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黄文静等
, 2011, SRAP
和
RGA
标记技术在甘薯的抗茎线虫病遗传多样性中的应用
,
分子植物育种
Vol.9 No.46 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0046)
1345
图
1
部分
SRAP-RGA
扩增结果图谱
注
: M: 2 000 bp marker; 1:
红冬
; 2:
徐
55-1; 3: 44104; 4:
徐
22; 5:
徐
23; 6:
青农
2
号
; 7:
宁紫
1
号
; 8:
潮薯
; 9:
渝紫
1
号
; 10:
徐紫糯
; 11:
水果甘薯
; 12:
徐
55-2; 13:
台农
69; 14:
559; 15:
胜利百号
; 16:
徐
55-1; 17: 44104; 18:
徐
55-2
Figure 1 The profile of SRAP-RGA amplification
Note: M: 2 000 bp marker; 1: Hongdong; 2: Xu55-1; 3: 44104;
4: Xu22; 5: Xu23; 6:
Qingnong2; 7: Ningzi1; 8: Chaoshu; 9:
Yuzi1; 10:
Xuzinuo; 11: Shuiguoganshu; 12: Xu55-2; 13:
Tainong69; 14: 559; 15: Shenglibaihao; 16: Xu55-1; 17: 4 04;
18: Xu55-2
1.2
聚类分析结果
根据
SRAP-RGA
标记对
50
个甘薯品种扩增结
果进行数据统计，应用
UPGMA
法对
50
个品种进行
聚类分析，结果见图
2
。
结果显示：在相似系数为
0.58
时，将
50
个品种
划分为
3
大类群
(
图
2)
。第一类包括
32
个品种：皖
702
、
二黄、
199029-1
、
559
、南薯
88
、美Ⅰ、徐
55-2
、川
山紫、广菜
2
号、青农
2
号等；第二类包括
12
个品种：
美国红薯、
44104
、水果甘薯、潮薯、宁紫
1
号、徐
紫
13-4
、徐
23
、济薯
18
、徐紫薯、徐
18
等；第三类
包括
6
个品种：徐
22
、
C-14
、
59
、潮薯
1
号、福薯
11
号、徐
78-1
。
1.3 SRAP-RGA
扩增产物的抗茎线虫病遗传多样性
分析
根据多态性条带统计结果，采用
NTSYS
软件计
算出甘薯种质间的相似系数，结果表明，
50
份材料
间的相似系数范围较广，在
0.2~0.8
之间。在所有材
料中，徐紫薯
(48)
和二黄
(2)
、
199029-1(3)
遗传相似
性系数最小，为
0.2
，说明他们之间的遗传距离较远，
而鲁
78066(12)
和徐
781(50)
、徐
55-2(7)
和徐
55-1(15)
的相似性系数较大，为
0.8
，说明他们之间的遗传距
离较近，而且徐
55-2(7)
和徐
55-1(15)
均感甘薯茎线
虫病
(
周忠等
, 2005)
。
图
2 SRAP-RGA
技术扩增甘薯基因组的聚类分析图
Figure 2 The dendrogram of the sweetpotato based on SRAP
and RGA marker analysis