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李跃飞等
, 2011,
大白菜桔红心基因
or
的
SSR
标记定位
,
分子植物育种
Vol.9 No.53(doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0053)
1396
表
2 3
个
SSR
标记在
F
2
代桔红心单株中的分离
Table 2 Segregation of 3 SSR markers in 154 orange head inner leaf individuals of F
2
population
标记
Markers
桔红心单株数
No. of lines with orange
head leaf
未交换单株数
No. of lines with marker
交换单株数
No. of lines without marker
重组率
(%)
Recombinant
frequency (%)
EN A 21
154
90
64
21.3
Sau (N) 033
154
93
61
20.3
Sau (C) 586
154
149
5
1.7
得到的
2
个标记经分析得知遗传距离分别为
25.4 cM
和
24.4 cM
，来自于大白菜
A 9
连锁群。为
了进一步找到连锁更为紧密的标记，在
A 9
上位于
标记
ENA 21
、
sau (N)03 25 cM
附近区域内选取
SSR
标记，共选出
5
对引物
sau (C) 343
、
sau (C) 119
、
sau
(N) 129
、
sau (C) 586
和
sau (C) 601
。在亲本间这
5
对引物均表现出多态性，通过对
154
株桔红心单株
进行验证，最终得到了一个连锁较为紧密的标记
sau (C) 586
，在亲本
07 A 163
和基因池中扩增出一
条同等大小的特异性条带，与在亲本
Chiifu
上得到
的条带差异明显
(
图
1)
，在所有桔红心单株中只有
5
株发生交换，经遗传距离估算得知此标记距离
or
仅
1.6 cM
，
3
个标记的引物信息见表
3
。
图
1 sau(C)586
在双亲以及
F
2
代纯合隐性单株
(
部分
)
中的扩增结果
注
: M: Marker; P
1
(OrOr)
: Chiifu; P2
(oror)
: 07A163; 1~28:
桔红心单株
(
ror
); *:
重组个体
Figure 1 Amplification of sau(C)586 in two parents and homozygous or allele individuals of F
2
population (only parts were
shown in this figure)
Note: M: Marker; P
1
(OrOr)
: Chiifu; P
2
(oror)
: 07A163; 1~28: orange head inner leaf individuals
(oror)
; *: recombinants
表
3
标记
or
基因的
SSR
引物及其序列
Table 3 SSR primer pairs and their sequences marked gene or
标记
Markers
上游引物
Forward primer sequences
下游引物
Reverse primer sequences
图距
(cM)
Map distance (cM)
ENA21
GAGTGTTTGGAGCAGATGA
GGAGACTTTGCCTTTGTGT
25.4
sau(N)033
GCCAGATACGTTGCAGGTTT
TTGACATACCTGCATACTCAAAAGA
24.4
sau(C)586
AGGCTGCTGTCTCTCTCTCG
TGGGGTGATTAAGTGGTCAA
1.6