叶春秀等
, 2011,
应用
RAPD
分析新疆六个核桃品种的遗传多样性
,
分子植物育种
Vol.9 No.43 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0043)
1329
来自于亲缘关系较近的早实父本或母本,这有待于
进一步研究,而且,通过对引物在母本和
F
1
代上扩
增条带的统计可以看出,在母本上出现的条带在子
代上并不是都出现,子代上有新的条带出现,这说
明核桃基因组是相对较保守的,但也存在着一定程
度上的差异,这可能是由于自然授粉产生了新的变
异,这将有利于得到较丰富的种质资源,对核桃育
种将是珍贵的资源。
2
讨论
对于核桃种质资源的分类国际上并没有比较
系统的方法和标准。目前认为核桃种群演化发展的
主要动力是种内个体间及种间的天然杂交和各种
生境下的自然与人为选择
(
吴燕民等
, 2000)
。一些学
者把我国的核桃栽培种分为新疆核桃、华北山地核
桃、秦巴核桃和西藏高地核桃。由此可以看出,新
疆核桃是其中较重要的资源之一。近年来,核桃产
业在新疆得到了较好的发展,成为创收的一部分产
业,但良种和无性系生产的不断扩大使资源遭受了
破坏,使得一些适应性较强的地方品种和野生种逐
渐被淘汰,呈现出单一化。为了改善这种单一化的
局面,对新疆核桃资源进行较全面的研究是比较重
要的,将有助于种质资源的保存于应用,对其进行
种质资源遗传多样性的研究将是核桃新品种选育
的理论基础。
遗传多样性是决定物种发生、进化、选择、重
组和创新的物质基础
(
解新明和云锦凤
, 2000)(
夏铭
,
1999)
。从分子遗传角度来看,表型的差异归根到底
是基因型和基因组的差异,对这些基因组序列差异
的比较研究为植物系统与进化研究提供了最直接
的依据
(
王红霞
, 2006)
。目前,在遗传多样性研究的
几种标记方法中,分子标记已经成为一种简便、可
靠的鉴定方法,广泛用于核桃遗传多样性的研究。
王宝庆采用
SSR
分子标记技术对四川西部的川毫
和知母群体进行遗传多样性的比较分析发现川毫
铁核桃群体的遗传丰富度高于知母核桃群体,与表
型多样性观察结果一致
(
王宝庆
, 2007)
。郭传友等
(2008)
采用
RAPD
分子标记技术对山核桃天然群体
进行遗传结构分析发现大部分的变异存在居群内,
居群间基因交流相对较少,并且地理隔离、居群内
近交及居群间有限的基因交流可能是形成山核桃
天然结构遗传结构的主要因素,研究结果符合山核
桃风媒、异交的繁育系统特点和实际分布情况。邹
雪梅采用
RAPD
对川西南高山峡谷区的核桃资源
(109
个样品
)
进行遗传多样性进行研究显示该分子
标记产物能够显示核桃丰富的遗传多样性,聚类分
析结果与地理区划基本符合
(
邹雪梅
, 2006)
。本实验
通过采用
RAPD
分子标记技术对新疆的
6
个地方品
种进行多样性的分析,最终可以将这六个核桃品种
的母本分为
3
类,品种
F
1
代可以明显地划分为距离
较远的两类,并且在
F
1
代之间存在着一定程度上的
基因交流,与母本也存在着差异,这将为保存和育
种提供一定的资源与信息。
3
材料和方法
3. 1
材料
实验材料为采自新疆轮台资源圃的母本材料
(
材料为当地农民自己嫁接
,
品种名为
:
轮
1,
轮
2,
轮
3,
轮
4,
轮
5,
轮
6)
和种植在石河子大学农学院实
验站
15
号网室的
F
1
代单株
(
约
190
株
)
,以叶片为试
材,春季待叶片展开后,对每个品种单株采新鲜嫩
叶,提取总
DNA
。研究所用的
CTAB
、
PVP
40
、
EDTA
、
Tris
碱、
Taq
DNA
聚合酶、
dNTPs
、琼脂糖等购自于
上海生物工程技术有限公司,随机引物由北京三博
远志生物有限责任公司合成,其它氯仿、乙醇、异
戊醇、异丙醇等试剂皆为国产分析纯试剂。
3.2
方法
3.2.1 DNA
的提取与测定
DNA
提取采用改良
CTAB
法,参照张虎平等
(2003) (Cheng et al., 2003) (Proberki et al., 1997)
的
方法并稍加改动,提取的
DNA
经
TE
稀释
100
倍,
用紫外分光光度计测定波长
260 nm
及
280 nm
处的
光吸收值
(OD
值
)
,确定
DNA
的纯度和浓度,最后
用
TE
稀释为
20 ng/µL
保存在-
20
℃备用。
3.2.2
引物筛选及
PCR
反应体系的确定
通过对张虎平
(2003)
、邹雪梅
(2006)
、杨恩
(2006)
已筛选出的
55
个随机引物进行再次筛选,选取扩增
稳定,重复性好的引物用于试验。
PCR
反应体系参照张虎平
(2003)
、邹雪梅
(2006)
的扩增体系,在试验了各种不同的扩增条件后,获
得了适合于实验的扩增反应体系和循环条件,反应
总体积为
25µL
,各成分如下:
10×Buffer (
含
Mg
2+
) 2.5