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分子植物育种
(
网络版
), 2011
年
,
第
9
卷
,
第
1351
-
1358
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2011, Vol.9, 1351
-
1358
http://mpb.
5th
.sophiapublisher.com
1351
研究报告
A Letter
高粱
SSR
技术体系的优化及分子连锁图谱的构建
王海莲
1
,
秦岭
1
,
管延安
1,2
,
张华文
1
,
杨延兵
1
,
王洪刚
2
,
李斯深
2
1.
山东省农业科学院作物研究所
,
济南
, 250100;
2.
山东农业大学农学院
,
泰安
, 271018
通讯作者
: Yguan65@yahoo.com.cn;
作者
分子植物育种
, 2011
年
,
第
9
卷
,
第
47
篇
doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0047
收稿日期：
2011
年
03
月
10
日
接受日期：
2011
年
04
月
13
日
发表日期：
2011
年
04
月
19
日
这是一篇采用
Creative Commons Attribution License
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,
版权所有人允许并同意第三方无条
件的使用与传播。
引用格式：
王海莲等
, 2011,
高粱
SSR
技术体系的优化及分子连锁图谱的构建
,
分子植物育种
Vol.9 No.47 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0047)
摘 要
分子遗传图谱是高粱重要农艺性状定位及目的基因克隆的基础，而快速高效的
SSR
分子标记技术是保证实验成功的
前提。以普通高粱石红
137
和甜高粱
L-
甜及其杂交衍生的
F
2
群体为材料，首先从
SSR
反应体系的大小，聚丙烯酰胺凝胶的
浓度以及银染染色的步骤进行了比较研究。结果显示，采用
10 µL PCR
反应体系，
6%
的非变性聚丙烯酰胺凝胶进行电泳和
快速银染法进行染色可以得到理想的目的条带。以上述优化的
SSR
技术体系为基础，构建了一个包含
118
个
SSR
位点的遗
传连锁图谱，共
15
个连锁群，覆盖高粱基因组的
1884.6 cM
，标记间平均距离为
15.97 cM
。该
SSR
技术优化体系和分子连
锁图谱将为高粱重要农艺性状的定位以及分子标记辅助选择奠定基础。
关键词
高粱
; SSR
优化
;
稳定性
;
分子连锁图谱
Optimization of SSR Technology System and Construction of Molecular Genetic
Map of Sorghum
Wang Hailian
1
, Qin Ling
1
, Guan Yanan
1,2
, Zhang Huawen
1
, Yang Yanbing
1
, Wang Honggang
2
, Li
Sishen
2
1. Crop Research Institute, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, 250100, P.R. China
2. College of Agronomy, Shandong Agriculture University, Taian, 271018, P.R. China
Corresponding author, Yguan65@yahoo.com.cn;
Authors
Abstract
Molecular genetic map is an essential prerequisite for studying QTL for molecular breeding and map-based gene cloning.
Highly efficiency SSR technology could guarantee the successful experiment. With the 186 F
2
individuals derived from a cross of
normal sorghum inbred line Shihong 137 and sweet sorghum inbred line L-tian, PCR reaction system size, polyacrylamide gel
concentration and silver dyeing steps were investigated. Results showed that the combination of 10 µL PCR reaction system, 6% of
the polyacrylamide gel electrophoresis and rapid silver dyeing steps could satisfy the requirement of experiment. Based on above
optimized method, a linkage map for sorghum spanned a distance of 1884.6 cM with an average distance between markers of 15.97 cM
was developed with 118 SSR markers. The SSR optimization system and molecular linkage map will lay the foundation for the
mapping of genes controlling important agronomic traits and molecular marker assisted selection.
Keywords
Sorghum; SSR; Optimization; Stability, Molecular genetic map
研究背景
甜高粱是普通高粱的一个变种，为
C
4
植物，不
仅光合效率高，杂种优势强，而且具有抗旱和抗离
子毒害的双重抗性，较其它作物更适应盐碱及干旱
环境生长。因此既有
“
高能作物
”
，又有
“
作物中的骆
驼
”
的美誉。同时高粱具有较小的基因组，已经完
成全基因组测序
(Paterson et al., 2009)
。鉴于上述种
种优点，高粱逐渐成为研究谷类作物基因组结构、
功能和进化的模型。
第一张高粱分子遗传连锁图谱由
Hulbert
等
(1990)
报道，利用玉米
RFLP
探针构建了具有
8
个连
锁群的图谱。随后，一些研究者利用玉米和高粱
RFLP
探针，构建了高粱连锁图谱
(Whitkus et al.,
1992; Berhan et al., 1993; Pereira et al., 1994; Lin et
al., 1995; Tuinstra et al., 1996; Dufour et al., 1997)
。
构建图谱所用的作图群体多数是
F
2
群体，少数是