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刘淑君等
, 2011,
植物
MYB
转录因子的研究进展
,
分子植物育种
(online) Vol.9 No.114 pp.1835-1842 (doi: 10.5376/mpb. cn.2011.09.0114)
1836
物生长中的信号转导、次级代谢的调控、生物和非
生物胁迫的应答以及细胞周期的调控等等。由此可
见,
MYB
转录因子在植物的生长发育中扮演了重
要角色。
1 MYB
转录因子结构和分类
1.1 MYB
转录因子的结构特征
MYB
转录因子是指含有
MYB
基序的一类转录
因子,
MYB
基序约含
51
52
个氨基酸残基,其
中有三个保守的色氨酸残基,它们被
18
19
个氨
基酸残基序列所间隔。通常
MYB
基序形成三段螺
旋结构,且在第二段和第三段螺旋之间折转成一定
的 角 度 相 连 接 , 形 成 了 螺 旋
-
转 角
-
螺 旋
(helix-turn-helix, HTH)
结构
(Dubos et al., 2010)
,构
成了一个疏水核心,色氨酸对这个
HTH
结构有着
特别重要的意义。目前,第一个螺旋还没有明确的
结构意义,而第二个螺旋同
DNA
的磷酸骨架相接触,
稳固了与
DNA
的结合,第三个螺旋为识别螺旋,通
过氨基酸侧链以及
DNA
碱基之间的氢键同
DNA
列相识别
(Ogata et al., 1996;
王希庆等
, 2003)
原始的
MYB
基序通过自身的复制,产生了含
2
3
MYB
基序的
MYB
转录因子。为了更
好的协调与
DNA
结合的准确性,每个
MYB
基序
折叠成
HTH
形式,与
DNA
的大沟结合,而多个重
复的
MYB
基序会在与
DNA
结合处相互靠近,紧
密连接
(Weaver, 1999)
1.2 MYB
转录因子的分类
1987
年,
Martin
等人在玉米的糊粉粒中发现第
一个植物
MYB
转录因子
c-myb,
它参与花青素的
合成
(Marhamati et al., 1997)
。而后研究表明,
MYB
转录因子普遍存在于植物中,且在转录调节中起着
重要作用。以
c-MYB
为标准,将
MYB
基序分为
R1
R2
R3
三类
(Haga et al., 2007; Ogata et al., 1995;
Jia et al., 2004)
;另外,依据
MYB
基序重复种类和
数目的不同,将整个
MYB
转录因子家族分为四类
(Dubos et al., 2010)
4R-MYB
3R-MYB
1R-MYB/MYB-related
R2R3-MYB (
如图
1)
第一类是
4R-MYB
,由
4
R1/R2
重复组成,
它是植物
MYB
转录因子中最小的一类,仅在拟南
芥、杨树、葡萄
(Ito, 2005; Wilkins et al., 2009; Matus
et al., 2008)
中有所发现,且编码的蛋白质很少。
第二类是
3R-MYB (R1R2R3-MYB)
,由
R1
R2
R3
组成,普遍存在于大多数的真核生物中。
烟草中编码的
NtmybA1
NtmybA2
NtmybB
NtmybC1
NtmybC2
五个基因均属于此类转录因
(Jiang et al., 2004)
1
植物
MYB
转录因子的分类
(Dubos et al., 2010)
: I
MYB
基序的二级结构
;
螺旋
-
转角
-
螺旋
;
螺旋;转
角;
II:
四类
MYB
转录因子
: II1: R2R3-MYB; II2:
1R-MYB/MYB-related; II3: 3R-MYB, II4: 4R-MYB
Figure 1 Plant MYB transcription factor classes (Dubos et al.,
2010)
Note: I: MYB secondary structure: helix-turn-helix; H: helix; T:
turn; II: Four classes MYB transcription factor: II1:
R2R3-MYB; II2: 1R-MYB/MYB-related; II3: 3R-MYB, II4:
4R-MYB
第三类是
1R-MYB/MYB-related
,指含有单个
重复的或不完整的
MYB
基序,此类又可以分为
R1/R2-MYB
R3-MYB
MYB-related
三类。拟南
芥中
CCA1
LHY
属于
R1/R2-myb
类转录因子
,
由两个基因编码,参与生物钟的调节、光合作用基
因的表达以及激素的积累
(Carre et al., 2002)
;而后
鉴定的
CPC
属于
R3-MYB
类转录因子,与根毛的
形成有关
(Ohi et al., 1998)
。此外,研究发现
R3-MYB
很有可能是由于
R2R3-MYB
类转录因子中
R2
的缺
失而形成的
(Lipsick, 1996)
,此类转录因子大多数与
细胞形态的建成以及次级代谢的调节有关。
第四类是
R2R3-MYB
,为植物
MYB
转录因子
中最大的一类,几乎存在于所有的植物中。在模式
植物拟南芥中,
R2R3-MYB
类转录因子数目约占整
MYB
家族的
64.3% (
刘翔等
, 2010)
R2R3-MYB
类转录因子不仅数目众多,而且功能具有多样化。
目前,在
R2R3-MYB
类转录因子中,
N
末端为
DNA
结合区域,
C
末端为转录调控区域
(Dubos et al.,
2010)
DNA
结合区域的氨基酸序列比较保守,决
定了转录因子与
DNA
结合的特异性;转录调控区
域包括转录激活区和转录抑制区,而有的转录因子