wheat-seedling proteins, Electrophoresis, 7(1): 52-54
Gorg A., Postel W., Domscheit A., and Gunther S., 1988,
Two-dimensional electrophoresis with immobilized pH
gradients of leaf proteins from barley (
Hordeum vulgare
):
method, reproducibility and genetic aspects, Electrophoresis,
9(11): 681-692
Hurkman W.J., and Tanaka C.K., 1986, Solubilization of plant
membrane proteins for analysis by two-dimensional gel
electrophoresis, Plant Physiology, 81(3): 802-806
Isaacson T., Damasceno C.M., Saravanan R.S., He Y., Catala C.,
Saladie M., and Rose J.K., 2006, Sample extraction
techniques for enhanced proteomic analysis of plant tissues,
Nature Protocols, 1(2): 769-774
Logemann J., Schell J., and Willmitzer L., 1987, Improved
method for the isolation of RNA from plant tissues,
Analytical Biochemistry, 163(1): 16-20
Newbury H.J., and Possingham J.V., 1977, Factors affecting the
extraction of intact ribonucleic Acid from plant tissues
containing interfering phenolic compounds, Plant Physiology,
60(4): 543-547
Oates C.G., 1997, Towards an understanding of starch granule
structure and hydrolysis, Trends in Food Science &
Technology, 8(11): 375-382