叶春秀等
, 2011,
应用
RAPD
分析新疆六个核桃品种的遗传多样性
,
分子植物育种
Vol.9 No.43 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0043)
1330
µL
,
dNTPs (10 mmol/L) 0.5 µL
,引物
1.87 µL
,
Taq
酶
(5 U/µL) 0.2 µL
,
DNA
模板
(20 ng/µL)1.5 µL
,
ddH
2
O 18.43 µL
。扩增反应程序为
:94
℃预变性
5
min
,
94
℃变性
1 min
,
36
℃退火
1 min
,
72
℃延伸
90s
,共
42
个循环;
72
℃延伸
7 min
。在冰盒上加完
反应物后在微型离心机上微甩放入
PCR
仪中进行反
应,反应完成后取扩增产物
10 µL
点入含
EB
的
1.2%
的凝胶中电泳,然后在凝胶成像分析仪下观察并记
录结果。
3.2.3
数据处理
RAPD
扩增实验重复
2
次,统计所有能产生多态
性位点的引物在六个核桃品种母本和
F
1
代单株上扩
增的总带数和多态性条带数。在电泳图谱同一
RAPD
位点上有电泳带的记为
“1”
,无带的记为
“0”
,做
[0
、
1]
矩阵输入计算机,统计总带数,共有带,计算多态
性:多态性
=(
总带数
-
共有带
)/
总带数,采用
SPSS 16.0
软件进行分析,用欧式距离平方法计算遗传距离
(D)
,根据遗传距离采用非加权类平均法
(UPGMA
法
)
构建聚类分析图,对结果进行统计与分析。
作者贡献
叶春秀、牛建新是本研究的实验设计和实验研究执行
人;叶春秀完成实验操作及数据分析,论文初稿的写作;吕
建强、王林、李荣、张虎平参与实验设计,结果分析;牛建
新是项目的构思者及负责人,指导实验设计,数据分析,论
文写作与修改。全体作者都阅读并同意最终的文本。
致谢
本研究由国家自然科学基金
(30560090)
资助。作者感谢
实验室同学在实验中给予的帮助和建议,感谢石河子大学果
树生物技术实验室给予的技术支持。感谢同行评审人给予的
评审建议和修改意见。
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