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盖红梅等
, 2011, SSR
数据处理宏程序
DataTrans 1.0,
分子植物育种
Vol.9 No.48 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0048)
1364
图
6 DataTrans 1.0
的输出数据
(Popgene
软件所需数据格式
)
Figure 6 Output data of DataTrans 1.0 (For Popgene software)
4
讨论
微卫星标记由于数量丰富，覆盖整个基因组，
多态性高且呈共显性遗传等优点而被广泛应用于
动植物
QTL
定位、关联分析及群体遗传学研究。
随着研究的深入，对微卫星标记检测位点数的要求
越来越高，而高通量基因型检测的成功实施使检测
大量微卫星标记成为可能。随之而来的是海量的
SSR
数据的整理总结及多层面分析，因此必然会用
到多种群体遗传学软件和软件包，比如
Ntsys
、
Popgene
、
PowerMarker
、
Structure
、
Tassel
等。但不
同的软件往往需要不同的输入格式，即
SSR
原始采
集数据必须转换多种格式进行运算，这给数据分析
增添很多负担。因此，
DataTrans 1.0
软件的开发解
决了
SSR
数据格式人工转换费时、费力且容易出错
的难题，为
SSR
数据的深入分析提供了有力保障。
DataTrans 1.0
软件基于
Excel
的
VBA
语言，以
Excel
为载体，拥有简洁的操作界面，因此，只要
用户能进行
Excel
的基本操作，便能直接利用
DataTrans 1.0
进行数据格式转换，节省了大量学习
相应软件输入格式和数据整理的时间，同时极大的
提高了转换的准确性。原始数据量越大，越能体现
出
Datatrans 1.0
的方便、高效和准确的优势，应用
该软件能在数分钟之内完成人工数月之久的工作。
另外，基于
Excel
宏开发的
Datatrans 1.0
还具有无
须安装、不产生系统垃圾、可随意拷贝、节省磁盘
空间等对用户十分友好的特性，是广大群体遗传学
研究人员不可或缺的桥梁工具。
与其他数据转换软件如
Genetix
，
MSTools 3
等
相比较，
DataTrans 1.0
对用户更加友好，可以实现
从原始的
“bp”
数据或
“0, 1”
数据开始转换，符合多数
学者对
SSR
数据的保存和使用习惯，而
Genetix
的
格式转换并非原始数据转换而是等位变异频率数
据的转换，且为法语版本。此外在支持的文件格式
上也有较大区别，
DataTrans 1.0
对新近的一些常用
分析软件提供了更多的支持，有利于研究人员采用
新软件、新算法进行数据分析。今后
DataTrans 1.0
还会进一步完善，将向着对更多分析软件提供支持
和更加方便友好的方向发展。
作者贡献
盖红梅和任民是本研究的实验设计和实验研究的执行
人，盖红梅完成论文初稿的写作，任民完成论文的修改。全
体作者都阅读并同意最终的文本。
致谢
感谢青岛市科技计划
(10-3-4-14-1-jch
，
09-1-1-69-nsh)
，
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项
(0032010038)
和国家小麦现代产业技术体系建设专项经费
(2060302-2-2)
资助。感谢中国农业科学院作物科学所张学勇研究员的示例
数据支持和对文稿的修改润色，王兰芬副研究员在
DataTrans 1.0
开发过程中给予的宝贵建议和意见。
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