刘淑君等
            
            
              , 2011,
            
            
              植物
            
            
              MYB
            
            
              转录因子的研究进展
            
            
              ,
            
            
              分子植物育种
            
            
              (online) Vol.9 No.114 pp.1835-1842 (doi: 10.5376/mpb. cn.2011.09.0114)
            
            
              1836
            
            
              物生长中的信号转导、次级代谢的调控、生物和非
            
            
              生物胁迫的应答以及细胞周期的调控等等。由此可
            
            
              见,
            
            
              MYB
            
            
              转录因子在植物的生长发育中扮演了重
            
            
              要角色。
            
            
              
                1 MYB
              
            
            
              转录因子结构和分类
            
            
              
                1.1 MYB
              
            
            
              转录因子的结构特征
            
            
              MYB
            
            
              转录因子是指含有
            
            
              MYB
            
            
              基序的一类转录
            
            
              因子,
            
            
              MYB
            
            
              基序约含
            
            
              51
            
            
              或
            
            
              52
            
            
              个氨基酸残基,其
            
            
              中有三个保守的色氨酸残基,它们被
            
            
              18
            
            
              或
            
            
              19
            
            
              个氨
            
            
              基酸残基序列所间隔。通常
            
            
              MYB
            
            
              基序形成三段螺
            
            
              旋结构,且在第二段和第三段螺旋之间折转成一定
            
            
              的 角 度 相 连 接 , 形 成 了 螺 旋
            
            
              -
            
            
              转 角
            
            
              -
            
            
              螺 旋
            
            
              (helix-turn-helix, HTH)
            
            
              结构
            
            
              (Dubos et al., 2010)
            
            
              ,构
            
            
              成了一个疏水核心,色氨酸对这个
            
            
              HTH
            
            
              结构有着
            
            
              特别重要的意义。目前,第一个螺旋还没有明确的
            
            
              结构意义,而第二个螺旋同
            
            
              DNA
            
            
              的磷酸骨架相接触,
            
            
              稳固了与
            
            
              DNA
            
            
              的结合,第三个螺旋为识别螺旋,通
            
            
              过氨基酸侧链以及
            
            
              DNA
            
            
              碱基之间的氢键同
            
            
              DNA
            
            
              序
            
            
              列相识别
            
            
              (Ogata et al., 1996;
            
            
              王希庆等
            
            
              , 2003)
            
            
              。
            
            
              原始的
            
            
              MYB
            
            
              基序通过自身的复制,产生了含
            
            
              有
            
            
              2
            
            
              或
            
            
              3
            
            
              个
            
            
              MYB
            
            
              基序的
            
            
              MYB
            
            
              转录因子。为了更
            
            
              好的协调与
            
            
              DNA
            
            
              结合的准确性,每个
            
            
              MYB
            
            
              基序
            
            
              折叠成
            
            
              HTH
            
            
              形式,与
            
            
              DNA
            
            
              的大沟结合,而多个重
            
            
              复的
            
            
              MYB
            
            
              基序会在与
            
            
              DNA
            
            
              结合处相互靠近,紧
            
            
              密连接
            
            
              (Weaver, 1999)
            
            
              。
            
            
              
                1.2 MYB
              
            
            
              转录因子的分类
            
            
              1987
            
            
              年,
            
            
              Martin
            
            
              等人在玉米的糊粉粒中发现第
            
            
              一个植物
            
            
              MYB
            
            
              转录因子
            
            
              —
            
            
              c-myb,
            
            
              它参与花青素的
            
            
              合成
            
            
              (Marhamati et al., 1997)
            
            
              。而后研究表明,
            
            
              MYB
            
            
              转录因子普遍存在于植物中,且在转录调节中起着
            
            
              重要作用。以
            
            
              c-MYB
            
            
              为标准,将
            
            
              MYB
            
            
              基序分为
            
            
              R1
            
            
              、
            
            
              R2
            
            
              、
            
            
              R3
            
            
              三类
            
            
              (Haga et al., 2007; Ogata et al., 1995;
            
            
              Jia et al., 2004)
            
            
              ;另外,依据
            
            
              MYB
            
            
              基序重复种类和
            
            
              数目的不同,将整个
            
            
              MYB
            
            
              转录因子家族分为四类
            
            
              (Dubos et al., 2010)
            
            
              —
            
            
              4R-MYB
            
            
              、
            
            
              3R-MYB
            
            
              、
            
            
              1R-MYB/MYB-related
            
            
              、
            
            
              R2R3-MYB (
            
            
              如图
            
            
              1)
            
            
              。
            
            
              第一类是
            
            
              4R-MYB
            
            
              ,由
            
            
              4
            
            
              个
            
            
              R1/R2
            
            
              重复组成,
            
            
              它是植物
            
            
              MYB
            
            
              转录因子中最小的一类,仅在拟南
            
            
              芥、杨树、葡萄
            
            
              (Ito, 2005; Wilkins et al., 2009; Matus
            
            
              et al., 2008)
            
            
              中有所发现,且编码的蛋白质很少。
            
            
              第二类是
            
            
              3R-MYB (R1R2R3-MYB)
            
            
              ,由
            
            
              R1
            
            
              、
            
            
              R2
            
            
              、
            
            
              R3
            
            
              组成,普遍存在于大多数的真核生物中。
            
            
              烟草中编码的
            
            
              NtmybA1
            
            
              、
            
            
              NtmybA2
            
            
              、
            
            
              NtmybB
            
            
              、
            
            
              NtmybC1
            
            
              和
            
            
              NtmybC2
            
            
              五个基因均属于此类转录因
            
            
              子
            
            
              (Jiang et al., 2004)
            
            
              。
            
            
              图
            
            
              1
            
            
              植物
            
            
              MYB
            
            
              转录因子的分类
            
            
              (Dubos et al., 2010)
            
            
              注
            
            
              : I
            
            
              :
            
            
              MYB
            
            
              基序的二级结构
            
            
              ;
            
            
              螺旋
            
            
              -
            
            
              转角
            
            
              -
            
            
              螺旋
            
            
              ;
            
            
              螺旋;转
            
            
              角;
            
            
              II:
            
            
              四类
            
            
              MYB
            
            
              转录因子
            
            
              : II1: R2R3-MYB; II2:
            
            
              1R-MYB/MYB-related; II3: 3R-MYB, II4: 4R-MYB
            
            
              Figure 1 Plant MYB transcription factor classes (Dubos et al.,
            
            
              2010)
            
            
              Note: I: MYB secondary structure: helix-turn-helix; H: helix; T:
            
            
              turn; II: Four classes MYB transcription factor: II1:
            
            
              R2R3-MYB; II2: 1R-MYB/MYB-related; II3: 3R-MYB, II4:
            
            
              4R-MYB
            
            
              第三类是
            
            
              1R-MYB/MYB-related
            
            
              ,指含有单个
            
            
              重复的或不完整的
            
            
              MYB
            
            
              基序,此类又可以分为
            
            
              R1/R2-MYB
            
            
              、
            
            
              R3-MYB
            
            
              、
            
            
              MYB-related
            
            
              三类。拟南
            
            
              芥中
            
            
              CCA1
            
            
              和
            
            
              LHY
            
            
              属于
            
            
              R1/R2-myb
            
            
              类转录因子
            
            
              ,
            
            
              由两个基因编码,参与生物钟的调节、光合作用基
            
            
              因的表达以及激素的积累
            
            
              (Carre et al., 2002)
            
            
              ;而后
            
            
              鉴定的
            
            
              CPC
            
            
              属于
            
            
              R3-MYB
            
            
              类转录因子,与根毛的
            
            
              形成有关
            
            
              (Ohi et al., 1998)
            
            
              。此外,研究发现
            
            
              R3-MYB
            
            
              很有可能是由于
            
            
              R2R3-MYB
            
            
              类转录因子中
            
            
              R2
            
            
              的缺
            
            
              失而形成的
            
            
              (Lipsick, 1996)
            
            
              ,此类转录因子大多数与
            
            
              细胞形态的建成以及次级代谢的调节有关。
            
            
              第四类是
            
            
              R2R3-MYB
            
            
              ,为植物
            
            
              MYB
            
            
              转录因子
            
            
              中最大的一类,几乎存在于所有的植物中。在模式
            
            
              植物拟南芥中,
            
            
              R2R3-MYB
            
            
              类转录因子数目约占整
            
            
              个
            
            
              MYB
            
            
              家族的
            
            
              64.3% (
            
            
              刘翔等
            
            
              , 2010)
            
            
              。
            
            
              R2R3-MYB
            
            
              类转录因子不仅数目众多,而且功能具有多样化。
            
            
              目前,在
            
            
              R2R3-MYB
            
            
              类转录因子中,
            
            
              N
            
            
              末端为
            
            
              DNA
            
            
              结合区域,
            
            
              C
            
            
              末端为转录调控区域
            
            
              (Dubos et al.,
            
            
              2010)
            
            
              。
            
            
              DNA
            
            
              结合区域的氨基酸序列比较保守,决
            
            
              定了转录因子与
            
            
              DNA
            
            
              结合的特异性;转录调控区
            
            
              域包括转录激活区和转录抑制区,而有的转录因子