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翟荣荣等
, 2011,
水稻杂种优势分子遗传基础的研究进展
,
分子植物育种
Vol.9 No.50 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0050)
1378
当然,多数情况下杂种优势是由多基因调控的
(Birchler, 2010)
。因此,在今后杂种优势的研究中我
们应突破常规想法,多方面研究杂种优势的分子遗
传基础。
4.2
材料构建的突破
杂种优势是生物学领域的一项世界性难题,阐
明杂种优势形成的分子机理对大幅度提高主要农
作物单产具有重要的指导意义。随着分子数量遗传
学的飞速发展,
QTL
定位方法的建立为从分子水平
上理解杂种优势的遗传机理奠定了基础。前人已经
定位了大量重要性状杂种优势
QTL
位点,但研究
材料多为
F
2
F
3
群体,永久
F
2
群体,重组自交系
群体和回交群体,研究结果存在重复性差、基因型
构成缺乏完整性或基因频率偏离等问题,难以全面
解释杂种优势的遗传基础。因此,在今后的研究中,
在初定位的基础上,鉴定控制该性状杂种优势的主
QTLs
,构建覆盖全基因组的含有目标
QTL
的基
因渗入系对杂种优势
QTL
精细定位,为杂种优势
QTL
的克隆奠定材料基础。
4.3
研究方法上的突破
在杂种优势机理的研究中,需进一步分析杂种
与双亲在转录表达谱和蛋白质表达谱的差异,分析
这些差异基因和蛋白质的功能及参与的代谢途径,
为杂种优势复杂的调控网络研究提供依据。随着新
一代高通量测序技术的发展,
RNA-Seq
已成为基因
表达和转录组分析的一种新的手段,也为杂种优势
机理的研究提供了一条新的途径。另外,从表观遗
传学角度研究亲本基因在杂合状态下的表达调控
方式,包括
DNA
修饰以及在水稻中尚未开展起来
的蛋白质修饰和非编码
RNA
与水稻杂种优势的关
系,将有助于杂种优势机理的深入研究。高通量测
序技术的发展也促进了
SNP
分型技术被程序化使
用,在理想分离群体和
SNP
分型技术的基础上,建
立超高密度的连锁图谱
(Xie et al., 2010)
,将促进从
全基因组水平上解析水稻杂种优势。除此之外,越
来越多的研究表明,杂种优势与植株的倍性存在联
(Chen, 2010)
,因此我们应开阔眼界,综合考虑,
深入研究杂种优势的分子机制。
4.4
性状的关联度分析
杂种优势是一种极其复杂的生物学现象,由多
个基因位点共同控制,杂种优势程度又因不同性状
而异。另外杂种优势表现在整个生长发育时期,并
且作物生长发育是一个动态的过程,其基因的表达
与调控也处于一个变化的过程中。因此,应从特定
性状分析入手,从发育生物学的角度研究整个生长
发育进程中该性状杂种优势的形成机理,并结合生
物信息学,基因组学,蛋白质组学等多学科先进技
术,从多个层面上研究,综合分析,最终揭示杂种
优势的遗传基础。
4.5
杂种优势的预测
随着水稻杂种优势的广泛应用,人们一直致力
于寻找一种能快速准确筛选优良亲本、预测水稻杂
种优势的方法。早期以杂种优势的生理生化研究为
基础预测杂种优势存在很大的局限性,分子标记的
发展为杂种优势的预测提供了新的手段。杂种优势
有着复杂的生物学基础,分子标记间遗传距离与杂
种优势之间的相关与否,与所选材料、所选标记多
少、所选标记与目标性状的
QTL
连锁程度等诸多
因素有关。
Melchingerden
(1990)
Boppenmaier
(1993)
提出的应用与杂种优势有关的分子标记的
研究策略和
Zhang
(1994, 1995, 1996)
提出的特殊
杂合性的度量方法为杂种优势预测提供了新的思
路。因此,利用分子标记预测杂种优势应从以下几
个方面改善:
1.
选择与杂种优势相关且贡献率较大
QTL
2.
增加与杂种优势有关的
QTL
的覆盖率;
3.
结合分子标记技术系统划分水稻杂种优势群。玉
米作为杂种优势预测研究和应用最好的作物,目前
通过转录谱分析来预测杂种优势在玉米中取得进
(Fisch et al, 2010; Thiemann et al., 2010)
,然而在
水稻中发展缓慢,我们应加快此领域的发展,为水
稻杂种优势的利用奠定基础。
相信随着现代分子生物学理论和技术的发展
以及研究的进一步深入,包括其他作物杂种优势机
理研究的推进,在不久的将来,水稻杂种优势的遗
传机理将被人们所认识,杂种优势利用必将取得新
的突破。
作者贡献
翟荣荣、冯跃、曹立勇、程式华是本研究进展的研究设